RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437840.6

RGL2-238, Transcript of ral guanine nucleotide dissociation stimulator like 2, human

TSL 1 (best)

Gene RGL2, Length 2,687 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RGL2-238	ENST00000437840	ZNF124	Q15973	351 aa		12.9	□□□□□ -0.34
RGL2-238	ENST00000437840	KDF1	Q8NAX2	398 aa	Predicted RBP	12.9	□□□□□ -0.34
RGL2-238	ENST00000437840	SPACA9	Q96E40	222 aa	Predicted RBP	12.9	□□□□□ -0.34
RGL2-238	ENST00000437840	RASL10B	Q96S79	203 aa		12.9	□□□□□ -0.34
RGL2-238	ENST00000437840	CABIN1	Q9Y6J0	2220 aa		12.9	□□□□□ -0.34
RGL2-238	ENST00000437840	C5orf52	A6NGY3	159 aa		12.89	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	IGHV2-70	P01814	119 aa		12.89	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	S100A9	P06702	114 aa	Known RBP	12.89	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	DANCR	P0C864	163 aa		12.89	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	NR2C1	P13056	603 aa		12.89	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	LMO1	P25800	156 aa		12.89	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	SST	P61278	116 aa		12.89	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	TMEM187	Q14656	261 aa		12.89	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	HMGN3	Q15651	99 aa		12.89	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	TSC22D1	Q15714	1073 aa		12.89	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	RSPO4	Q2I0M5	234 aa	Predicted RBP	12.89	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	RNF212	Q495C1	297 aa		12.89	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	ZNF385C	Q66K41	422 aa	Predicted RBP	12.89	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	LCN10	Q6JVE6	187 aa		12.89	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	GALNT14	Q96FL9	552 aa		12.89	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	SPSB2	Q99619	263 aa		12.89	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	FAM212B	Q9NTI7	297 aa	Predicted RBP	12.89	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	TOX3	O15405	576 aa	Predicted RBP	12.89	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	DBH	P09172	617 aa		12.89	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	SEC11B	P0C7V7	166 aa		12.89	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	ZNF44	P15621	663 aa		12.89	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	PPT1	P50897	306 aa		12.89	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	PIGP	P57054	158 aa		12.89	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	OR51M1	Q9H341	326 aa		12.89	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	WFDC1	Q9HC57	220 aa		12.89	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	CHCHD2	Q9Y6H1	151 aa	Predicted RBP	12.89	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840		E5RGE8	158 aa		12.88	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840		M0R135	149 aa		12.88	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	TMEM225B	P0DP42	221 aa		12.88	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	AKR1C3	P42330	323 aa		12.88	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	GUCA1A	P43080	201 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	MIDN	Q504T8	468 aa		12.88	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	ASCC3	Q8N3C0	2202 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	COMMD1	Q8N668	190 aa		12.88	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	CCDC54	Q8NEL0	328 aa		12.88	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	FBXO17	Q96EF6	278 aa		12.88	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	ZNF799	Q96GE5	643 aa		12.88	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	ZNF385A	Q96PM9	386 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	OR6C1	Q96RD1	312 aa		12.88	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	NAA11	Q9BSU3	229 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	PARP12	Q9H0J9	701 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	ZNF581	Q9P0T4	197 aa		12.88	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	HSF4	Q9ULV5	492 aa		12.88	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	NSG2	Q9Y328	171 aa		12.88	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	TSPAN15	O95858	294 aa		12.88	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	KLK3	P07288	261 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	SNAI3	Q3KNW1	292 aa		12.88	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	PLXDC2	Q6UX71	529 aa		12.88	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	CLEC9A	Q6UXN8	241 aa		12.88	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	TMEM123	Q8N131	208 aa		12.88	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	LRTM2	Q8N967	370 aa		12.88	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	GINS3	Q9BRX5	216 aa		12.88	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	FAAP24	Q9BTP7	215 aa		12.88	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	NAA60	Q9H7X0	242 aa		12.88	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	TUBA4B	Q9H853	241 aa		12.88	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	AK3	Q9UIJ7	227 aa		12.88	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	SCRG1	O75711	98 aa		12.87	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	AGA	P20933	346 aa		12.87	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	DTYMK	P23919	212 aa		12.87	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	ACKR3	P25106	362 aa		12.87	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	SUCLG1	P53597	346 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	RRAD	P55042	308 aa		12.87	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	SP6	Q3SY56	376 aa		12.87	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	AWAT1	Q58HT5	328 aa		12.87	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	LRRC18	Q8N456	261 aa		12.87	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	RPS10P5	Q9NQ39	176 aa		12.87	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		12.87	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	MTCH2	Q9Y6C9	303 aa		12.87	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	UBE2C	O00762	179 aa		12.87	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	ONECUT2	O95948	504 aa		12.87	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	SCGB1D2	O95969	90 aa		12.87	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	MT-ND4L	P03901	98 aa		12.87	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	OR5AC1	P0C628	307 aa		12.87	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	SRF	P11831	508 aa		12.87	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	GUK1	Q16774	197 aa		12.87	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	TMEM156	Q8N614	296 aa		12.87	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	HPSE2	Q8WWQ2	592 aa		12.87	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	TAAR9	Q96RI9	348 aa		12.87	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	GPR173	Q9NS66	373 aa		12.87	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	KCNIP3	Q9Y2W7	256 aa		12.87	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	IGKV1-27	A0A075B6S5	117 aa		12.86	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	C7orf77	A4D0Y5	90 aa		12.86	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	C1orf196	B1AJZ1	125 aa		12.86	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840		H7C1Q1	480 aa		12.86	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	DHH	O43323	396 aa		12.86	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	ANGPTL7	O43827	346 aa		12.86	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	NME2P1	O60361	137 aa		12.86	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	OPRM1	P35372	400 aa		12.86	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	P2RY1	P47900	373 aa		12.86	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	LBX1	P52954	281 aa		12.86	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	MTCP1	P56278	107 aa		12.86	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	TAF9	Q16594	264 aa		12.86	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	C9orf152	Q5JTZ5	239 aa		12.86	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	ACER2	Q5QJU3	275 aa		12.86	□□□□□ -0.35
RGL2-238	ENST00000437840	PRAMEF20	Q5VT98	475 aa		12.86	□□□□□ -0.35

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 1247.4 ms