RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439476.6

BDNF-211, Transcript of brain derived neurotrophic factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene BDNF, Length 4,532 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BDNF-211ENST00000439476 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa5.7□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 OR10P1Q8NGE3 313 aa5.7□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 REG4Q9BYZ8 158 aa5.7□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 MMP17Q9ULZ9 603 aa5.7□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 SHISA3A0PJX4 238 aa5.69□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 PGA3P0DJD8 388 aa5.69□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 ALOX5APP20292 161 aa5.69□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 OMGP23515 440 aa5.69□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 CD82P27701 267 aa5.69□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 CD80P33681 288 aa5.69□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 BTG2P78543 158 aa5.69□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 ATP6V1FQ16864 119 aa5.69□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 MOGAT2Q3SYC2 334 aa5.69□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 ADAM5Q6NVV9 412 aa5.69□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 PET117Q6UWS5 81 aa5.69□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 OR5M9Q8NGP3 310 aa5.69□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 HHIPQ96QV1 700 aa5.69□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 CA10Q9NS85 328 aa5.69□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 PLXNB2O15031 1838 aa5.69□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 LNP1A1A4G5 178 aa5.69□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 M0R135 149 aa5.69□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 MYOGP15173 224 aa5.69□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 CXCL2P19875 107 aa5.69□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 GABRA2P47869 451 aa5.69□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 FAM58AQ8N1B3 248 aa5.69□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa5.69□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 OR52M1Q8NGK5 317 aa5.69□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 SLC37A2Q8TED4 501 aa5.69□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 C11orf40Q8WZ69 217 aa5.69□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 ZNF799Q96GE5 643 aa5.69□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 TAAR6Q96RI8 345 aa5.69□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 NUDT22Q9BRQ3 303 aa5.69□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 TWSG1Q9GZX9 223 aa5.69□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa5.69□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa5.69□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 ALPK2Q86TB3 2170 aa5.69□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 SCN3AQ9NY46 2000 aa5.69□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 A0A1B0GTH9 108 aa5.69□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 ANGPTL7O43827 346 aa5.69□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 CEACAM5P06731 702 aa5.69□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 NMBP08949 121 aa5.69□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 CT45A10P0DMU9 189 aa5.69□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 FHITP49789 147 aa5.69□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 DMWDQ09019 674 aa5.69□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 COX19Q49B96 90 aa5.69□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 C11orf42Q8N5U0 333 aa5.69□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 M1APQ8TC57 530 aa5.69□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa5.69□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 TEX101Q9BY14 249 aa5.69□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 FN3KRPQ9HA64 309 aa5.69□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 RAB18Q9NP72 206 aa5.69□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 GPR173Q9NS66 373 aa5.69□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 HIF1ANQ9NWT6 349 aa5.69□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 RPA2P15927 270 aa5.69□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 ABOP16442 354 aa5.69□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 FPR2P25090 351 aa5.69□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 CSN1S1P47710 185 aa5.69□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 DUSP2Q05923 314 aa5.69□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 MICBQ29980 383 aa5.69□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 C4orf17Q53FE4 359 aa5.69□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 MARCH3Q86UD3 253 aa5.69□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 LRRTM1Q86UE6 522 aa5.69□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 BOD1L2Q8IYS8 172 aa5.69□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 CA13Q8N1Q1 262 aa5.69□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 MRGPRDQ8TDS7 321 aa5.69□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 DPF1Q92782 380 aa5.69□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 OR8B4Q96RC9 309 aa5.69□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 DIRC2Q96SL1 478 aa5.69□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 S1PR3Q99500 378 aa5.69□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 CSTL1Q9H114 145 aa5.69□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 OR51I2Q9H344 312 aa5.69□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 MED9Q9NWA0 146 aa5.69□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 TMED3Q9Y3Q3 217 aa5.69□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 SEC16AO15027 2179 aa5.69□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 A0A087WUJ7 227 aa5.68□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 A4D1N5 150 aa5.68□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 ZNF727A8MUV8 499 aa5.68□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 CTAG2O75638 210 aa5.68□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 TUSC2O75896 110 aa5.68□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 CST4P01036 141 aa5.68□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 FGF2P09038 288 aa5.68□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 OR5H8P0DN80 308 aa5.68□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 UBE2G1P62253 170 aa5.68□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 PMP22Q01453 160 aa5.68□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 ARL16Q0P5N6 197 aa5.68□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 DHRS2Q13268 280 aa5.68□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 ZIC1Q15915 447 aa5.68□□□□□ -1.5
BDNF-211ENST00000439476 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
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