RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 MT-ND4P03905 459 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 AKAIN1P0CW23 69 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 GNB3P16520 340 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 CA6P23280 308 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 HAAOP46952 286 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF83P51522 516 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 GPM6AP51674 278 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 BTG1P62324 171 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 NAAAQ02083 359 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC25A26Q70HW3 274 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 LIX1LQ8IVB5 337 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 OSR2Q8N2R0 312 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF611Q8N823 705 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 SPERTQ8NA61 448 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM229BQ8NBD8 167 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 OR10K1Q8NGX5 313 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 CCDC120Q96HB5 630 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 NICN1Q9BSH3 213 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 RTL8AQ9BWD3 113 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 POFUT1Q9H488 388 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM100Q9NV29 134 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 NPAP1Q9NZP6 1156 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A1W2PP11 408 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 TRAPPC2LH3BP13 241 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 M0R1B8 84 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 PPP3CBP16298 524 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 RAG2P55895 527 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM50BP56557 158 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 MZT1Q08AG7 82 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 PSG7Q13046 419 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 ARFRP1Q13795 201 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 AGAP6Q5VW22 663 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 OLFML2AQ68BL7 652 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 ELP2Q6IA86 826 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 STEAP1BQ6NZ63 245 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 FJX1Q86VR8 437 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 Q8NFD4 153 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 OR8G5Q8NG78 346 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 OR56B4Q8NH76 319 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 Q96M66 194 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 PLK3Q9H4B4 646 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 RHOFQ9HBH0 211 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 NGBQ9NPG2 151 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 IFT46Q9NQC8 304 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP8.65□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 JKAMPQ9P055 326 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 HSF4Q9ULV5 492 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 MEMO1Q9Y316 297 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 SPTA1P02549 2419 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGGTB-201ENST00000319942 VSTM5A8MXK1 200 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-201ENST00000319942 CA11O75493 328 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-201ENST00000319942 RAB3DO95716 219 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-201ENST00000319942 TBPP20226 339 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-201ENST00000319942 KITLGP21583 273 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-201ENST00000319942 GABRR1P24046 479 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-201ENST00000319942 HLA-DMAP28067 261 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-201ENST00000319942 CA7P43166 264 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-201ENST00000319942 FABP6P51161 128 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-201ENST00000319942 SELENOVP59797 346 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-201ENST00000319942 RPS23P62266 143 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-201ENST00000319942 MEF2DQ14814 521 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-201ENST00000319942 C11orf91Q3C1V1 193 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-201ENST00000319942 PLAC9Q5JTB6 97 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-201ENST00000319942 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-201ENST00000319942 BTN2A1Q7KYR7 527 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF554Q86TJ5 538 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-201ENST00000319942 FBXL14Q8N1E6 418 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-201ENST00000319942 OR13G1Q8NGZ3 307 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-201ENST00000319942 HPSE2Q8WWQ2 592 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-201ENST00000319942 LRRC46Q96FV0 321 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-201ENST00000319942 DMRTA2Q96SC8 542 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-201ENST00000319942 PKIBQ9C010 78 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-201ENST00000319942 NUDT15Q9NV35 164 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-201ENST00000319942 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-201ENST00000319942 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-201ENST00000319942 ST3GAL6Q9Y274 331 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-201ENST00000319942 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-201ENST00000319942 NCOR2Q9Y618 2525 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-201ENST00000319942 IGF2RP11717 2491 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A0A6YYD4 124 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-201ENST00000319942 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-201ENST00000319942 MEIS3P1A6NDR6 274 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM90A10PA6NDY2 464 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM90A18PA6NE21 464 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM90A16PA6NEW6 464 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa8.64□□□□□ -1.03
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