RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466185.1

PRPF4B-204, Transcript of pre-mRNA processing factor 4B, humanhuman

TSL 5

Gene PRPF4B, Length 1,297 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4B-204ENST00000466185 RDH8Q9NYR8 311 aa4.89□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 CDH10Q9Y6N8 788 aa4.89□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 DOCK7Q96N67 2140 aa4.88□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa4.88□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 A0A1W2PRG6 482 aa4.88□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 MEIOCA2RUB1 952 aa4.88□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 OR6C65A6NJZ3 312 aa4.88□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 PDLIM1O00151 329 aa4.88□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 BHLHE40O14503 412 aa4.88□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 EI24O14681 340 aa4.88□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 MGRN1O60291 552 aa4.88□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 ZG16O60844 167 aa4.88□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 ZNF432O94892 652 aa4.88□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 NXPH2O95156 264 aa4.88□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 NXPH4O95158 308 aa4.88□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 CD14P08571 375 aa4.88□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 FCGR2CP31995 323 aa4.88□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 RPL4P36578 427 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 DAPP51397 102 aa4.88□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 DAP3P51398 398 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 ERVK-25P63136 954 aa4.88□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 RFX4Q33E94 735 aa4.88□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 KDM4DQ6B0I6 523 aa4.88□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 SLC35D2Q76EJ3 337 aa4.88□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 AAED1Q7RTV5 226 aa4.88□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 FAM122BQ7Z309 247 aa4.88□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 HDDC2Q7Z4H3 204 aa4.88□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 WDFY1Q8IWB7 410 aa4.88□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 TMEM123Q8N131 208 aa4.88□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 OR52L1Q8NGH7 329 aa4.88□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 OR8D4Q8NGM9 314 aa4.88□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 OR4F5Q8NH21 305 aa4.88□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 OR6X1Q8NH79 312 aa4.88□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 LILRB4Q8NHJ6 448 aa4.88□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 ZNF519Q8TB69 540 aa4.88□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa4.88□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 APH1AQ96BI3 265 aa4.88□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 TSPAN32Q96QS1 320 aa4.88□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 OR2M2Q96R28 347 aa4.88□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 CIB1Q99828 191 aa4.88□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 C9orf16Q9BUW7 83 aa4.88□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 EMC6Q9BV81 110 aa4.88□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa4.88□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 WDR13Q9H1Z4 485 aa4.88□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 TXNIPQ9H3M7 391 aa4.88□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 MED20Q9H944 212 aa4.88□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 MED29Q9NX70 200 aa4.88□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 IL20Q9NYY1 176 aa4.88□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 USE1Q9NZ43 259 aa4.88□□□□□ -1.63
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PRPF4B-204ENST00000466185 FZR1Q9UM11 496 aa4.88□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 PROCRQ9UNN8 238 aa4.88□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 RABL2BQ9UNT1 228 aa4.88□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 B9D1Q9UPM9 204 aa4.88□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 POFUT2Q9Y2G5 429 aa4.88□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 ZGRF1Q86YA3 2104 aa4.88□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa4.87□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa4.87□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 ESPL1Q14674 2120 aa4.87□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 A6NIZ1 184 aa4.87□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 CENPBD1B2RD01 187 aa4.87□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa4.87□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 H0YL77 283 aa4.87□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 H3BN98 237 aa4.87□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 IMPA2O14732 288 aa4.87□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 ARPC3O15145 178 aa4.87□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 KCNAB3O43448 404 aa4.87□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 UPK3AO75631 287 aa4.87□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 SOX14O95416 240 aa4.87□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 IGHG1P01857 330 aa4.87□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 RNF224P0DH78 156 aa4.87□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 PGA4P0DJD7 388 aa4.87□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 PGA3P0DJD8 388 aa4.87□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 ANOS1P23352 680 aa4.87□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 IGFBP5P24593 272 aa4.87□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 CSNK1A1P48729 337 aa4.87□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 BIDP55957 195 aa4.87□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 RAP1BP61224 184 aa4.87□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 ESRRGP62508 458 aa4.87□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 RAP1AP62834 184 aa4.87□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 RIPK1Q13546 671 aa4.87□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 MAJINQ3KP22 176 aa4.87□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa4.87□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 MESTQ5EB52 335 aa4.87□□□□□ -1.63
PRPF4B-204ENST00000466185 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa4.87□□□□□ -1.63
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