RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438547.6

SEMA4D-211, Transcript of semaphorin 4D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SEMA4D, Length 4,824 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4D-211ENST00000438547 SPP1P10451 314 aa9.93□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 ZNF32P17041 273 aa9.93□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 MPGP29372 298 aa9.93□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 FABP6P51161 128 aa9.93□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 UBALD1Q8TB05 177 aa9.93□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 UCK1Q9HA47 277 aa9.93□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 PRR13Q9NZ81 148 aa9.93□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa9.93□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa9.93□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa9.93□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 A0A1W2PPE2 198 aa9.93□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 A0A1W2PR64 198 aa9.93□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 A0A1W2PRV1 198 aa9.93□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 HRKO00198 91 aa9.93□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 DEFA4P12838 97 aa9.93□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 GNG3P63215 75 aa9.93□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 CCL7P80098 99 aa9.93□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 RBPJQ06330 500 aa9.93□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 C9orf50Q5SZB4 431 aa9.93□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 SPEM1Q8N4L4 309 aa9.93□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 UBAC2Q8NBM4 344 aa9.93□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 OR8B12Q8NGG6 310 aa9.93□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 OR6S1Q8NH40 331 aa9.93□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 AQP7P3A6NL99 342 aa9.93□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 NUBPLQ8TB37 319 aa9.93□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 SCN3AQ9NY46 2000 aa9.93□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 MTCH2Q9Y6C9 303 aa9.93□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 C2CD4DB7Z1M9 353 aa9.93□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 OR5G3P0C626 314 aa9.93□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 RAB5AP20339 215 aa9.93□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 EFNB2P52799 333 aa9.93□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 ZNF718Q3SXZ3 478 aa9.93□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 SPATA46Q5T0L3 261 aa9.93□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 PECRQ9BY49 303 aa9.93□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 PRO1933Q9H354 126 aa9.93□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 CCDC88CQ9P219 2028 aa9.92□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 TNFSF14O43557 240 aa9.92□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 TMEM92Q6UXU6 159 aa9.92□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 ASB10Q8WXI3 467 aa9.92□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 FAM210BQ96KR6 192 aa9.92□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 SEC11CQ9BY50 192 aa9.92□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 COMMD5Q9GZQ3 224 aa9.92□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 LPAR3Q9UBY5 353 aa9.92□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 ANXA10Q9UJ72 324 aa9.92□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 DSPPQ9NZW4 1301 aa9.92□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 PMS2P1A4D2B8 440 aa9.92□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 ERVH48-1M5A8F1 160 aa9.92□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 CRYAAP02489 173 aa9.92□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 CD200P41217 278 aa9.92□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 LIMS1P48059 325 aa9.92□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 RPS23P62266 143 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 AWAT1Q58HT5 328 aa9.92□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 PLAC9Q5JTB6 97 aa9.92□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 C9orf152Q5JTZ5 239 aa9.92□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 ANKRD37Q7Z713 158 aa9.92□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 IP6K3Q96PC2 410 aa9.92□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 PRSS27Q9BQR3 290 aa9.92□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 EGLN1Q9GZT9 426 aa9.92□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 EML2O95834 649 aa9.92□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 ZNF17P17021 662 aa9.92□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 PPP1CBP62140 327 aa9.92□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 RAC1P63000 192 aa9.92□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 FZD5Q13467 585 aa9.92□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa9.92□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 RTL8BQ17RB0 113 aa9.92□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 TMEM241Q24JQ0 296 aa9.92□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 OR2A2Q6IF42 318 aa9.92□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 OR6X1Q8NH79 312 aa9.92□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 CACFD1Q9UGQ2 172 aa9.92□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa9.91□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 AP4M1O00189 453 aa9.91□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 CNIH1O95406 144 aa9.91□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 ARG1P05089 322 aa9.91□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 ANKRD34CP0C6C1 535 aa9.91□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP9.91□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 ERHP84090 104 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 GABRG3Q99928 467 aa9.91□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa9.91□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa9.91□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 LOXL2Q9Y4K0 774 aa9.91□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 COL24A1Q17RW2 1714 aa9.91□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa9.91□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 A0A1W2PQD3 144 aa9.91□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 DVL1O14640 695 aa9.91□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa9.91□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 TMEM104Q8NE00 496 aa9.91□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 ISOC2Q96AB3 205 aa9.91□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 WDR13Q9H1Z4 485 aa9.91□□□□□ -0.82
SEMA4D-211ENST00000438547 A0A1W2PPH5 198 aa9.91□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.2 ms