RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 G3V2T6 193 aa17.06■□□□□ 0.32
LIMS1-208ENST00000428064 TSPAN15O95858 294 aa17.06■□□□□ 0.32
LIMS1-208ENST00000428064 TK1P04183 234 aa17.06■□□□□ 0.32
LIMS1-208ENST00000428064 EPHA2P29317 976 aa17.06■□□□□ 0.32
LIMS1-208ENST00000428064 GABRA5P31644 462 aa17.06■□□□□ 0.32
LIMS1-208ENST00000428064 KIR2DS4P43632 304 aa17.06■□□□□ 0.32
LIMS1-208ENST00000428064 IL24Q13007 206 aa17.06■□□□□ 0.32
LIMS1-208ENST00000428064 DTX3Q8N9I9 347 aa17.06■□□□□ 0.32
LIMS1-208ENST00000428064 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
LIMS1-208ENST00000428064 NOTCH1P46531 2555 aa17.06■□□□□ 0.32
LIMS1-208ENST00000428064 TGP01266 2768 aa17.06■□□□□ 0.32
LIMS1-208ENST00000428064 M0R129 80 aa17.05■□□□□ 0.32
LIMS1-208ENST00000428064 EFNB2P52799 333 aa17.05■□□□□ 0.32
LIMS1-208ENST00000428064 ERVFRD-1P60508 538 aa17.05■□□□□ 0.32
LIMS1-208ENST00000428064 ASRGL1Q7L266 308 aa17.05■□□□□ 0.32
LIMS1-208ENST00000428064 OR4C13Q8NGP0 309 aa17.05■□□□□ 0.32
LIMS1-208ENST00000428064 PPP1R35Q8TAP8 253 aa17.05■□□□□ 0.32
LIMS1-208ENST00000428064 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
LIMS1-208ENST00000428064 VGLL3A8MV65 326 aa17.04■□□□□ 0.32
LIMS1-208ENST00000428064 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
LIMS1-208ENST00000428064 MITFO75030 526 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
LIMS1-208ENST00000428064 RBP4P02753 201 aa17.04■□□□□ 0.32
LIMS1-208ENST00000428064 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
LIMS1-208ENST00000428064 HERPUD1Q15011 391 aa17.04■□□□□ 0.32
LIMS1-208ENST00000428064 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa17.04■□□□□ 0.32
LIMS1-208ENST00000428064 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa17.04■□□□□ 0.32
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC54Q8NEL0 328 aa17.04■□□□□ 0.32
LIMS1-208ENST00000428064 OR2T27Q8NH04 317 aa17.04■□□□□ 0.32
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LIMS1-208ENST00000428064 SLC22A13Q9Y226 551 aa17.04■□□□□ 0.32
LIMS1-208ENST00000428064 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
LIMS1-208ENST00000428064 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa17.03■□□□□ 0.32
LIMS1-208ENST00000428064 C17orf98A8MV24 154 aa17.03■□□□□ 0.32
LIMS1-208ENST00000428064 K7N7A8 449 aa17.03■□□□□ 0.32
LIMS1-208ENST00000428064 KRT8P05787 483 aa17.03■□□□□ 0.32
LIMS1-208ENST00000428064 OR2T7P0C7T2 308 aa17.03■□□□□ 0.32
LIMS1-208ENST00000428064 CCL3L1P16619 93 aa17.03■□□□□ 0.32
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF273Q14593 569 aa17.03■□□□□ 0.32
LIMS1-208ENST00000428064 SSX6Q7RTT6 188 aa17.03■□□□□ 0.32
LIMS1-208ENST00000428064 CATSPERDQ86XM0 798 aa17.03■□□□□ 0.32
LIMS1-208ENST00000428064 OR4M1Q8NGD0 313 aa17.03■□□□□ 0.32
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LIMS1-208ENST00000428064 PLEKHA1Q9HB21 404 aa17.03■□□□□ 0.32
LIMS1-208ENST00000428064 SULT1C4O75897 302 aa17.02■□□□□ 0.32
LIMS1-208ENST00000428064 CSF1P09603 554 aa17.02■□□□□ 0.32
LIMS1-208ENST00000428064 FASP25445 335 aa17.02■□□□□ 0.32
LIMS1-208ENST00000428064 HTR1FP30939 366 aa17.02■□□□□ 0.32
LIMS1-208ENST00000428064 BMXP51813 675 aa17.02■□□□□ 0.32
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LIMS1-208ENST00000428064 LGALS4P56470 323 aa17.02■□□□□ 0.32
LIMS1-208ENST00000428064 BNIP1Q12981 228 aa17.02■□□□□ 0.32
LIMS1-208ENST00000428064 Q6ZTK2 550 aa17.02■□□□□ 0.32
LIMS1-208ENST00000428064 YIPF7Q8N8F6 280 aa17.02■□□□□ 0.32
LIMS1-208ENST00000428064 OR2T6Q8NHC8 308 aa17.02■□□□□ 0.32
LIMS1-208ENST00000428064 PIFOQ8TCI5 191 aa17.02■□□□□ 0.32
LIMS1-208ENST00000428064 CFHR4Q92496 578 aa17.02■□□□□ 0.32
LIMS1-208ENST00000428064 C10orf35Q96D05 121 aa17.02■□□□□ 0.32
LIMS1-208ENST00000428064 CDCA4Q9BXL8 241 aa17.02■□□□□ 0.32
LIMS1-208ENST00000428064 CHST5Q9GZS9 411 aa17.02■□□□□ 0.32
LIMS1-208ENST00000428064 FAM53CQ9NYF3 392 aa17.02■□□□□ 0.32
LIMS1-208ENST00000428064 OR14J1Q9UGF5 321 aa17.02■□□□□ 0.32
LIMS1-208ENST00000428064 SLC7A11Q9UPY5 501 aa17.02■□□□□ 0.32
LIMS1-208ENST00000428064 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.32
LIMS1-208ENST00000428064 A6NIN4 97 aa17.01■□□□□ 0.31
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF737O75373 536 aa17.01■□□□□ 0.31
LIMS1-208ENST00000428064 GATBO75879 557 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
LIMS1-208ENST00000428064 CHRM2P08172 466 aa17.01■□□□□ 0.31
LIMS1-208ENST00000428064 FCGR1AP12314 374 aa17.01■□□□□ 0.31
LIMS1-208ENST00000428064 TMED1Q13445 227 aa17.01■□□□□ 0.31
LIMS1-208ENST00000428064 LY6EQ16553 131 aa17.01■□□□□ 0.31
LIMS1-208ENST00000428064 ANGPTL5Q86XS5 388 aa17.01■□□□□ 0.31
LIMS1-208ENST00000428064 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
LIMS1-208ENST00000428064 CIB1Q99828 191 aa17.01■□□□□ 0.31
LIMS1-208ENST00000428064 GABARAPL3Q9BY60 117 aa17.01■□□□□ 0.31
LIMS1-208ENST00000428064 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa17.01■□□□□ 0.31
LIMS1-208ENST00000428064 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
LIMS1-208ENST00000428064 AP4S1Q9Y587 144 aa17.01■□□□□ 0.31
LIMS1-208ENST00000428064 A0A0G2JK05 382 aa17■□□□□ 0.31
LIMS1-208ENST00000428064 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
LIMS1-208ENST00000428064 MEGF11A6BM72 1044 aa17■□□□□ 0.31
LIMS1-208ENST00000428064 METTL15A6NJ78 407 aa17■□□□□ 0.31
LIMS1-208ENST00000428064 ODF3BA8MYP8 253 aa17■□□□□ 0.31
LIMS1-208ENST00000428064 SYT7O43581 403 aa17■□□□□ 0.31
LIMS1-208ENST00000428064 RPP14O95059 124 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
LIMS1-208ENST00000428064 FUT6P51993 359 aa17■□□□□ 0.31
LIMS1-208ENST00000428064 COL10A1Q03692 680 aa17■□□□□ 0.31
LIMS1-208ENST00000428064 UBE2V2Q15819 145 aa17■□□□□ 0.31
LIMS1-208ENST00000428064 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
LIMS1-208ENST00000428064 CEP19Q96LK0 163 aa17■□□□□ 0.31
LIMS1-208ENST00000428064 MTCH1Q9NZJ7 389 aa17■□□□□ 0.31
LIMS1-208ENST00000428064 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa16.99■□□□□ 0.31
LIMS1-208ENST00000428064 CHST1O43916 411 aa16.99■□□□□ 0.31
LIMS1-208ENST00000428064 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF728P0DKX0 622 aa16.99■□□□□ 0.31
LIMS1-208ENST00000428064 COX7A1P24310 79 aa16.99■□□□□ 0.31
LIMS1-208ENST00000428064 RASSF2P50749 326 aa16.99■□□□□ 0.31
LIMS1-208ENST00000428064 ISL1P61371 349 aa16.99■□□□□ 0.31
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF626Q68DY1 528 aa16.99■□□□□ 0.31
LIMS1-208ENST00000428064 OR8H2Q8N162 312 aa16.99■□□□□ 0.31
LIMS1-208ENST00000428064 BATF2Q8N1L9 274 aa16.99■□□□□ 0.31
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