RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514360.5

BTF3-208, Transcript of basic transcription factor 3, human

TSL 2

Gene BTF3, Length 1,177 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BTF3-208	ENST00000514360	SGK3	Q96BR1	496 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	REEP6	Q96HR9	211 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	PGAM5	Q96HS1	289 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	OR8B4	Q96RC9	309 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	RIBC2	Q9H4K1	309 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	MED20	Q9H944	212 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	FN3KRP	Q9HA64	309 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	INPP5E	Q9NRR6	644 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	TMEM106B	Q9NUM4	274 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	PTTG3P	Q9NZH4	202 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	KCNS2	Q9ULS6	477 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	FZR1	Q9UM11	496 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	PPP1R3C	Q9UQK1	317 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	RPL36	Q9Y3U8	105 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	GMPPB	Q9Y5P6	360 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	SNX5	Q9Y5X3	404 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	NPTN	Q9Y639	398 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	HECTD1	Q9ULT8	2610 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	PTPN13	Q12923	2485 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	MPDZ	O75970	2070 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	UNC79	Q9P2D8	2635 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	hCG_38984	A0A1B0GV85	526 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	MAGEA13P	A6NCF6	341 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	CCDC182	A6NF36	153 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	METTL15	A6NJ78	407 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	TMEM210	A6NLX4	147 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360		H0YAE9	185 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	TMEM178B	H3BS89	294 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360		J3QLI3	93 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	SELENOF	O60613	162 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	LMX1B	O60663	402 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	CRLF1	O75462	422 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	FOXH1	O75593	365 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	FADS2	O95864	444 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	IGHV4-31	P0DP07	118 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	POLR2I	P36954	125 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	MDH2	P40926	338 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	NAA10	P41227	235 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	RPS27	P42677	84 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	HSPA13	P48723	471 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	NPY4R	P50391	375 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	CXCR4	P61073	352 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	ACTA2	P62736	377 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	ACTG2	P63267	376 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	FAM3A	P98173	230 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	RAB40B	Q12829	278 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	MED21	Q13503	144 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	OR8G1	Q15617	311 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	SNAI3	Q3KNW1	292 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	ALKBH6	Q3KRA9	238 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	FAM76B	Q5HYJ3	339 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	GLYATL3	Q5SZD4	288 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	C6orf52	Q5T4I8	152 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	ZNF322	Q6U7Q0	402 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360		Q6ZR03	302 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	SLC16A12	Q6ZSM3	486 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360		Q6ZSR3	168 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	SLC35F2	Q8IXU6	374 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	NRAC	Q8N912	160 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	OR5A2	Q8NGI9	324 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	OR8S1	Q8NH09	359 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	RHOXF1	Q8NHV9	184 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	FAM81A	Q8TBF8	368 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	YIPF5	Q969M3	257 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	SLC25A28	Q96A46	364 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	TMEM18	Q96B42	140 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	TECTB	Q96PL2	329 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	OR2V2	Q96R30	315 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	CHCHD6	Q9BRQ6	235 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	ANKRD60	Q9BZ19	345 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	ZNF696	Q9H7X3	374 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	ADGRL4	Q9HBW9	690 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	BATF3	Q9NR55	127 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	FAM118A	Q9NWS6	357 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	SMPD3	Q9NY59	655 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	MIOX	Q9UGB7	285 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	NUFIP1	Q9UHK0	495 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	EXOG	Q9Y2C4	368 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	WIPI2	Q9Y4P8	454 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	LRP12	Q9Y561	859 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	FREM1	Q5H8C1	2179 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	FLNB	O75369	2602 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	TRAV38-1	A0A0B4J264	116 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	IGHV4-61	A0A0C4DH41	118 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	ZNF816-ZNF321P	A0A0X1KG74	233 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360		A0A1W2PQL4	384 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	DAPL1	A0PJW8	107 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	TRIM64C	A6NLI5	447 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	LOC110117498-PIK3R3	F6TDL0	507 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	DHRS3	O75911	302 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	LY6H	O94772	140 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	SCGB1D1	O95968	90 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	SERPINA3	P01011	423 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	TGFA	P01135	160 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	IGLV3-1	P01715	115 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	ISG15	P05161	165 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	LIPF	P07098	398 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BTF3-208	ENST00000514360	MSMB	P08118	114 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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