RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429798.1

LIMD1-AS1-202, LIMD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LIMD1-AS1, Length 955 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ETV7Q9Y603 341 aa8.68□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ROS1P08922 2347 aa8.68□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 A0A0G2JK05 382 aa8.67□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CLDN25C9JDP6 229 aa8.67□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 H3BUI4 141 aa8.67□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RGS5O15539 181 aa8.67□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SYNGR1O43759 233 aa8.67□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ANGPTL7O43827 346 aa8.67□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CDC14BO60729 498 aa8.67□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SCGNO76038 276 aa8.67□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HTR3BO95264 441 aa8.67□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CSF3P09919 207 aa8.67□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GTF2F2P13984 249 aa8.67□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DAOP14920 347 aa8.67□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GLRA1P23415 457 aa8.67□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 S100A5P33763 92 aa8.67□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ATP5J2P56134 94 aa8.67□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CLDN12P56749 244 aa8.67□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MPPED2Q15777 294 aa8.67□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KCNJ8Q15842 424 aa8.67□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CARTPTQ16568 116 aa8.67□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZNF181Q2M3W8 571 aa8.67□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZNF404Q494X3 552 aa8.67□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 WDR82Q6UXN9 313 aa8.67□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OR2W3Q7Z3T1 314 aa8.67□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NR2C2APQ86WQ0 139 aa8.67□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 POC1AQ8NBT0 407 aa8.67□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OR51D1Q8NGF3 324 aa8.67□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MCFD2Q8NI22 146 aa8.67□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LGALS14Q8TCE9 139 aa8.67□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GFI1Q99684 422 aa8.67□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TMEM59Q9BXS4 323 aa8.67□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TMEM106BQ9NUM4 274 aa8.67□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RASL12Q9NYN1 266 aa8.67□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IL36GQ9NZH8 169 aa8.67□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 METTL21EPA6NDL7 271 aa8.66□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OVOL3O00110 214 aa8.66□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 AKR7A2O43488 359 aa8.66□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RHBDL1O75783 438 aa8.66□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MPIG6BO95866 241 aa8.66□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 F12P00748 615 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HPXP02790 462 aa8.66□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PGA5P0DJD9 388 aa8.66□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PRKACAP17612 351 aa8.66□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 BCL3P20749 454 aa8.66□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CFHR2P36980 270 aa8.66□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TALDO1P37837 337 aa8.66□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GMFBP60983 142 aa8.66□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GUCA2AQ02747 115 aa8.66□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MICBQ29980 383 aa8.66□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CNPY1Q3B7I2 92 aa8.66□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa8.66□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZNF826PQ6ZT77 177 aa8.66□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LINC00596Q86U02 117 aa8.66□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FAM90A1Q86YD7 464 aa8.66□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FAM58AQ8N1B3 248 aa8.66□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OSR2Q8N2R0 312 aa8.66□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OR10K1Q8NGX5 313 aa8.66□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FAM46BQ96A09 425 aa8.66□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CHODLQ9H9P2 273 aa8.66□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PTTG2Q9NZH5 202 aa8.66□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 COMMD3Q9UBI1 195 aa8.66□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RAB22AQ9UL26 194 aa8.66□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SPATA2Q9UM82 520 aa8.66□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa8.66□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FASNP49327 2511 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa8.65□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ISPDA4D126 451 aa8.65□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NKX6-3A6NJ46 265 aa8.65□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FAM25AB3EWG3 89 aa8.65□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FAM25CB3EWG5 89 aa8.65□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FAM25GB3EWG6 89 aa8.65□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SRRM5B3KS81 715 aa8.65□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 VSIG8P0DPA2 414 aa8.65□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CD37P11049 281 aa8.65□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MGMTP16455 207 aa8.65□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RAB6AP20340 208 aa8.65□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CPT2P23786 658 aa8.65□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PDLIM4P50479 330 aa8.65□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ART1P52961 327 aa8.65□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FGF12P61328 243 aa8.65□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C2orf76Q3KRA6 126 aa8.65□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SPIN3Q5JUX0 258 aa8.65□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 UBE2NLQ5JXB2 153 aa8.65□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ELP2Q6IA86 826 aa8.65□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FAM166AQ6J272 317 aa8.65□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CLEC2AQ6UVW9 174 aa8.65□□□□□ -1.02
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ASCL4Q6XD76 172 aa8.65□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms