RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424		A6NIN4	97 aa		14.31	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424		E9PI62	339 aa		14.31	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	CDIPT	O14735	213 aa		14.31	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	OGG1	O15527	345 aa		14.31	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	ZFPL1	O95159	310 aa		14.31	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	IGHV4-38-2	P0DP08	117 aa		14.31	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	MMP9	P14780	707 aa		14.31	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	PRKACB	P22694	351 aa		14.31	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	14.31	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	14.31	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	FGF12	P61328	243 aa		14.31	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC35A2	P78381	396 aa		14.31	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	CDK5R1	Q15078	307 aa		14.31	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	C1orf122	Q6ZSJ8	110 aa		14.31	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF826P	Q6ZT77	177 aa		14.31	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	WDR86	Q86TI4	376 aa		14.31	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	SERPINA12	Q8IW75	414 aa		14.31	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	C3orf56	Q8N813	242 aa		14.31	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	LY6G5B	Q8NDX9	201 aa		14.31	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	NPRL2	Q8WTW4	380 aa		14.31	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	LRRC29	Q8WV35	223 aa		14.31	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	C22orf15	Q8WYQ4	148 aa		14.31	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	RNF166	Q96A37	237 aa	Predicted RBP	14.31	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	SMIM19	Q96E16	107 aa		14.31	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	MED30	Q96HR3	178 aa		14.31	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	PDCD1LG2	Q9BQ51	273 aa		14.31	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	YTHDF1	Q9BYJ9	559 aa	Known RBP	14.31	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	POLDIP2	Q9Y2S7	368 aa		14.31	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF281	Q9Y2X9	895 aa		14.31	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM230A	A0A1W2PPH8	454 aa		14.3	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	POM121C	A8CG34	1229 aa		14.3	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	DVL1	O14640	695 aa		14.3	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	TMPRSS2	O15393	492 aa		14.3	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	CRHBP	P24387	322 aa		14.3	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	ATP1B3	P54709	279 aa		14.3	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	BDH1	Q02338	343 aa		14.3	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	METTL11B	Q5VVY1	283 aa		14.3	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	METAP1D	Q6UB28	335 aa	Predicted RBP	14.3	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	UTS2B	Q765I0	119 aa		14.3	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	KIR3DL3	Q8N743	410 aa		14.3	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	SCCPDH	Q8NBX0	429 aa		14.3	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	C8orf46	Q8TAG6	207 aa		14.3	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	HPSE2	Q8WWQ2	592 aa		14.3	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	THRSP	Q92748	146 aa		14.3	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	BORCS8	Q96FH0	119 aa		14.3	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	CPNE2	Q96FN4	548 aa	Predicted RBP	14.3	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	14.3	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	WDFY2	Q96P53	400 aa		14.3	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	CHST5	Q9GZS9	411 aa		14.3	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	DUSP21	Q9H596	190 aa		14.3	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	PPP1R3E	Q9H7J1	279 aa		14.3	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	CNTD2	Q9H8S5	307 aa		14.3	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	TENM1	Q9UKZ4	2725 aa		14.3	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	TRAV40	A0A0B4J280	105 aa		14.29	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A1B0GUS0	222 aa		14.29	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	DNAJC9-AS1	A6NH13	148 aa		14.29	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	ANKHD1-EIF4EBP3	H7C0V5	636 aa	Predicted RBP	14.29	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	MAGEB3	O15480	346 aa		14.29	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	TOX4	O94842	621 aa		14.29	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	CYB5A	P00167	134 aa		14.29	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	GYPA	P02724	150 aa		14.29	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	IL13RA1	P78552	427 aa		14.29	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	SPHAR	Q15513	63 aa		14.29	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	MED22	Q15528	200 aa		14.29	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	BTN2A1	Q7KYR7	527 aa		14.29	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	PRSS48	Q7RTY5	328 aa		14.29	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	14.29	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	DNAAF1	Q8NEP3	725 aa		14.29	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	RPL3L	Q92901	407 aa	Known RBP	14.29	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF747	Q9BV97	191 aa		14.29	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	SIRPD	Q9H106	197 aa		14.29	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	OR51I2	Q9H344	312 aa		14.29	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	ZCCHC4	Q9H5U6	513 aa		14.29	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	RASL12	Q9NYN1	266 aa		14.29	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	DNAJB11	Q9UBS4	358 aa		14.29	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	RPUSD1	Q9UJJ7	312 aa	Known RBP	14.29	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	POMT1	Q9Y6A1	747 aa		14.29	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	NBEAL1	Q6ZS30	2694 aa		14.28	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	MRPS14	O60783	128 aa	Known RBP	14.28	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	ACAA1	P09110	424 aa	Predicted RBP	14.28	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	EGR1	P18146	543 aa		14.28	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	ATF1	P18846	271 aa		14.28	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	HAAO	P46952	286 aa		14.28	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	RBP2	P50120	134 aa		14.28	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	CAV3	P56539	151 aa		14.28	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC9A3R2	Q15599	337 aa		14.28	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	AWAT1	Q58HT5	328 aa		14.28	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	YIF1B	Q5BJH7	314 aa		14.28	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	LRRC10	Q5BKY1	277 aa		14.28	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	STUM	Q69YW2	141 aa		14.28	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	DMKN	Q6E0U4	476 aa	Predicted RBP	14.28	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	C16orf87	Q6PH81	154 aa		14.28	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	HAGHL	Q6PII5	290 aa	Predicted RBP	14.28	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		14.28	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	C19orf18	Q8NEA5	215 aa		14.28	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	GHSR	Q92847	366 aa		14.28	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	SPSB1	Q96BD6	273 aa		14.28	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	ADAT3	Q96EY9	351 aa	Predicted RBP	14.28	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	C1orf147	Q96MC9	270 aa	Predicted RBP	14.28	□□□□□ -0.12
HDAC10-216	ENST00000489424	SMURF1	Q9HCE7	757 aa		14.28	□□□□□ -0.12

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