RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491036.2

LAMA5-210, Transcript of laminin subunit alpha 5, humanhuman

TSL 2

Gene LAMA5, Length 728 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA5-210ENST00000491036 H3BSH0 61 aa13.13□□□□□ -0.31
LAMA5-210ENST00000491036 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
LAMA5-210ENST00000491036 CCL3L1P16619 93 aa13.13□□□□□ -0.31
LAMA5-210ENST00000491036 COX7A1P24310 79 aa13.13□□□□□ -0.31
LAMA5-210ENST00000491036 GABRA5P31644 462 aa13.13□□□□□ -0.31
LAMA5-210ENST00000491036 LGALS4P56470 323 aa13.13□□□□□ -0.31
LAMA5-210ENST00000491036 EFNB1P98172 346 aa13.13□□□□□ -0.31
LAMA5-210ENST00000491036 ATP6AP1Q15904 470 aa13.13□□□□□ -0.31
LAMA5-210ENST00000491036 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa13.13□□□□□ -0.31
LAMA5-210ENST00000491036 C1orf146Q5VVC0 180 aa13.13□□□□□ -0.31
LAMA5-210ENST00000491036 C12orf73Q69YU5 71 aa13.13□□□□□ -0.31
LAMA5-210ENST00000491036 ANGPTL5Q86XS5 388 aa13.13□□□□□ -0.31
LAMA5-210ENST00000491036 GID4Q8IVV7 300 aa13.13□□□□□ -0.31
LAMA5-210ENST00000491036 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
LAMA5-210ENST00000491036 MEGF9Q9H1U4 602 aa13.13□□□□□ -0.31
LAMA5-210ENST00000491036 USE1Q9NZ43 259 aa13.13□□□□□ -0.31
LAMA5-210ENST00000491036 FBLN5Q9UBX5 448 aa13.13□□□□□ -0.31
LAMA5-210ENST00000491036 SIGLEC9Q9Y336 463 aa13.13□□□□□ -0.31
LAMA5-210ENST00000491036 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa13.12□□□□□ -0.31
LAMA5-210ENST00000491036 TK1P04183 234 aa13.12□□□□□ -0.31
LAMA5-210ENST00000491036 KRT8P05787 483 aa13.12□□□□□ -0.31
LAMA5-210ENST00000491036 PIPP12273 146 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
LAMA5-210ENST00000491036 BMXP51813 675 aa13.12□□□□□ -0.31
LAMA5-210ENST00000491036 ERVFRD-1P60508 538 aa13.12□□□□□ -0.31
LAMA5-210ENST00000491036 C2orf68Q2NKX9 166 aa13.12□□□□□ -0.31
LAMA5-210ENST00000491036 KDM4DQ6B0I6 523 aa13.12□□□□□ -0.31
LAMA5-210ENST00000491036 SSX6Q7RTT6 188 aa13.12□□□□□ -0.31
LAMA5-210ENST00000491036 CALHM1Q8IU99 346 aa13.12□□□□□ -0.31
LAMA5-210ENST00000491036 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa13.12□□□□□ -0.31
LAMA5-210ENST00000491036 PPP1R35Q8TAP8 253 aa13.12□□□□□ -0.31
LAMA5-210ENST00000491036 AJUBAQ96IF1 538 aa13.12□□□□□ -0.31
LAMA5-210ENST00000491036 NRIP2Q9BQI9 281 aa13.12□□□□□ -0.31
LAMA5-210ENST00000491036 PLEKHA1Q9HB21 404 aa13.12□□□□□ -0.31
LAMA5-210ENST00000491036 SLC7A11Q9UPY5 501 aa13.12□□□□□ -0.31
LAMA5-210ENST00000491036 CIB2O75838 187 aa13.11□□□□□ -0.31
LAMA5-210ENST00000491036 INMTO95050 263 aa13.11□□□□□ -0.31
LAMA5-210ENST00000491036 CSF1P09603 554 aa13.11□□□□□ -0.31
LAMA5-210ENST00000491036 FASP25445 335 aa13.11□□□□□ -0.31
LAMA5-210ENST00000491036 ZNF273Q14593 569 aa13.11□□□□□ -0.31
LAMA5-210ENST00000491036 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
LAMA5-210ENST00000491036 Q6ZTK2 550 aa13.11□□□□□ -0.31
LAMA5-210ENST00000491036 AMIGO2Q86SJ2 522 aa13.11□□□□□ -0.31
LAMA5-210ENST00000491036 C11orf42Q8N5U0 333 aa13.11□□□□□ -0.31
LAMA5-210ENST00000491036 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
LAMA5-210ENST00000491036 OR4C13Q8NGP0 309 aa13.11□□□□□ -0.31
LAMA5-210ENST00000491036 ADI1Q9BV57 179 aa13.11□□□□□ -0.31
LAMA5-210ENST00000491036 HES4Q9HCC6 221 aa13.11□□□□□ -0.31
LAMA5-210ENST00000491036 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
LAMA5-210ENST00000491036 ENOPH1Q9UHY7 261 aa13.11□□□□□ -0.31
LAMA5-210ENST00000491036 AP4S1Q9Y587 144 aa13.11□□□□□ -0.31
LAMA5-210ENST00000491036 DHRS7CA6NNS2 312 aa13.1□□□□□ -0.31
LAMA5-210ENST00000491036 SYT7O43581 403 aa13.1□□□□□ -0.31
LAMA5-210ENST00000491036 APOL3O95236 402 aa13.1□□□□□ -0.31
LAMA5-210ENST00000491036 MPZP25189 248 aa13.1□□□□□ -0.31
LAMA5-210ENST00000491036 ATP6V1E1P36543 226 aa13.1□□□□□ -0.31
LAMA5-210ENST00000491036 KIR2DS4P43632 304 aa13.1□□□□□ -0.31
LAMA5-210ENST00000491036 COL10A1Q03692 680 aa13.1□□□□□ -0.31
LAMA5-210ENST00000491036 HERPUD1Q15011 391 aa13.1□□□□□ -0.31
LAMA5-210ENST00000491036 PLA1AQ53H76 456 aa13.1□□□□□ -0.31
LAMA5-210ENST00000491036 Q6ZSR3 168 aa13.1□□□□□ -0.31
LAMA5-210ENST00000491036 CATSPERDQ86XM0 798 aa13.1□□□□□ -0.31
LAMA5-210ENST00000491036 C1QL4Q86Z23 238 aa13.1□□□□□ -0.31
LAMA5-210ENST00000491036 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
LAMA5-210ENST00000491036 PKIBQ9C010 78 aa13.1□□□□□ -0.31
LAMA5-210ENST00000491036 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa13.1□□□□□ -0.31
LAMA5-210ENST00000491036 RAB18Q9NP72 206 aa13.1□□□□□ -0.31
LAMA5-210ENST00000491036 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
LAMA5-210ENST00000491036 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
LAMA5-210ENST00000491036 METTL15A6NJ78 407 aa13.09□□□□□ -0.31
LAMA5-210ENST00000491036 CHRM2P08172 466 aa13.09□□□□□ -0.31
LAMA5-210ENST00000491036 OR2T7P0C7T2 308 aa13.09□□□□□ -0.31
LAMA5-210ENST00000491036 CCL1P22362 96 aa13.09□□□□□ -0.31
LAMA5-210ENST00000491036 EFNB2P52799 333 aa13.09□□□□□ -0.31
LAMA5-210ENST00000491036 EDDM3BP56851 147 aa13.09□□□□□ -0.31
LAMA5-210ENST00000491036 ERVK11-1P61568 191 aa13.09□□□□□ -0.31
LAMA5-210ENST00000491036 IL24Q13007 206 aa13.09□□□□□ -0.31
LAMA5-210ENST00000491036 UBE2V2Q15819 145 aa13.09□□□□□ -0.31
LAMA5-210ENST00000491036 AANATQ16613 207 aa13.09□□□□□ -0.31
LAMA5-210ENST00000491036 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa13.09□□□□□ -0.31
LAMA5-210ENST00000491036 C11orf44Q8N8P7 122 aa13.09□□□□□ -0.31
LAMA5-210ENST00000491036 OR10H4Q8NGA5 316 aa13.09□□□□□ -0.31
LAMA5-210ENST00000491036 OR2T6Q8NHC8 308 aa13.09□□□□□ -0.31
LAMA5-210ENST00000491036 SLAMF9Q96A28 289 aa13.09□□□□□ -0.31
LAMA5-210ENST00000491036 CIB1Q99828 191 aa13.09□□□□□ -0.31
LAMA5-210ENST00000491036 FOXJ3Q9UPW0 622 aa13.09□□□□□ -0.31
LAMA5-210ENST00000491036 DSCAML1Q8TD84 2053 aa13.09□□□□□ -0.31
LAMA5-210ENST00000491036 WNK1Q9H4A3 2382 aa13.08□□□□□ -0.32
LAMA5-210ENST00000491036 K7N7A8 449 aa13.08□□□□□ -0.32
LAMA5-210ENST00000491036 ARG1P05089 322 aa13.08□□□□□ -0.32
LAMA5-210ENST00000491036 HTR1FP30939 366 aa13.08□□□□□ -0.32
LAMA5-210ENST00000491036 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
LAMA5-210ENST00000491036 FUT6P51993 359 aa13.08□□□□□ -0.32
LAMA5-210ENST00000491036 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa13.08□□□□□ -0.32
LAMA5-210ENST00000491036 C11orf88Q6PI97 169 aa13.08□□□□□ -0.32
LAMA5-210ENST00000491036 CRIP3Q6Q6R5 217 aa13.08□□□□□ -0.32
LAMA5-210ENST00000491036 GDPD3Q7L5L3 318 aa13.08□□□□□ -0.32
LAMA5-210ENST00000491036 CEP19Q96LK0 163 aa13.08□□□□□ -0.32
LAMA5-210ENST00000491036 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa13.08□□□□□ -0.32
LAMA5-210ENST00000491036 RIBC2Q9H4K1 309 aa13.08□□□□□ -0.32
LAMA5-210ENST00000491036 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.1 ms