RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478044.1

CUL2-208, Transcript of cullin 2, human

TSL 3

Gene CUL2, Length 507 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CUL2-208	ENST00000478044	DUX4L4	P0CJ87	422 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL2-208	ENST00000478044	DUX4L5	P0CJ88	424 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL2-208	ENST00000478044	DUX4L6	P0CJ89	424 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL2-208	ENST00000478044	DUX4L7	P0CJ90	424 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL2-208	ENST00000478044	RPS2	P15880	293 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CUL2-208	ENST00000478044	ATF1	P18846	271 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL2-208	ENST00000478044	PRKACB	P22694	351 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL2-208	ENST00000478044	AZGP1	P25311	298 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CUL2-208	ENST00000478044	ZFP36	P26651	326 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CUL2-208	ENST00000478044	GABRA2	P47869	451 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL2-208	ENST00000478044	POU3F4	P49335	361 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL2-208	ENST00000478044	GZMK	P49863	264 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL2-208	ENST00000478044	FUT6	P51993	359 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL2-208	ENST00000478044	MTCP1	P56278	107 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL2-208	ENST00000478044	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CUL2-208	ENST00000478044	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CUL2-208	ENST00000478044	INSL4	Q14641	139 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL2-208	ENST00000478044	IRF3	Q14653	427 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL2-208	ENST00000478044	KIR3DS1	Q14943	382 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL2-208	ENST00000478044	SPHAR	Q15513	63 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL2-208	ENST00000478044	FAM76B	Q5HYJ3	339 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL2-208	ENST00000478044	TMEM42	Q69YG0	159 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL2-208	ENST00000478044	DMKN	Q6E0U4	476 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CUL2-208	ENST00000478044	FAHD2B	Q6P2I3	314 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CUL2-208	ENST00000478044	DUX4L9	Q6RFH8	374 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CUL2-208	ENST00000478044		Q6ZSR3	168 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL2-208	ENST00000478044	IL17REL	Q6ZVW7	336 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL2-208	ENST00000478044	SLC25A26	Q70HW3	274 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL2-208	ENST00000478044	RNF144B	Q7Z419	303 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL2-208	ENST00000478044	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL2-208	ENST00000478044	ZNF573	Q86YE8	665 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL2-208	ENST00000478044	CALHM1	Q8IU99	346 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL2-208	ENST00000478044	EGFL6	Q8IUX8	553 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL2-208	ENST00000478044	SPIC	Q8N5J4	248 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL2-208	ENST00000478044	LINC01356	Q8N9X3	169 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL2-208	ENST00000478044	CCDC54	Q8NEL0	328 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL2-208	ENST00000478044	OR5D18	Q8NGL1	313 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL2-208	ENST00000478044	OR5D14	Q8NGL3	314 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL2-208	ENST00000478044	ZNF671	Q8TAW3	534 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL2-208	ENST00000478044	HAVCR2	Q8TDQ0	301 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL2-208	ENST00000478044	GPR148	Q8TDV2	347 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL2-208	ENST00000478044	PP6455	Q8WZ26	134 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL2-208	ENST00000478044	AQP3	Q92482	292 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL2-208	ENST00000478044	TMEM203	Q969S6	136 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL2-208	ENST00000478044	SLAMF9	Q96A28	289 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL2-208	ENST00000478044	SMIM19	Q96E16	107 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL2-208	ENST00000478044	BORCS8	Q96FH0	119 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL2-208	ENST00000478044	FAHD2A	Q96GK7	314 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL2-208	ENST00000478044	CCL13	Q99616	98 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL2-208	ENST00000478044	TMED9	Q9BVK6	235 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL2-208	ENST00000478044	CHST5	Q9GZS9	411 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL2-208	ENST00000478044	TLNRD1	Q9H1K6	362 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL2-208	ENST00000478044	ZCCHC4	Q9H5U6	513 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL2-208	ENST00000478044	NEK6	Q9HC98	313 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL2-208	ENST00000478044	TAS2R4	Q9NYW5	299 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL2-208	ENST00000478044	DUX4	Q9UBX2	424 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL2-208	ENST00000478044	BLOC1S6	Q9UL45	172 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL2-208	ENST00000478044	NF1	P21359	2839 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL2-208	ENST00000478044	VPS13C	Q709C8	3753 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CUL2-208	ENST00000478044	TRAV38-1	A0A0B4J264	116 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044		A8MV72	311 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044		B4DSR2	109 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044		F8VVB4	439 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044		F8VWA3	439 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	ANKHD1-EIF4EBP3	H7C0V5	636 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044		J3QT63	122 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	MAGEB3	O15480	346 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	PAX4	O43316	350 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	ADAM20	O43506	726 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	SPRY1	O43609	319 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	NXPH2	O95156	264 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	LHB	P01229	141 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	MSMB	P08118	114 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	HCK	P08631	526 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	TMEM225B	P0DP42	221 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	RAB3A	P20336	220 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	GLRA1	P23415	457 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	DUSP1	P28562	367 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	PITPNB	P48739	271 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	RBP2	P50120	134 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	ATP1B3	P54709	279 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	SNU13	P55769	128 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	TAS2R43	P59537	309 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	RPS11	P62280	158 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	MICB	Q29980	383 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	ZNF181	Q2M3W8	571 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	ZNF404	Q494X3	552 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	TMEM155	Q4W5P6	130 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	LIPK	Q5VXJ0	399 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	RNLS	Q5VYX0	342 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	FAM166A	Q6J272	317 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	UTS2B	Q765I0	119 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	KRT74	Q7RTS7	529 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	PRSS48	Q7RTY5	328 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	GLCCI1	Q86VQ1	547 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	SERPINA12	Q8IW75	414 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CUL2-208	ENST00000478044	FGFRL1	Q8N441	504 aa		4.9	□□□□□ -1.63

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