RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516272.1

RNU6-277P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 277, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-277P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-277P-201ENST00000516272 OR9G4Q8NGQ1 327 aa-0.19□□□□□ -2.44
RNU6-277P-201ENST00000516272 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP-0.19□□□□□ -2.44
RNU6-277P-201ENST00000516272 APH1AQ96BI3 265 aa-0.19□□□□□ -2.44
RNU6-277P-201ENST00000516272 PYURFQ96I23 114 aa-0.19□□□□□ -2.44
RNU6-277P-201ENST00000516272 PXMP2Q9NR77 195 aa-0.19□□□□□ -2.44
RNU6-277P-201ENST00000516272 TREX1Q9NSU2 369 aa-0.19□□□□□ -2.44
RNU6-277P-201ENST00000516272 CLN6Q9NWW5 311 aa-0.19□□□□□ -2.44
RNU6-277P-201ENST00000516272 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa-0.19□□□□□ -2.44
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa-0.19□□□□□ -2.44
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP-0.19□□□□□ -2.44
RNU6-277P-201ENST00000516272 MIA3Q5JRA6 1907 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-277P-201ENST00000516272 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-277P-201ENST00000516272 A0A075B6Q4 140 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-277P-201ENST00000516272 OR12D1P0DN82 309 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-277P-201ENST00000516272 MAGEA1P43355 309 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-277P-201ENST00000516272 RPS15P62841 145 aaKnown RBP-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-277P-201ENST00000516272 TTMPQ5BVD1 217 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM231DQ6ZW35 169 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF555Q8NEP9 628 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-277P-201ENST00000516272 OR8J1Q8NGP2 316 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-277P-201ENST00000516272 ASZ1Q8WWH4 475 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-277P-201ENST00000516272 RAB1CQ92928 201 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-277P-201ENST00000516272 GPR21Q99679 349 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-277P-201ENST00000516272 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-277P-201ENST00000516272 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-277P-201ENST00000516272 SRRQ9GZT4 340 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-277P-201ENST00000516272 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-277P-201ENST00000516272 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-277P-201ENST00000516272 SERPINB8P50452 374 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-277P-201ENST00000516272 RAB10P61026 200 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMEM241Q24JQ0 296 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-277P-201ENST00000516272 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-277P-201ENST00000516272 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-277P-201ENST00000516272 OR2K2Q8NGT1 345 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-277P-201ENST00000516272 GPR22Q99680 433 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMEM175Q9BSA9 504 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-277P-201ENST00000516272 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-277P-201ENST00000516272 ACP6Q9NPH0 428 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-277P-201ENST00000516272 PRSS16Q9NQE7 514 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-277P-201ENST00000516272 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-277P-201ENST00000516272 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZBTB5O15062 677 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-277P-201ENST00000516272 OR2A4O95047 310 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-277P-201ENST00000516272 GLRA2P23416 452 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-277P-201ENST00000516272 UBE2HP62256 183 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-277P-201ENST00000516272 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-277P-201ENST00000516272 TFDP2Q14188 446 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-277P-201ENST00000516272 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-277P-201ENST00000516272 LINC00303Q3SY05 128 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-277P-201ENST00000516272 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-277P-201ENST00000516272 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-277P-201ENST00000516272 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM58AQ8N1B3 248 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-277P-201ENST00000516272 UBE2J2Q8N2K1 259 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-277P-201ENST00000516272 OR10P1Q8NGE3 313 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-277P-201ENST00000516272 SMARCD1Q96GM5 515 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM19A4Q96LR4 140 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-277P-201ENST00000516272 OR2A7Q96R45 310 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-277P-201ENST00000516272 CENPKQ9BS16 269 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-277P-201ENST00000516272 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMEM165Q9HC07 324 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-277P-201ENST00000516272 BABAM2Q9NXR7 383 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-277P-201ENST00000516272 PISDQ9UG56 409 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-277P-201ENST00000516272 FREM1Q5H8C1 2179 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-277P-201ENST00000516272 TSPAN11A1L157 253 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-277P-201ENST00000516272 SMCO3A2RU48 225 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-277P-201ENST00000516272 SH2D1AO60880 128 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-277P-201ENST00000516272 GTF2F2P13984 249 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-277P-201ENST00000516272 RFC3P40938 356 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-277P-201ENST00000516272 PSMB2P49721 201 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-277P-201ENST00000516272 OR2B8PP59922 312 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-277P-201ENST00000516272 IRF8Q02556 426 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-277P-201ENST00000516272 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-277P-201ENST00000516272 SPESP1Q6UW49 350 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-277P-201ENST00000516272 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM184AQ8NB25 1140 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-277P-201ENST00000516272 OR7G2Q8NG99 324 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-277P-201ENST00000516272 OR52M1Q8NGK5 317 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-277P-201ENST00000516272 ACMSDQ8TDX5 336 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZYG11BQ9C0D3 744 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-277P-201ENST00000516272 PTTG3PQ9NZH4 202 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-277P-201ENST00000516272 FBXL3Q9UKT7 428 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-277P-201ENST00000516272 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-277P-201ENST00000516272 LINC01619G3V211 115 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-277P-201ENST00000516272 UPK1BO75841 260 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-277P-201ENST00000516272 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-277P-201ENST00000516272 PAX6P26367 422 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-277P-201ENST00000516272 INPP1P49441 399 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-277P-201ENST00000516272 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-277P-201ENST00000516272 TPRXLQ17RH7 258 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-277P-201ENST00000516272 PRNTQ86SH4 94 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-277P-201ENST00000516272 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-277P-201ENST00000516272 OR9K2Q8NGE7 335 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-277P-201ENST00000516272 OR56B2PQ8NGI1 322 aa-0.24□□□□□ -2.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.8 ms