RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262460.4

GINS1-201, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS1, Length 3,249 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-201ENST00000262460 OR8U9P0C7N5 309 aa7.54□□□□□ -1.2
GINS1-201ENST00000262460 CALCRP30988 508 aa7.54□□□□□ -1.2
GINS1-201ENST00000262460 CARD18P57730 90 aa7.54□□□□□ -1.2
GINS1-201ENST00000262460 PSG4Q00888 419 aa7.54□□□□□ -1.2
GINS1-201ENST00000262460 IKZF1Q13422 519 aa7.54□□□□□ -1.2
GINS1-201ENST00000262460 MST1LQ2TV78 715 aa7.54□□□□□ -1.2
GINS1-201ENST00000262460 SPATA46Q5T0L3 261 aa7.54□□□□□ -1.2
GINS1-201ENST00000262460 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa7.54□□□□□ -1.2
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GINS1-201ENST00000262460 SKA3Q8IX90 412 aa7.54□□□□□ -1.2
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GINS1-201ENST00000262460 OR8U1Q8NH10 309 aa7.54□□□□□ -1.2
GINS1-201ENST00000262460 OR10D3Q8NH80 312 aa7.54□□□□□ -1.2
GINS1-201ENST00000262460 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
GINS1-201ENST00000262460 THRSPQ92748 146 aa7.54□□□□□ -1.2
GINS1-201ENST00000262460 IMMP1LQ96LU5 166 aa7.54□□□□□ -1.2
GINS1-201ENST00000262460 CALHM2Q9HA72 323 aa7.54□□□□□ -1.2
GINS1-201ENST00000262460 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP7.54□□□□□ -1.2
GINS1-201ENST00000262460 SLC2A8Q9NY64 477 aa7.54□□□□□ -1.2
GINS1-201ENST00000262460 PISDQ9UG56 409 aa7.54□□□□□ -1.2
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GINS1-201ENST00000262460 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
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GINS1-201ENST00000262460 ONECUT2O95948 504 aa7.53□□□□□ -1.2
GINS1-201ENST00000262460 SLC25A4P12235 298 aa7.53□□□□□ -1.2
GINS1-201ENST00000262460 ZNF708P17019 499 aa7.53□□□□□ -1.2
GINS1-201ENST00000262460 GDF1P27539 372 aa7.53□□□□□ -1.2
GINS1-201ENST00000262460 FCGR2CP31995 323 aa7.53□□□□□ -1.2
GINS1-201ENST00000262460 NHLH2Q02577 135 aa7.53□□□□□ -1.2
GINS1-201ENST00000262460 GGNBP1Q5YKI7 109 aa7.53□□□□□ -1.2
GINS1-201ENST00000262460 C5orf46Q6UWT4 87 aa7.53□□□□□ -1.2
GINS1-201ENST00000262460 SULF2Q8IWU5 870 aa7.53□□□□□ -1.2
GINS1-201ENST00000262460 PRR18Q8N4B5 295 aa7.53□□□□□ -1.2
GINS1-201ENST00000262460 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
GINS1-201ENST00000262460 EDAQ92838 391 aa7.53□□□□□ -1.2
GINS1-201ENST00000262460 ISOC2Q96AB3 205 aa7.53□□□□□ -1.2
GINS1-201ENST00000262460 SLC26A1Q9H2B4 701 aa7.53□□□□□ -1.2
GINS1-201ENST00000262460 LDAHQ9H6V9 325 aa7.53□□□□□ -1.2
GINS1-201ENST00000262460 PILRBQ9UKJ0 227 aa7.53□□□□□ -1.2
GINS1-201ENST00000262460 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
GINS1-201ENST00000262460 MED12LQ86YW9 2145 aa7.53□□□□□ -1.2
GINS1-201ENST00000262460 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
GINS1-201ENST00000262460 ZXDAP98168 799 aa7.53□□□□□ -1.2
GINS1-201ENST00000262460 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
GINS1-201ENST00000262460 ECH1Q13011 328 aa7.53□□□□□ -1.2
GINS1-201ENST00000262460 CLINT1Q14677 625 aa7.53□□□□□ -1.2
GINS1-201ENST00000262460 TSC22D1Q15714 1073 aa7.53□□□□□ -1.2
GINS1-201ENST00000262460 SLC25A26Q70HW3 274 aa7.53□□□□□ -1.2
GINS1-201ENST00000262460 AAED1Q7RTV5 226 aa7.53□□□□□ -1.2
GINS1-201ENST00000262460 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
GINS1-201ENST00000262460 DTWD2Q8NBA8 298 aa7.53□□□□□ -1.2
GINS1-201ENST00000262460 OR10AD1Q8NGE0 317 aa7.53□□□□□ -1.2
GINS1-201ENST00000262460 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
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GINS1-201ENST00000262460 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
GINS1-201ENST00000262460 PCNX1Q96RV3 2341 aa7.53□□□□□ -1.2
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GINS1-201ENST00000262460 CHRM2P08172 466 aa7.52□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 FAM157CP0CG43 387 aa7.52□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 ADH6P28332 368 aa7.52□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 ZNF616Q08AN1 781 aa7.52□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 PLCXD3Q63HM9 321 aa7.52□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 FAM180AQ6UWF9 173 aa7.52□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 C17orf78Q8N4C9 275 aa7.52□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 SECTM1Q8WVN6 248 aa7.52□□□□□ -1.21
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GINS1-201ENST00000262460 PTX4Q96A99 478 aa7.52□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 ST3GAL6Q9Y274 331 aa7.52□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa7.52□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 WISP2O76076 250 aa7.52□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 MSX1P28360 303 aa7.52□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 PPT1P50897 306 aa7.52□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 TMEM33P57088 247 aa7.52□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
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GINS1-201ENST00000262460 AGBL5Q8NDL9 886 aa7.52□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 HAS2Q92819 552 aa7.52□□□□□ -1.21
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GINS1-201ENST00000262460 AKR1E2Q96JD6 320 aa7.52□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 CHST5Q9GZS9 411 aa7.52□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 ZNF442Q9H7R0 627 aa7.52□□□□□ -1.21
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GINS1-201ENST00000262460 AKAP13Q12802 2813 aa7.52□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 HKR1P10072 659 aa7.52□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 TPT1P13693 172 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 KCNJ3P48549 501 aa7.52□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 GRB2P62993 217 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 SLC25A53Q5H9E4 307 aa7.52□□□□□ -1.21
GINS1-201ENST00000262460 PMS2CLQ68D20 193 aa7.52□□□□□ -1.21
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