RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532308.5

TSTA3-215, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 5

Gene TSTA3, Length 951 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-215ENST00000532308 RASL12Q9NYN1 266 aa17.23■□□□□ 0.35
TSTA3-215ENST00000532308 ABRACLQ9P1F3 81 aa17.23■□□□□ 0.35
TSTA3-215ENST00000532308 MAST4O15021 2626 aa17.22■□□□□ 0.35
TSTA3-215ENST00000532308 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa17.22■□□□□ 0.35
TSTA3-215ENST00000532308 AKR7A2O43488 359 aa17.22■□□□□ 0.35
TSTA3-215ENST00000532308 IGKV1D-12P01611 117 aa17.22■□□□□ 0.35
TSTA3-215ENST00000532308 COL8A2P25067 703 aa17.22■□□□□ 0.35
TSTA3-215ENST00000532308 SCAND1P57086 179 aa17.22■□□□□ 0.35
TSTA3-215ENST00000532308 C2orf76Q3KRA6 126 aa17.22■□□□□ 0.35
TSTA3-215ENST00000532308 ACOT12Q8WYK0 555 aa17.22■□□□□ 0.35
TSTA3-215ENST00000532308 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa17.22■□□□□ 0.35
TSTA3-215ENST00000532308 SRRM5B3KS81 715 aa17.21■□□□□ 0.35
TSTA3-215ENST00000532308 TMEM178BH3BS89 294 aa17.21■□□□□ 0.35
TSTA3-215ENST00000532308 NDUFS7O75251 213 aa17.21■□□□□ 0.35
TSTA3-215ENST00000532308 HTR3BO95264 441 aa17.21■□□□□ 0.35
TSTA3-215ENST00000532308 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP17.21■□□□□ 0.35
TSTA3-215ENST00000532308 LHBP01229 141 aa17.21■□□□□ 0.35
TSTA3-215ENST00000532308 BCL3P20749 454 aa17.21■□□□□ 0.35
TSTA3-215ENST00000532308 GLRA1P23415 457 aa17.21■□□□□ 0.35
TSTA3-215ENST00000532308 PTH2RP49190 550 aa17.21■□□□□ 0.35
TSTA3-215ENST00000532308 ATP5J2P56134 94 aa17.21■□□□□ 0.35
TSTA3-215ENST00000532308 ERVK11-1P61568 191 aa17.21■□□□□ 0.35
TSTA3-215ENST00000532308 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP17.21■□□□□ 0.35
TSTA3-215ENST00000532308 SLC22A6Q4U2R8 563 aa17.21■□□□□ 0.35
TSTA3-215ENST00000532308 MZT2AQ6P582 158 aa17.21■□□□□ 0.35
TSTA3-215ENST00000532308 OR2W3Q7Z3T1 314 aa17.21■□□□□ 0.35
TSTA3-215ENST00000532308 GCSAMQ8N6F7 178 aa17.21■□□□□ 0.35
TSTA3-215ENST00000532308 KCNG3Q8TAE7 436 aa17.21■□□□□ 0.35
TSTA3-215ENST00000532308 NINJ1Q92982 152 aa17.21■□□□□ 0.35
TSTA3-215ENST00000532308 YIPF5Q969M3 257 aa17.21■□□□□ 0.35
TSTA3-215ENST00000532308 NRIP2Q9BQI9 281 aa17.21■□□□□ 0.35
TSTA3-215ENST00000532308 GSX2Q9BZM3 304 aa17.21■□□□□ 0.35
TSTA3-215ENST00000532308 CST11Q9H112 138 aa17.21■□□□□ 0.35
TSTA3-215ENST00000532308 NPTNQ9Y639 398 aa17.21■□□□□ 0.35
TSTA3-215ENST00000532308 CACNG2Q9Y698 323 aa17.21■□□□□ 0.35
TSTA3-215ENST00000532308 DCHS2Q6V1P9 2916 aa17.2■□□□□ 0.34
TSTA3-215ENST00000532308 AKAP6Q13023 2319 aa17.2■□□□□ 0.34
TSTA3-215ENST00000532308 LY6HO94772 140 aa17.2■□□□□ 0.34
TSTA3-215ENST00000532308 NXPH2O95156 264 aa17.2■□□□□ 0.34
TSTA3-215ENST00000532308 IGHV4-39P01824 125 aa17.2■□□□□ 0.34
TSTA3-215ENST00000532308 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP17.2■□□□□ 0.34
TSTA3-215ENST00000532308 SERPINA2P20848 420 aa17.2■□□□□ 0.34
TSTA3-215ENST00000532308 NPBWR2P48146 333 aa17.2■□□□□ 0.34
TSTA3-215ENST00000532308 ELP2Q6IA86 826 aa17.2■□□□□ 0.34
TSTA3-215ENST00000532308 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa17.2■□□□□ 0.34
TSTA3-215ENST00000532308 FAM58AQ8N1B3 248 aa17.2■□□□□ 0.34
TSTA3-215ENST00000532308 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP17.2■□□□□ 0.34
TSTA3-215ENST00000532308 Q8NFD4 153 aa17.2■□□□□ 0.34
TSTA3-215ENST00000532308 OR10K1Q8NGX5 313 aa17.2■□□□□ 0.34
TSTA3-215ENST00000532308 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP17.2■□□□□ 0.34
TSTA3-215ENST00000532308 LURAP1Q96LR2 239 aa17.2■□□□□ 0.34
TSTA3-215ENST00000532308 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP17.2■□□□□ 0.34
TSTA3-215ENST00000532308 ZNF488Q96MN9 340 aa17.2■□□□□ 0.34
TSTA3-215ENST00000532308 CHODLQ9H9P2 273 aa17.2■□□□□ 0.34
TSTA3-215ENST00000532308 OR5V1Q9UGF6 321 aa17.2■□□□□ 0.34
TSTA3-215ENST00000532308 LRBAP50851 2863 aa17.2■□□□□ 0.34
TSTA3-215ENST00000532308 USF3Q68DE3 2245 aa17.19■□□□□ 0.34
TSTA3-215ENST00000532308 A0A0B4J203 849 aa17.19■□□□□ 0.34
TSTA3-215ENST00000532308 CLDN25C9JDP6 229 aa17.19■□□□□ 0.34
TSTA3-215ENST00000532308 LYNX1G3V0Z9 82 aa17.19■□□□□ 0.34
TSTA3-215ENST00000532308 RP2O75695 350 aa17.19■□□□□ 0.34
TSTA3-215ENST00000532308 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
TSTA3-215ENST00000532308 SFTPBP07988 381 aa17.19■□□□□ 0.34
TSTA3-215ENST00000532308 LYNX1P0DP58 116 aa17.19■□□□□ 0.34
TSTA3-215ENST00000532308 VSIG8P0DPA2 414 aa17.19■□□□□ 0.34
TSTA3-215ENST00000532308 GTF2F2P13984 249 aa17.19■□□□□ 0.34
TSTA3-215ENST00000532308 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
TSTA3-215ENST00000532308 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
TSTA3-215ENST00000532308 OSR2Q8N2R0 312 aa17.19■□□□□ 0.34
TSTA3-215ENST00000532308 MBD6Q96DN6 1003 aa17.19■□□□□ 0.34
TSTA3-215ENST00000532308 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
TSTA3-215ENST00000532308 HES4Q9HCC6 221 aa17.19■□□□□ 0.34
TSTA3-215ENST00000532308 FBLN5Q9UBX5 448 aa17.19■□□□□ 0.34
TSTA3-215ENST00000532308 SPATA2Q9UM82 520 aa17.19■□□□□ 0.34
TSTA3-215ENST00000532308 ETV7Q9Y603 341 aa17.19■□□□□ 0.34
TSTA3-215ENST00000532308 PPIAL4EA0A075B759 164 aa17.18■□□□□ 0.34
TSTA3-215ENST00000532308 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa17.18■□□□□ 0.34
TSTA3-215ENST00000532308 TMEM14DPA8MWL7 114 aa17.18■□□□□ 0.34
TSTA3-215ENST00000532308 PPIAL4DF5H284 164 aa17.18■□□□□ 0.34
TSTA3-215ENST00000532308 SSX4O60224 188 aa17.18■□□□□ 0.34
TSTA3-215ENST00000532308 PAHP00439 452 aa17.18■□□□□ 0.34
TSTA3-215ENST00000532308 PPIAL4FP0DN26 164 aa17.18■□□□□ 0.34
TSTA3-215ENST00000532308 PRKACAP17612 351 aa17.18■□□□□ 0.34
TSTA3-215ENST00000532308 PDLIM4P50479 330 aa17.18■□□□□ 0.34
TSTA3-215ENST00000532308 TMEM33P57088 247 aa17.18■□□□□ 0.34
TSTA3-215ENST00000532308 GMFBP60983 142 aa17.18■□□□□ 0.34
TSTA3-215ENST00000532308 FGF12P61328 243 aa17.18■□□□□ 0.34
TSTA3-215ENST00000532308 QRFPP83859 136 aa17.18■□□□□ 0.34
TSTA3-215ENST00000532308 DEFB113Q30KQ7 82 aa17.18■□□□□ 0.34
TSTA3-215ENST00000532308 CNPY1Q3B7I2 92 aa17.18■□□□□ 0.34
TSTA3-215ENST00000532308 SMIM21Q3B7S5 101 aa17.18■□□□□ 0.34
TSTA3-215ENST00000532308 ACP7Q6ZNF0 438 aa17.18■□□□□ 0.34
TSTA3-215ENST00000532308 CDH24Q86UP0 819 aa17.18■□□□□ 0.34
TSTA3-215ENST00000532308 FAM90A1Q86YD7 464 aa17.18■□□□□ 0.34
TSTA3-215ENST00000532308 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa17.18■□□□□ 0.34
TSTA3-215ENST00000532308 BATF2Q8N1L9 274 aa17.18■□□□□ 0.34
TSTA3-215ENST00000532308 PTX4Q96A99 478 aa17.18■□□□□ 0.34
TSTA3-215ENST00000532308 PERPQ96FX8 193 aa17.18■□□□□ 0.34
TSTA3-215ENST00000532308 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
TSTA3-215ENST00000532308 HMG20AQ9NP66 347 aa17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.6 ms