RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444916.5

SH3BP4-205, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP4, Length 570 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-205ENST00000444916 HES4Q9HCC6 221 aa11.66□□□□□ -0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 HHLA2Q9UM44 414 aa11.66□□□□□ -0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 MAB21L2Q9Y586 359 aa11.66□□□□□ -0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa11.65□□□□□ -0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa11.65□□□□□ -0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 RFPL4AA6NLU0 287 aa11.65□□□□□ -0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 ANKRD65E5RJM6 399 aa11.65□□□□□ -0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa11.65□□□□□ -0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 CLIC3O95833 236 aa11.65□□□□□ -0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF20P17024 532 aa11.65□□□□□ -0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 PRTN3P24158 256 aa11.65□□□□□ -0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 ERVK11-1P61568 191 aa11.65□□□□□ -0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 ACTG1P63261 375 aa11.65□□□□□ -0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 BAMBIQ13145 260 aa11.65□□□□□ -0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa11.65□□□□□ -0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 UTS2BQ765I0 119 aa11.65□□□□□ -0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 CMTM4Q8IZR5 234 aa11.65□□□□□ -0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 CD177Q8N6Q3 437 aa11.65□□□□□ -0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF676Q8N7Q3 588 aa11.65□□□□□ -0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNRF1Q8ND25 227 aa11.65□□□□□ -0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 SETD9Q8NE22 299 aa11.65□□□□□ -0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 DNAAF1Q8NEP3 725 aa11.65□□□□□ -0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 TMEM185AQ8NFB2 350 aa11.65□□□□□ -0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 OR10AC1Q8NH08 325 aa11.65□□□□□ -0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 CNIH3Q8TBE1 160 aa11.65□□□□□ -0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa11.65□□□□□ -0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 BORCS8Q96FH0 119 aa11.65□□□□□ -0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 ONECUT1Q9UBC0 465 aa11.65□□□□□ -0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
SH3BP4-205ENST00000444916 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa11.64□□□□□ -0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa11.64□□□□□ -0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 IRGMA1A4Y4 181 aa11.64□□□□□ -0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 CLDN34H7C241 214 aa11.64□□□□□ -0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 IGHV1-69P01742 117 aa11.64□□□□□ -0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 RPSAP08865 295 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 PRKACBP22694 351 aa11.64□□□□□ -0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 PRDX2P32119 198 aa11.64□□□□□ -0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 IL18R1Q13478 541 aa11.64□□□□□ -0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 VMO1Q7Z5L0 202 aa11.64□□□□□ -0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF561Q8N587 486 aa11.64□□□□□ -0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 DHRSXQ8N5I4 330 aa11.64□□□□□ -0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 OR51A4Q8NGJ6 313 aa11.64□□□□□ -0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 OR13C3Q8NGS6 347 aa11.64□□□□□ -0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 GATAD2BQ8WXI9 593 aa11.64□□□□□ -0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 LHX4Q969G2 390 aa11.64□□□□□ -0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 FGGYQ96C11 551 aa11.64□□□□□ -0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 PRDM13Q9H4Q3 707 aa11.64□□□□□ -0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 A0A1W2PQ09 198 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 TMEM212A6NML5 194 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 E9PI62 339 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 SLC1A7O00341 560 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 ZFPL1O95159 310 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 KNG1P01042 644 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 CCDC159P0C7I6 412 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 LIMS3P0CW19 117 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 LIMS4P0CW20 117 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 ATF1P18846 271 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 DCKP27707 260 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 RBP2P50120 134 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 CAPZA1P52907 286 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 ATP1B3P54709 279 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 DEFB112Q30KQ8 113 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 SLC25A26Q70HW3 274 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 BATF2Q8N1L9 274 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 C3orf56Q8N813 242 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 SLC25A28Q96A46 364 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 SPSB1Q96BD6 273 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 CEP19Q96LK0 163 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 DUX5Q96PT3 197 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 MTCH1Q9NZJ7 389 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa11.63□□□□□ -0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 TMEM89A2RUT3 159 aa11.62□□□□□ -0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 M0R1W7 72 aa11.62□□□□□ -0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 MT-ND2P03891 347 aa11.62□□□□□ -0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 COMPP49747 757 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 MTCP1P56278 107 aa11.62□□□□□ -0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 SLC9A3R2Q15599 337 aa11.62□□□□□ -0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa11.62□□□□□ -0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa11.62□□□□□ -0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 Q8IYB0 196 aa11.62□□□□□ -0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 Q8N7P7 452 aa11.62□□□□□ -0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 OR5AK2Q8NH90 309 aa11.62□□□□□ -0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 ZDHHC16Q969W1 377 aa11.62□□□□□ -0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 SLAMF9Q96A28 289 aa11.62□□□□□ -0.55
SH3BP4-205ENST00000444916 OPALINQ96PE5 141 aa11.62□□□□□ -0.55
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