RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463041.1

PTPRF-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRF, Length 298 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-210ENST00000463041 TMEM185AQ8NFB2 350 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 OR10H4Q8NGA5 316 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 OR5R1Q8NH85 324 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP5.96□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 HRASLS5Q96KN8 279 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 TBX5Q99593 518 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 NRIP2Q9BQI9 281 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 FAM234AQ9H0X4 552 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 RIBC2Q9H4K1 309 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 C16orf95Q9H693 158 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 HES4Q9HCC6 221 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 ZNRD1Q9P1U0 126 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 RNF114Q9Y508 228 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 VWFP04275 2813 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 A0A1W2PRD5 423 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 A0A1W2PRF3 423 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 A0A1W2PRM7 423 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 ANKRD61A6NGH8 418 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 SAC3D1A6NKF1 404 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 SNTNA6NMZ2 147 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 K7N7A8 449 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 TSPAN9O75954 239 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 CLPXO76031 633 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 TK1P04183 234 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 ALPLP05186 524 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 RPSAP08865 295 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 SAA4P35542 130 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 ISL1P61371 349 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 KLRD1Q13241 179 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 UBE2V2Q15819 145 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 TAF9Q16594 264 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 AANATQ16613 207 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 FDX2Q6P4F2 183 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 TREML4Q6UXN2 200 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 MKXQ8IYA7 352 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 FAM185AQ8N0U4 392 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 C11orf42Q8N5U0 333 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 DTX3Q8N9I9 347 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 BEND2Q8NDZ0 799 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 DNAAF1Q8NEP3 725 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 LINC01006Q8NI28 216 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 PYDC1Q8WXC3 89 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 PP6455Q8WZ26 134 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 UBE2FQ969M7 185 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF488Q96MN9 340 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 CITED1Q99966 193 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 PLEKHA1Q9HB21 404 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 IMPAD1Q9NX62 359 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 USE1Q9NZ43 259 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 GNG8Q9UK08 70 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 VPREB3Q9UKI3 123 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 DAPL1A0PJW8 107 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 E9PQ18 207 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 J3QRE1 110 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 TIMM23O14925 209 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 ANGPTL7O43827 346 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 ENTPD6O75354 484 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 APOL3O95236 402 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 CYB5AP00167 134 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 ISG15P05161 165 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 PRKACBP22694 351 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 RBP2P50120 134 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 ALDH3A2P51648 485 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 CCR9P51686 369 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 ATP1B3P54709 279 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 DLX1P56177 255 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 LGALS4P56470 323 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 PROK1P58294 105 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 ERVFRD-1P60508 538 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 ACTC1P68032 377 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 ACTA1P68133 377 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF85Q03923 595 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 ODF4Q2M2E3 257 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 HCP5Q6MZN7 132 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 Q6ZSV7 163 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 CCDC121Q6ZUS5 278 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 UTS2BQ765I0 119 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 FAM220AQ7Z4H9 259 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 Q8IYB0 196 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 ENTHD1Q8IYW4 607 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 RDH10Q8IZV5 341 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 PRSS35Q8N3Z0 413 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 PNKDQ8N490 385 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 ACBD7Q8N6N7 88 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 OR4M1Q8NGD0 313 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 OR2G2Q8NGZ5 317 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 WFDC12Q8WWY7 111 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 RNFT2Q96EX2 444 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 BORCS8Q96FH0 119 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 SNX22Q96L94 193 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 CEP19Q96LK0 163 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 Q96MT0 163 aa5.94□□□□□ -1.46
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