RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466359.1

NFX1-205, Transcript of nuclear transcription factor, X-box binding 1, human

TSL 3

Gene NFX1, Length 391 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NFX1-205	ENST00000466359	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	SLITRK2	Q9H156	845 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	PPIL3	Q9H2H8	161 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	PPP1R3E	Q9H7J1	279 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	PATZ1	Q9HBE1	687 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	NOX4	Q9NPH5	578 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	GPR173	Q9NS66	373 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	C1orf123	Q9NWV4	160 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	TMEM160	Q9NX00	188 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	MTCH1	Q9NZJ7	389 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	STUB1	Q9UNE7	303 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	GSTK1	Q9Y2Q3	226 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	WIPI2	Q9Y4P8	454 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	TRAV8-7	A0A075B6U6	113 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359		B4DSR2	109 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	GABRP	O00591	440 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	PDCD5	O14737	125 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	PPIH	O43447	177 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	LMX1B	O60663	402 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	RHBDL1	O75783	438 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	LY6H	O94772	140 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	ECD	O95905	644 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	IGHV2-5	P01817	119 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	LIPF	P07098	398 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	GRP	P07492	148 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	SMIM18	P0DKX4	95 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	CD36	P16671	472 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	ADRA2C	P18825	462 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	PSMB9	P28065	219 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	SOX2	P48431	317 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	GZMK	P49863	264 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	CAV3	P56539	151 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	RPS25	P62851	125 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	FAM189A2	Q15884	450 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	SMIM21	Q3B7S5	101 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	STUM	Q69YW2	141 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	HAGHL	Q6PII5	290 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	ZNF841	Q6ZN19	808 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	ACP7	Q6ZNF0	438 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	C1orf122	Q6ZSJ8	110 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	SLC25A26	Q70HW3	274 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	NLRC3	Q7RTR2	1065 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	CALHM1	Q8IU99	346 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	ZNF561	Q8N587	486 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	ZFP41	Q8N8Y5	198 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	PNLDC1	Q8NA58	520 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	OR52N4	Q8NGI2	321 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	OR13C9	Q8NGT0	318 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	OR51F2	Q8NH61	342 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	LRRC29	Q8WV35	223 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	RPL3L	Q92901	407 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	DACT3	Q96B18	629 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	RAB39B	Q96DA2	213 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	C18orf12	Q96KH6	178 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	CEP19	Q96LK0	163 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359		Q96MF0	132 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	KCTD7	Q96MP8	289 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	TMED9	Q9BVK6	235 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	HMG20A	Q9NP66	347 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	TXNL4B	Q9NX01	149 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	TAS2R4	Q9NYW5	299 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	NLK	Q9UBE8	527 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	ZNF222	Q9UK12	451 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	SSR3	Q9UNL2	185 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	CACNG2	Q9Y698	323 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	TLN2	Q9Y4G6	2542 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	IGHV4-61	A0A0C4DH41	118 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	IGKV1-12	A0A0C4DH73	117 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	FAM230A	A0A1W2PPH8	454 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359		A6NIN4	97 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359		A6NLC8	198 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	IFITM5	A6NNB3	132 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	OR2AT4	A6NND4	320 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	LYNX1	G3V0Z9	82 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	TRAPPC2L	H3BP13	241 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	ZNF701	M0R085	212 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	AIP	O00170	330 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	SLC17A2	O00624	439 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	SIGLEC5	O15389	551 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	CDC14B	O60729	498 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	IGKV1D-12	P01611	117 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	CSN2	P05814	226 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	CHRM2	P08172	466 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	OCM	P0CE72	109 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	LYNX1	P0DP58	116 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	PSG2	P11465	335 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	GTF2F2	P13984	249 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	CD99	P14209	185 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	GLRA1	P23415	457 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	ERP29	P30040	261 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	KCNJ3	P48549	501 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	TMBIM6	P55061	237 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	FGF12	P61328	243 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	QRFP	P83859	136 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	PAX2	Q02962	417 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	IL13RA2	Q14627	380 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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