RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366959.4

RPS6KC1-201, Transcript of ribosomal protein S6 kinase C1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 2 BASIC

Gene RPS6KC1, Length 5,454 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1-201ENST00000366959 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa12.71□□□□□ -0.37
RPS6KC1-201ENST00000366959 NGFP01138 241 aa12.71□□□□□ -0.37
RPS6KC1-201ENST00000366959 RAB35Q15286 201 aa12.71□□□□□ -0.37
RPS6KC1-201ENST00000366959 ACSM6Q6P461 480 aa12.71□□□□□ -0.37
RPS6KC1-201ENST00000366959 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
RPS6KC1-201ENST00000366959 OR2Z1Q8NG97 314 aa12.71□□□□□ -0.37
RPS6KC1-201ENST00000366959 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
RPS6KC1-201ENST00000366959 RAB18Q9NP72 206 aa12.71□□□□□ -0.37
RPS6KC1-201ENST00000366959 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa12.71□□□□□ -0.37
RPS6KC1-201ENST00000366959 TRAV20A0A0B4J274 112 aa12.71□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 MBTPS2O43462 519 aa12.71□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 ERVFC1-1P60608 527 aa12.71□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 LINC00052Q96N35 136 aa12.71□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 NTMQ9P121 344 aa12.71□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 FOXL2P58012 376 aa12.71□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 Q7L0L9 218 aa12.71□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 TIMD4Q96H15 378 aa12.71□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa12.7□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 DBX1A6NMT0 343 aa12.7□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 LANCL1O43813 399 aa12.7□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 IGHV3-43DP0DP04 118 aa12.7□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 GALNSP34059 522 aa12.7□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 ZNF141Q15928 474 aa12.7□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 MMP26Q9NRE1 261 aa12.7□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 CKAP5Q14008 2032 aa12.7□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa12.7□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 MESP2Q0VG99 397 aa12.7□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 FUT7Q11130 342 aa12.7□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 MESTQ5EB52 335 aa12.7□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 ANKRD37Q7Z713 158 aa12.7□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 NHSQ6T4R5 1651 aa12.7□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 TAAR6Q96RI8 345 aa12.7□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 WDR13Q9H1Z4 485 aa12.7□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 MTCH2Q9Y6C9 303 aa12.7□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 FIGNL2A6NMB9 653 aa12.7□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 SOCS1O15524 211 aa12.7□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 FABP1P07148 127 aa12.7□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 STUMQ69YW2 141 aa12.7□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 DEGS2Q6QHC5 323 aa12.7□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 NPEPL1Q8NDH3 523 aa12.7□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 FBXO17Q96EF6 278 aa12.7□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 UCK1Q9HA47 277 aa12.7□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 KIAA1456Q9P272 454 aa12.7□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 CACNG5Q9UF02 275 aa12.7□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 TMED3Q9Y3Q3 217 aa12.7□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 A0A1W2PNV4 684 aa12.69□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 COX7A2P2O60397 106 aa12.69□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 FCGR3BO75015 233 aa12.69□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 GNG10P50151 68 aa12.69□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP12.69□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 ZNF79Q15937 498 aa12.69□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa12.69□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 ANGPTL6Q8NI99 470 aa12.69□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 FAM122AQ96E09 287 aa12.69□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 PSG11Q9UQ72 335 aa12.69□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa12.69□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa12.69□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 DAOP14920 347 aa12.69□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 IP6K3Q96PC2 410 aa12.69□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 UQCC1Q9NVA1 299 aa12.69□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa12.69□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa12.69□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 PMCHP20382 165 aa12.69□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 TMEM33P57088 247 aa12.69□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 UQCC3Q6UW78 93 aa12.69□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 OR11H7Q8NGC8 314 aa12.69□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 OR10D3Q8NH80 312 aa12.69□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 TMEM9BQ9NQ34 198 aa12.69□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa12.69□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa12.69□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 OPN1MWP04001 364 aa12.69□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 HEXAP06865 529 aa12.69□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 OPN1MW2P0DN77 364 aa12.69□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 OPN1MW3P0DN78 364 aa12.69□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 ACER2Q5QJU3 275 aa12.69□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 OR2C3Q8N628 320 aa12.69□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 OR8B12Q8NGG6 310 aa12.69□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 NUBPLQ8TB37 319 aa12.69□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 ZNRF4Q8WWF5 429 aa12.69□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 ISOC2Q96AB3 205 aa12.69□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 GPR137Q96N19 417 aa12.69□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa12.68□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa12.68□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 HSBP1O75506 76 aa12.68□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 LPAR6P43657 344 aa12.68□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 FFAR4Q5NUL3 377 aa12.68□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 TMEM230Q96A57 120 aa12.68□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 TECTBQ96PL2 329 aa12.68□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 LRFN3Q9BTN0 628 aa12.68□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 RSRP1Q9BUV0 290 aa12.68□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 AKAP6Q13023 2319 aa12.68□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 STRCQ7RTU9 1775 aa12.68□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 IGF2P01344 180 aa12.68□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 ARG1P05089 322 aa12.68□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 SLC25A22Q9H936 323 aa12.68□□□□□ -0.38
RPS6KC1-201ENST00000366959 COL4A1P02462 1669 aa12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.6 ms