RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 GASTP01350 101 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 KLK2P20151 261 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 CD68P34810 354 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 EFNA5P52803 228 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 WNT3AP56704 352 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 RPL32P62910 135 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 OR1Q1Q15612 314 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 PSG3Q16557 428 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 TIMM23BQ5SRD1 257 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 FAHD1Q6P587 224 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 PRR7Q8TB68 274 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 DOK4Q8TEW6 326 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 MUCL1Q96DR8 90 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 HPDLQ96IR7 371 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 RNF39Q9H2S5 420 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 MS4A5Q9H3V2 200 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 SNURFLB1AK76 121 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 FXYD1O00168 92 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 CELA3AP09093 270 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 SRFP11831 508 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 ACP5P13686 325 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 FUT3P21217 361 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 CCKBRP32239 447 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 CAMPP49913 170 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM33P57088 247 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 DCDP81605 110 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 ERFEQ4G0M1 354 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 OXLD1Q5BKU9 147 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 BRICD5Q6PL45 260 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 PLXDC2Q6UX71 529 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 ARL17AQ8IVW1 177 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 VSTM2AQ8TAG5 236 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 CDH20Q9HBT6 801 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 GJD2Q9UKL4 321 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 TRAV25A0A0B4J276 109 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 IGLON5A6NGN9 336 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 OOEPA6NGQ2 149 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 CHRM2P08172 466 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM225BP0DP42 221 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 ATP6V0CP27449 155 aa4.99□□□□□ -1.61
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PTPRC-209ENST00000442510 MESP2Q0VG99 397 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 DCAF12L2Q5VW00 463 aa4.99□□□□□ -1.61
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PTPRC-209ENST00000442510 OR2A5Q96R48 311 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM160Q9NX00 188 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 EMC9Q9Y3B6 208 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 YIPF1Q9Y548 306 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 TRPM2O94759 1503 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 C17orf102A2RUQ5 167 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 IFITM5A6NNB3 132 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 ADRA2CP18825 462 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 SGSHP51688 502 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 ZP1P60852 638 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 TCF24Q7RTU0 167 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 CA13Q8N1Q1 262 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 CLEC1AQ8NC01 280 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM170AQ8WVE7 144 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 COPS9Q8WXC6 57 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 ADTRPQ96IZ2 230 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF681Q96N22 645 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 NMES1Q9C002 83 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 COA1Q9GZY4 146 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 NOX4Q9NPH5 578 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 ONECUT1Q9UBC0 465 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 A0A1W2PR48 441 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM8BA6NDV4 472 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 OR2T8A6NH00 312 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 SHISA7A6NL88 538 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 ZAR1LA6NP61 321 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 YDJCA8MPS7 323 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 SAP30O75446 220 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 PRSS23O95084 383 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRC-209ENST00000442510 RENP00797 406 aa4.98□□□□□ -1.61
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