RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000324659.12

NLRC3-201, Transcript of NLR family CARD domain containing 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NLRC3, Length 3,414 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC3-201ENST00000324659 SP6Q3SY56 376 aa10.6□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 REC114Q7Z4M0 266 aa10.6□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 UEVLDQ8IX04 471 aa10.6□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 TOMM40LQ969M1 308 aa10.6□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 DEFB126Q9BYW3 111 aa10.6□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 OR10A2Q9H208 303 aa10.6□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 TIAF1O95411 115 aa10.6□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 CSTBP04080 98 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 CHRM2P08172 466 aa10.6□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 GABREP78334 506 aa10.6□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 MIDNQ504T8 468 aa10.6□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 DEGS2Q6QHC5 323 aa10.6□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 LRRC18Q8N456 261 aa10.6□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 SLC38A9Q8NBW4 561 aa10.6□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 OR56B1Q8NGI3 324 aa10.6□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 SLC5A7Q9GZV3 580 aa10.6□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 RAB18Q9NP72 206 aa10.6□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa10.59□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 PPP1R2P9O14990 202 aa10.59□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 CD37P11049 281 aa10.59□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 FHITP49789 147 aa10.59□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 CCL7P80098 99 aa10.59□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 ACY1Q03154 408 aa10.59□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa10.59□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 AADACL3Q5VUY0 350 aa10.59□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 C6orf201Q7Z4U5 140 aa10.59□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa10.59□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 C2orf50Q96LR7 162 aa10.59□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 SLC26A1Q9H2B4 701 aa10.59□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 KLHL13Q9P2N7 655 aa10.59□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa10.59□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 LIPT2A6NK58 231 aa10.59□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 FAHP16930 419 aa10.59□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 FPR2P25090 351 aa10.59□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 RBMXP38159 391 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 ZNF343Q6P1L6 599 aa10.59□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 SPNS3Q6ZMD2 512 aa10.59□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 PGAM5Q96HS1 289 aa10.59□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 TMEM68Q96MH6 324 aa10.59□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 EGLN1Q9GZT9 426 aa10.59□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 B3GAT1Q9P2W7 334 aa10.59□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 FBXL17Q9UF56 701 aa10.59□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa10.59□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 K7EPK0 472 aa10.59□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 XRCC2O43543 280 aa10.59□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 C1QL1O75973 258 aa10.59□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 HPNP05981 417 aa10.59□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 TBPP20226 339 aa10.59□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 HOXA5P20719 270 aa10.59□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 PCP4P48539 62 aa10.59□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 C17orf67Q0P5P2 114 aa10.59□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 OR8G1Q15617 311 aa10.59□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 GUK1Q16774 197 aa10.59□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 PCK2Q16822 640 aa10.59□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 BRICD5Q6PL45 260 aa10.59□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 SPEM1Q8N4L4 309 aa10.59□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa10.59□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 PRDM13Q9H4Q3 707 aa10.59□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
NLRC3-201ENST00000324659 ANKUB1A6NFN9 424 aa10.58□□□□□ -0.72
NLRC3-201ENST00000324659 SCGNO76038 276 aa10.58□□□□□ -0.72
NLRC3-201ENST00000324659 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
NLRC3-201ENST00000324659 FCGR2AP12318 317 aa10.58□□□□□ -0.72
NLRC3-201ENST00000324659 ZNF17P17021 662 aa10.58□□□□□ -0.72
NLRC3-201ENST00000324659 MPZP25189 248 aa10.58□□□□□ -0.72
NLRC3-201ENST00000324659 RPL12P30050 165 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
NLRC3-201ENST00000324659 FCGR2CP31995 323 aa10.58□□□□□ -0.72
NLRC3-201ENST00000324659 OPRM1P35372 400 aa10.58□□□□□ -0.72
NLRC3-201ENST00000324659 PTGER4P35408 488 aa10.58□□□□□ -0.72
NLRC3-201ENST00000324659 ASCL1P50553 236 aa10.58□□□□□ -0.72
NLRC3-201ENST00000324659 SPCS3P61009 180 aa10.58□□□□□ -0.72
NLRC3-201ENST00000324659 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
NLRC3-201ENST00000324659 NAAAQ02083 359 aa10.58□□□□□ -0.72
NLRC3-201ENST00000324659 TSPO2Q5TGU0 170 aa10.58□□□□□ -0.72
NLRC3-201ENST00000324659 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
NLRC3-201ENST00000324659 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
NLRC3-201ENST00000324659 SRPK3Q9UPE1 567 aa10.58□□□□□ -0.72
NLRC3-201ENST00000324659 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa10.58□□□□□ -0.72
NLRC3-201ENST00000324659 FAM221AA4D161 298 aa10.58□□□□□ -0.72
NLRC3-201ENST00000324659 IFITM10A6NMD0 228 aa10.58□□□□□ -0.72
NLRC3-201ENST00000324659 OR2J2O76002 312 aa10.58□□□□□ -0.72
NLRC3-201ENST00000324659 DIRAS3O95661 229 aa10.58□□□□□ -0.72
NLRC3-201ENST00000324659 IGHG1P01857 330 aa10.58□□□□□ -0.72
NLRC3-201ENST00000324659 CAMLGP49069 296 aa10.58□□□□□ -0.72
NLRC3-201ENST00000324659 FXYD4P59646 89 aa10.58□□□□□ -0.72
NLRC3-201ENST00000324659 KISS1Q15726 138 aa10.58□□□□□ -0.72
NLRC3-201ENST00000324659 C20orf196Q8IYI0 205 aa10.58□□□□□ -0.72
NLRC3-201ENST00000324659 BATF2Q8N1L9 274 aa10.58□□□□□ -0.72
NLRC3-201ENST00000324659 CHST5Q9GZS9 411 aa10.58□□□□□ -0.72
NLRC3-201ENST00000324659 PARPBPQ9NWS1 579 aa10.58□□□□□ -0.72
NLRC3-201ENST00000324659 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa10.58□□□□□ -0.72
NLRC3-201ENST00000324659 DNAJB11Q9UBS4 358 aa10.58□□□□□ -0.72
NLRC3-201ENST00000324659 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa10.58□□□□□ -0.72
NLRC3-201ENST00000324659 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms