RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM216AQ8WUB2 273 aa15.39■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 FGGYQ96C11 551 aa15.39■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 SDSLQ96GA7 329 aa15.39■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 JMJD8Q96S16 334 aa15.39■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa15.39■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 PKIBQ9C010 78 aa15.39■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 MTCH1Q9NZJ7 389 aa15.39■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 OR14J1Q9UGF5 321 aa15.39■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa15.39■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 ZFPL1O95159 310 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 LIPFP07098 398 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF20P17024 532 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 ETV1P50549 477 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 CAV3P56539 151 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 IL24Q13007 206 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 BAMBIQ13145 260 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 PACRGLQ8N7B6 248 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 OR13C3Q8NGS6 347 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 RFT1Q96AA3 541 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 SPACA5Q96QH8 159 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 CNTD2Q9H8S5 307 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 INPP5EQ9NRR6 644 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 C19orf12Q9NSK7 152 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 RASL12Q9NYN1 266 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 HHLA2Q9UM44 414 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC7A11Q9UPY5 501 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 POU3F4P49335 361 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC9A3R2Q15599 337 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 OR2G6Q5TZ20 316 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 LAIR2Q6ISS4 152 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 CRIP3Q6Q6R5 217 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC25A26Q70HW3 274 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 PNKDQ8N490 385 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF676Q8N7Q3 588 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC54Q8NEL0 328 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 OR13C9Q8NGT0 318 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 PP6455Q8WZ26 134 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 BORCS8Q96FH0 119 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 MED30Q96HR3 178 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 JAM3Q9BX67 310 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 KPTNQ9Y664 436 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa15.36■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A1W2PQ09 198 aa15.36■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 IGHV1-69P01742 117 aa15.36■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 ATF1P18846 271 aa15.36■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 FUT6P51993 359 aa15.36■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 CAPZA1P52907 286 aa15.36■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 C11orf91Q3C1V1 193 aa15.36■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM185AQ8N0U4 392 aa15.36■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 PIP4P2Q8N4L2 257 aa15.36■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 KIR3DL3Q8N743 410 aa15.36■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 C10orf35Q96D05 121 aa15.36■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 CEP19Q96LK0 163 aa15.36■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 OPALINQ96PE5 141 aa15.36■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A0U1RQK1 487 aa15.35■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 ERICH4A6NGS2 130 aa15.35■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa15.35■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 GPR37O15354 613 aa15.35■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 LALBAP00709 142 aa15.35■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 CALCBP10092 127 aa15.35■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 BCL3P20749 454 aa15.35■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 PRTN3P24158 256 aa15.35■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 PRDX2P32119 198 aa15.35■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 CAPGP40121 348 aa15.35■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 NPBWR2P48146 333 aa15.35■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 DOC2BQ14184 412 aa15.35■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 PDCD1Q15116 288 aa15.35■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 KLHL22Q53GT1 634 aa15.35■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 TTC23Q5W5X9 447 aa15.35■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 ASPHD2Q6ICH7 369 aa15.35■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 UTS2BQ765I0 119 aa15.35■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 DHRSXQ8N5I4 330 aa15.35■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 OR5D18Q8NGL1 313 aa15.35■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 GATAD2BQ8WXI9 593 aa15.35■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 TNFRSF19Q9NS68 423 aa15.35■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 CLEC2DQ9UHP7 191 aa15.35■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 FBN3Q75N90 2809 aa15.35■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa15.34■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A1W2PRD5 423 aa15.34■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A1W2PRF3 423 aa15.34■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A1W2PRM7 423 aa15.34■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 ANGPTL7O43827 346 aa15.34■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 IGKV1D-12P01611 117 aa15.34■□□□□ 0.05
SH3BP2-218ENST00000511185 RBP2P50120 134 aa15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms