RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 RDH5Q92781 318 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 TIMD4Q96H15 378 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 CEP19Q96LK0 163 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 CACNG6Q9BXT2 260 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 LIN7BQ9HAP6 207 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 SPACA1Q9HBV2 294 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 GCM1Q9NP62 436 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa7.89□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 CDIPTO14735 213 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 NDUFA2O43678 99 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 APOA1P02647 267 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 CLEC2LP0C7M8 214 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 PGA5P0DJD9 388 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 TALDO1P37837 337 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 ART1P52961 327 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 TMEM33P57088 247 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 OR10A3P58181 314 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 DSCR9P59020 149 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 CNPY1Q3B7I2 92 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 C2orf76Q3KRA6 126 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 UBE2NLQ5JXB2 153 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 HES5Q5TA89 166 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 ZNF787Q6DD87 383 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 WDR82Q6UXN9 313 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 CALHM1Q8IU99 346 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 POC1AQ8NBT0 407 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 OR4D6Q8NGJ1 314 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 IGFBPL1Q8WX77 278 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 NINJ1Q92982 152 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 SLC25A28Q96A46 364 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 GFI1Q99684 422 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 NRIP2Q9BQI9 281 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 DIABLOQ9NR28 239 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 C1orf123Q9NWV4 160 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 PTPN13Q12923 2485 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 CACNA1DQ01668 2161 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 A0A1W2PPR1 153 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 TMEM14DPA8MWL7 114 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 SRRM5B3KS81 715 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 CLPXO76031 633 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 NCR1O76036 304 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 NXPH2O95156 264 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 HTR3BO95264 441 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 LHBP01229 141 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 GLAP06280 429 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 GLRA1P23415 457 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 DNASE1P24855 282 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 TGFBR1P36897 503 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 OR3A4PP47883 348 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 FGF12P61328 243 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 ERVK11-1P61568 191 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 IL13RA2Q14627 380 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 MICBQ29980 383 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 MPV17LQ2QL34 196 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 SLC22A6Q4U2R8 563 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 WDR86Q86TI4 376 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 MOGAT3Q86VF5 341 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 NR2C2APQ86WQ0 139 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 C11orf53Q8IXP5 236 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 FAM58AQ8N1B3 248 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 OSR2Q8N2R0 312 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 CHST4Q8NCG5 386 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 OR51D1Q8NGF3 324 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 OR56B1Q8NGI3 324 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 OR51T1Q8NGJ9 327 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 LRRC29Q8WV35 223 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 RAB1CQ92928 201 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 SPACA5Q96QH8 159 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 TMEM59Q9BXS4 323 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 BARHL1Q9BZE3 327 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 DNTTIP1Q9H147 329 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 ABCG5Q9H222 651 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 CHODLQ9H9P2 273 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 HES4Q9HCC6 221 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 TMEM106BQ9NUM4 274 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 UFSP2Q9NUQ7 469 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 MTCH1Q9NZJ7 389 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 PPIAL4EA0A075B759 164 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 POM121CA8CG34 1229 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-220ENST00000550700 CLDN25C9JDP6 229 aa7.86□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.9 ms