RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 NPY4RP50391 375 aa5.77□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 CCR9P51686 369 aa5.77□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 RAB40BQ12829 278 aa5.77□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 KLRD1Q13241 179 aa5.77□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 SNCBQ16143 134 aa5.77□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM244Q5VVB8 128 aa5.77□□□□□ -1.49
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RABGEF1-206ENST00000461017 NLRC3Q7RTR2 1065 aa5.77□□□□□ -1.49
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RABGEF1-206ENST00000461017 Q96MT0 163 aa5.77□□□□□ -1.49
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RABGEF1-206ENST00000461017 ACTA1P68133 377 aa5.76□□□□□ -1.49
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RABGEF1-206ENST00000461017 TNFRSF14Q92956 283 aa5.76□□□□□ -1.49
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RABGEF1-206ENST00000461017 STAB1Q9NY15 2570 aa5.76□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 TENM1Q9UKZ4 2725 aa5.76□□□□□ -1.49
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RABGEF1-206ENST00000461017 NDUFB7P17568 137 aa5.75□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
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RABGEF1-206ENST00000461017 DUSP1P28562 367 aa5.75□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 SOX2P48431 317 aa5.75□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP5.75□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 ACTA2P62736 377 aa5.75□□□□□ -1.49
RABGEF1-206ENST00000461017 UBA52P62987 128 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
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