RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508148.1

MIB2-223, Transcript of mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2, human

TSL 4

Gene MIB2, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MIB2-223	ENST00000508148	RUSC1-AS1	Q66K80	236 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	BTNL3	Q6UXE8	466 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	TREML4	Q6UXN2	200 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	UTS2B	Q765I0	119 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	OR10AC1	Q8NH08	325 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	TRMT10A	Q8TBZ6	339 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	AQP3	Q92482	292 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	ADAT3	Q96EY9	351 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	NUDT16L1	Q9BRJ7	211 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	FKBP14	Q9NWM8	211 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	SCN3B	Q9NY72	215 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	DNAJB11	Q9UBS4	358 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	CLN8	Q9UBY8	286 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	RRP15	Q9Y3B9	282 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	IGHV3OR15-7	A0A075B7D8	119 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	AKR7A2	O43488	359 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	ADAM20	O43506	726 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	RHBDL1	O75783	438 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	GYPA	P02724	150 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	GLRA1	P23415	457 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	FUT6	P51993	359 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	RELB	Q01201	579 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	UBE2V2	Q15819	145 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	OR51A4	Q8NGJ6	313 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	RPS4Y2	Q8TD47	263 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	NPRL2	Q8WTW4	380 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	TSEN15	Q8WW01	171 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	TMIGD2	Q96BF3	282 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	SMIM19	Q96E16	107 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	BORCS8	Q96FH0	119 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	PDCD1LG2	Q9BQ51	273 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	CLEC2D	Q9UHP7	191 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	DHDH	Q9UQ10	334 aa		13.73	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	FAM230A	A0A1W2PPH8	454 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	NKX6-3	A6NJ46	265 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	OCM2	P0CE71	109 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	OCM	P0CE72	109 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	MPZ	P25189	248 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	TAS2R43	P59537	309 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	GMFB	P60983	142 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	STUM	Q69YW2	141 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	XAF1	Q6GPH4	301 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	C16orf87	Q6PH81	154 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	SLC36A1	Q7Z2H8	476 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	POC1A	Q8NBT0	407 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	DNAAF1	Q8NEP3	725 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	GATAD2B	Q8WXI9	593 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	MYDGF	Q969H8	173 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	SPSB1	Q96BD6	273 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	FGGY	Q96C11	551 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	PKIB	Q9C010	78 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	DNTTIP1	Q9H147	329 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	SLITRK2	Q9H156	845 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	WDR13	Q9H1Z4	485 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	BABAM2	Q9NXR7	383 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	KAAG1	Q9UBP8	84 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	RAB26	Q9ULW5	256 aa		13.72	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	POM121C	A8CG34	1229 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	CDK1	P06493	297 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	SFTPB	P07988	381 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	PGA5	P0DJD9	388 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	MMP9	P14780	707 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	PRKACB	P22694	351 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	AZGP1	P25311	298 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	C21orf33	P30042	268 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	RBP2	P50120	134 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	WNT4	P56705	351 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	IL24	Q13007	206 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	SMIM21	Q3B7S5	101 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	LHFPL2	Q6ZUX7	228 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	CALHM1	Q8IU99	346 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	TBX15	Q96SF7	602 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	MND1	Q9BWT6	205 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	NEK6	Q9HC98	313 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	SMURF1	Q9HCE7	757 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	TNFRSF19	Q9NS68	423 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	RASL12	Q9NYN1	266 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	NLK	Q9UBE8	527 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	ERGIC3	Q9Y282	383 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	TPRKB	Q9Y3C4	175 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	MMP24	Q9Y5R2	645 aa		13.71	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	PRKDC	P78527	4128 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
MIB2-223	ENST00000508148	FAM181B	A6NEQ2	426 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MIB2-223	ENST00000508148	OGG1	O15527	345 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MIB2-223	ENST00000508148	SYNGR1	O43759	233 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MIB2-223	ENST00000508148	CD2	P06729	351 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MIB2-223	ENST00000508148	ATF1	P18846	271 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MIB2-223	ENST00000508148	KRTAP10-3	P60369	221 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MIB2-223	ENST00000508148	DEFA6	Q01524	100 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MIB2-223	ENST00000508148	PDLIM3	Q53GG5	364 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
MIB2-223	ENST00000508148	RNLS	Q5VYX0	342 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MIB2-223	ENST00000508148	SERPINA12	Q8IW75	414 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MIB2-223	ENST00000508148	PARP16	Q8N5Y8	322 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF485	Q8NCK3	441 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MIB2-223	ENST00000508148	OR13C9	Q8NGT0	318 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MIB2-223	ENST00000508148	GPR148	Q8TDV2	347 aa		13.7	□□□□□ -0.22
MIB2-223	ENST00000508148	WFDC12	Q8WWY7	111 aa		13.7	□□□□□ -0.22

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