RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486964.5

POLR1A-208, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 5

Gene POLR1A, Length 1,427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-208ENST00000486964 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 PRDM14Q9GZV8 571 aa8.37□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 MMP26Q9NRE1 261 aa8.37□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 ASF1BQ9NVP2 202 aa8.37□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 DNAJB11Q9UBS4 358 aa8.37□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 PCDHB10Q9UN67 800 aa8.37□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 LHFPL6Q9Y693 200 aa8.37□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa8.37□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 K7EM74 188 aa8.37□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 AQP7O14520 342 aa8.37□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 SNAPINO95295 136 aa8.37□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 SFT2D2O95562 160 aa8.37□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 CSN2P05814 226 aa8.37□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 LYL1P12980 280 aa8.37□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 CTSSP25774 331 aa8.37□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa8.37□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 FAM74A1Q5RGS3 127 aa8.37□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 CARD17Q5XLA6 110 aa8.37□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 PRSS54Q6PEW0 395 aa8.37□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 AAED1Q7RTV5 226 aa8.37□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 LINC00346Q8IVM7 164 aa8.37□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 BAP18Q8IXM2 172 aa8.37□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 OR4S1Q8NGB4 309 aa8.37□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 OR5AP2Q8NGF4 316 aa8.37□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 OR52N4Q8NGI2 321 aa8.37□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 OR13C9Q8NGT0 318 aa8.37□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 OR5H2Q8NGV7 314 aa8.37□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 CPT1CQ8TCG5 803 aa8.37□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 ABHD3Q8WU67 409 aa8.37□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa8.37□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 PPP1R14AQ96A00 147 aa8.37□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 AQP10Q96PS8 301 aa8.37□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 GAL3ST1Q99999 423 aa8.37□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 OCSTAMPQ9BR26 566 aa8.37□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 TMEM59Q9BXS4 323 aa8.37□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 LINC00470Q9BZP3 86 aa8.37□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 GP6Q9HCN6 339 aa8.37□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 TMEM100Q9NV29 134 aa8.37□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF175Q9Y473 711 aa8.37□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 TMEM218A2RU14 115 aa8.36□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 FIGNL2A6NMB9 653 aa8.36□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa8.36□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 H7C2Y5 167 aa8.36□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 CCSO14618 274 aa8.36□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 NDUFA2O43678 99 aa8.36□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 AKR1C4P17516 323 aa8.36□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 CDAP32320 146 aa8.36□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 SERPINF1P36955 418 aa8.36□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 SLC6A9P48067 706 aa8.36□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 SRYQ05066 204 aa8.36□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 SCRN3Q0VDG4 424 aa8.36□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 TBR1Q16650 682 aa8.36□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 FAM27BQ5VT28 67 aa8.36□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 OR10K2Q6IF99 312 aa8.36□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 C17orf107Q6ZR85 190 aa8.36□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 KCTD9Q7L273 389 aa8.36□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 COMMD2Q86X83 199 aa8.36□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 FNDC9Q8TBE3 224 aa8.36□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 CASTOR1Q8WTX7 329 aa8.36□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 C10orf35Q96D05 121 aa8.36□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF75AQ96N20 296 aa8.36□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 SELENOIQ9C0D9 397 aa8.36□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 LPAR5Q9H1C0 372 aa8.36□□□□□ -1.07
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POLR1A-208ENST00000486964 POMT1Q9Y6A1 747 aa8.36□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 URB1O60287 2271 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 SERPINE3A8MV23 424 aa8.35□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa8.35□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 SSX5O60225 188 aa8.35□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 CDC14BO60729 498 aa8.35□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 SYNGR4O95473 234 aa8.35□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 APOC1P02654 83 aa8.35□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 HCKP08631 526 aa8.35□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 H2AFB1P0C5Y9 115 aa8.35□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 GNB3P16520 340 aa8.35□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 AMY2BP19961 511 aa8.35□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 MSR1P21757 451 aa8.35□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 THBS4P35443 961 aa8.35□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 ALDH3B1P43353 468 aa8.35□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 OR3A2P47893 321 aa8.35□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 ECH1Q13011 328 aa8.35□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
POLR1A-208ENST00000486964 NRN1LQ496H8 165 aa8.35□□□□□ -1.07
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