RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 LALBAP00709 142 aa17.32■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa17.32■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP17.32■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 GABRA2P47869 451 aa17.32■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 RBP2P50120 134 aa17.32■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 ATP1B3P54709 279 aa17.32■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 SMIM21Q3B7S5 101 aa17.32■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 CD177Q8N6Q3 437 aa17.32■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP17.32■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 ZNF485Q8NCK3 441 aa17.32■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 LY6G5BQ8NDX9 201 aa17.32■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 OR52N1Q8NH53 320 aa17.32■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 GATAD2BQ8WXI9 593 aa17.32■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 SDSLQ96GA7 329 aa17.32■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 FKBP14Q9NWM8 211 aa17.32■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP17.32■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP17.32■□□□□ 0.36
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ACTB-211ENST00000480301 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa17.31■□□□□ 0.36
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ACTB-211ENST00000480301 F8VWA3 439 aa17.31■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 H0YHG0 523 aa17.31■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 OGG1O15527 345 aa17.31■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 NXPH2O95156 264 aa17.31■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 MMP9P14780 707 aa17.31■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 PRKACBP22694 351 aa17.31■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 TUSC1Q2TAM9 212 aa17.31■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 RNF144BQ7Z419 303 aa17.31■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 ZNRF1Q8ND25 227 aa17.31■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 OR13C9Q8NGT0 318 aa17.31■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 C22orf15Q8WYQ4 148 aa17.31■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 SPSB1Q96BD6 273 aa17.31■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 SLC6A7Q99884 636 aa17.31■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 DCTN5Q9BTE1 182 aa17.31■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP17.31■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 ZNF69Q9UC07 566 aa17.31■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 DHDHQ9UQ10 334 aa17.31■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa17.3■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 VENTXO95231 258 aa17.3■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 PLATP00750 562 aa17.3■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 MT-ND2P03891 347 aa17.3■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 FPR2P25090 351 aa17.3■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 PRDX2P32119 198 aa17.3■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 MTCP1P56278 107 aa17.3■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 MED21Q13503 144 aa17.3■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa17.3■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 C6orf141Q5SZD1 244 aa17.3■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa17.3■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 SLC25A26Q70HW3 274 aa17.3■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 AHSA2Q719I0 299 aa17.3■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 PARP16Q8N5Y8 322 aa17.3■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 C8orf46Q8TAG6 207 aa17.3■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 TMEM158Q8WZ71 300 aa17.3■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 SLAMF9Q96A28 289 aa17.3■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 CEP19Q96LK0 163 aa17.3■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 OPALINQ96PE5 141 aa17.3■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 TBX15Q96SF7 602 aa17.3■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 SIRPDQ9H106 197 aa17.3■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa17.3■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 CNTD2Q9H8S5 307 aa17.3■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 A0A0A6YYJ9 748 aa17.29■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 RNF212BA8MTL3 300 aa17.29■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP17.29■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 INMTO95050 263 aa17.29■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 ALX3O95076 343 aa17.29■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 SFTPBP07988 381 aa17.29■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP17.29■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 CAV3P56539 151 aa17.29■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 ARF6P62330 175 aa17.29■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 CRIP3Q6Q6R5 217 aa17.29■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 USP43Q70EL4 1123 aa17.29■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 SERPINA12Q8IW75 414 aa17.29■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP17.29■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 STX19Q8N4C7 294 aa17.29■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 BPIFB2Q8N4F0 458 aa17.29■□□□□ 0.36
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ACTB-211ENST00000480301 WDFY2Q96P53 400 aa17.29■□□□□ 0.36
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ACTB-211ENST00000480301 KNG1P01042 644 aa17.28■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 NDUFB7P17568 137 aa17.28■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 POU3F4P49335 361 aa17.28■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 RIPK1Q13546 671 aa17.28■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP17.28■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 TMEM185AQ8NFB2 350 aa17.28■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 OR5D14Q8NGL3 314 aa17.28■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP17.28■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 SMIM19Q96E16 107 aa17.28■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 PCGF1Q9BSM1 259 aa17.28■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 SUCNR1Q9BXA5 334 aa17.28■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 VCX3BQ9H321 246 aa17.28■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 TRAV40A0A0B4J280 105 aa17.27■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP17.27■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 SULT1B1O43704 296 aa17.27■□□□□ 0.36
ACTB-211ENST00000480301 OCM2P0CE71 109 aa17.27■□□□□ 0.36
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