RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	ATPAF1	Q5TC12	328 aa	Predicted RBP	12.22	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	TTC23	Q5W5X9	447 aa		12.22	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	SLC25A26	Q70HW3	274 aa		12.22	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	KRT74	Q7RTS7	529 aa		12.22	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	DHRSX	Q8N5I4	330 aa		12.22	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	ASCC1	Q8N9N2	400 aa	Known RBP	12.22	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	SETD9	Q8NE22	299 aa		12.22	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	OR10AC1	Q8NH08	325 aa		12.22	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		12.22	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	ZFAND2B	Q8WV99	257 aa		12.22	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	APH1B	Q8WW43	257 aa		12.22	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	SLC25A28	Q96A46	364 aa		12.22	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	RFT1	Q96AA3	541 aa		12.22	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	ADAT3	Q96EY9	351 aa	Predicted RBP	12.22	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	SIRPD	Q9H106	197 aa		12.22	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	NEK6	Q9HC98	313 aa		12.22	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	INPP5E	Q9NRR6	644 aa		12.22	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	IGHV1-69D	A0A0B4J2H0	117 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	CENPVL3	A0A0U1RRI6	287 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	ERICH4	A6NGS2	130 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880		H0YAE9	185 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	IGHV1-69	P01742	117 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	CALCB	P10092	127 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	MMP9	P14780	707 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	AZGP1	P25311	298 aa	Known RBP	12.21	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	RBP2	P50120	134 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	DLX1	P56177	255 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	MTCP1	P56278	107 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF691	Q5VV52	312 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	PACRGL	Q8N7B6	248 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	OR51A4	Q8NGJ6	313 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	OR13C9	Q8NGT0	318 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	EMG1	Q92979	244 aa	Known RBP	12.21	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	C10orf35	Q96D05	121 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	CEP19	Q96LK0	163 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	PKIB	Q9C010	78 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	VCX	Q9H320	206 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	C8orf4	Q9NR00	106 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	CHCHD3	Q9NX63	227 aa	Known RBP	12.21	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	FAM96B	Q9Y3D0	163 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	MAB21L2	Q9Y586	359 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	KPTN	Q9Y664	436 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	TRBV2	A0A0J9YWF9	115 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SSR4-208	ENST00000471880	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	12.2	□□□□□ -0.46
SSR4-208	ENST00000471880	IGHA1	P01876	353 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SSR4-208	ENST00000471880	ISG15	P05161	165 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SSR4-208	ENST00000471880	HCK	P08631	526 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SSR4-208	ENST00000471880	CCDC159	P0C7I6	412 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SSR4-208	ENST00000471880	PIP	P12273	146 aa	Predicted RBP	12.2	□□□□□ -0.46
SSR4-208	ENST00000471880	ATF1	P18846	271 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SSR4-208	ENST00000471880	MYL12A	P19105	171 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SSR4-208	ENST00000471880	PRKACB	P22694	351 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SSR4-208	ENST00000471880	PRTN3	P24158	256 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SSR4-208	ENST00000471880	EEF1B2	P24534	225 aa	Known RBP	12.2	□□□□□ -0.46
SSR4-208	ENST00000471880	CCR9	P51686	369 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SSR4-208	ENST00000471880	IL24	Q13007	206 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SSR4-208	ENST00000471880	KLRD1	Q13241	179 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SSR4-208	ENST00000471880	C11orf91	Q3C1V1	193 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SSR4-208	ENST00000471880	FIP1L1	Q6UN15	594 aa	Known RBP	12.2	□□□□□ -0.46
SSR4-208	ENST00000471880	TMPRSS11A	Q6ZMR5	421 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SSR4-208	ENST00000471880		Q6ZSR3	168 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SSR4-208	ENST00000471880	EGFL6	Q8IUX8	553 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SSR4-208	ENST00000471880	SYS1	Q8N2H4	156 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SSR4-208	ENST00000471880	CD177	Q8N6Q3	437 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SSR4-208	ENST00000471880	OR4M1	Q8NGD0	313 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SSR4-208	ENST00000471880	OR5D18	Q8NGL1	313 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SSR4-208	ENST00000471880	OR5AK2	Q8NH90	309 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SSR4-208	ENST00000471880	OPALIN	Q96PE5	141 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SSR4-208	ENST00000471880	SPACA5	Q96QH8	159 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SSR4-208	ENST00000471880	PDCD1LG2	Q9BQ51	273 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SSR4-208	ENST00000471880	NRIP2	Q9BQI9	281 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SSR4-208	ENST00000471880	DHDH	Q9UQ10	334 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SSR4-208	ENST00000471880	IGKV1-27	A0A075B6S5	117 aa		12.19	□□□□□ -0.46
SSR4-208	ENST00000471880	IRGM	A1A4Y4	181 aa		12.19	□□□□□ -0.46
SSR4-208	ENST00000471880	OR4C45	A6NMZ5	311 aa		12.19	□□□□□ -0.46
SSR4-208	ENST00000471880		E9PI62	339 aa		12.19	□□□□□ -0.46
SSR4-208	ENST00000471880	SPRY1	O43609	319 aa	Predicted RBP	12.19	□□□□□ -0.46
SSR4-208	ENST00000471880	WBP4	O75554	376 aa	Known RBP	12.19	□□□□□ -0.46
SSR4-208	ENST00000471880	MPZ	P25189	248 aa		12.19	□□□□□ -0.46
SSR4-208	ENST00000471880	SOX2	P48431	317 aa		12.19	□□□□□ -0.46
SSR4-208	ENST00000471880	CAV3	P56539	151 aa		12.19	□□□□□ -0.46
SSR4-208	ENST00000471880	BPIFB3	P59826	476 aa		12.19	□□□□□ -0.46
SSR4-208	ENST00000471880	MRPL28	Q13084	256 aa	Known RBP	12.19	□□□□□ -0.46
SSR4-208	ENST00000471880	MED21	Q13503	144 aa		12.19	□□□□□ -0.46
SSR4-208	ENST00000471880	TUSC1	Q2TAM9	212 aa		12.19	□□□□□ -0.46
SSR4-208	ENST00000471880	FDX2	Q6P4F2	183 aa		12.19	□□□□□ -0.46
SSR4-208	ENST00000471880	LHFPL2	Q6ZUX7	228 aa		12.19	□□□□□ -0.46
SSR4-208	ENST00000471880	MKX	Q8IYA7	352 aa		12.19	□□□□□ -0.46
SSR4-208	ENST00000471880	C8orf59	Q8N0T1	100 aa	Predicted RBP	12.19	□□□□□ -0.46
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF561	Q8N587	486 aa		12.19	□□□□□ -0.46
SSR4-208	ENST00000471880	C3orf56	Q8N813	242 aa		12.19	□□□□□ -0.46
SSR4-208	ENST00000471880	LY6G5B	Q8NDX9	201 aa		12.19	□□□□□ -0.46
SSR4-208	ENST00000471880	RNF166	Q96A37	237 aa	Predicted RBP	12.19	□□□□□ -0.46
SSR4-208	ENST00000471880	SDSL	Q96GA7	329 aa		12.19	□□□□□ -0.46
SSR4-208	ENST00000471880	ZMAT3	Q9HA38	289 aa	Known RBP	12.19	□□□□□ -0.46
SSR4-208	ENST00000471880	MTCH1	Q9NZJ7	389 aa		12.19	□□□□□ -0.46
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF222	Q9UK12	451 aa		12.19	□□□□□ -0.46
SSR4-208	ENST00000471880	IGKV1-9	A0A0C4DH69	117 aa		12.18	□□□□□ -0.46
SSR4-208	ENST00000471880		A0A1W2PPH5	198 aa		12.18	□□□□□ -0.46
SSR4-208	ENST00000471880	MEX3A	A1L020	520 aa	Known RBP	12.18	□□□□□ -0.46

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