RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243108.4

HOXC6-201, Transcript of homeobox C6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXC6, Length 1,733 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC6-201ENST00000243108 NUDT15Q9NV35 164 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 POU2F3Q9UKI9 436 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 PIGLQ9Y2B2 252 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 METTL21EPA6NDL7 271 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 RNF223E7ERA6 249 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 CCR6P51684 374 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 UBE2V2Q15819 145 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 AWAT2Q6E213 333 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 MUC15Q8N387 334 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 SPACA5Q96QH8 159 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 SCPEP1Q9HB40 452 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 B3GNT2Q9NY97 397 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 TAS2R8Q9NYW2 309 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 HIVEP2P31629 2446 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 ABCA1O95477 2261 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 SONP18583 2426 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 JMJD1CQ15652 2540 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 RAB27BO00194 218 aa14.83□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 GMDSO60547 372 aa14.83□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 SCGNO76038 276 aa14.83□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 UBBP0CG47 229 aa14.83□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 ACKR3P25106 362 aa14.83□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 ALDH3B1P43353 468 aa14.83□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 FABP6P51161 128 aa14.83□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 MOGAT2Q3SYC2 334 aa14.83□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 TMEM255AQ5JRV8 349 aa14.83□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 COLCA1Q6ZS62 124 aa14.83□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa14.83□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 OR2AE1Q8NHA4 323 aa14.83□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 UBASH3BQ8TF42 649 aa14.83□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 FAM46BQ96A09 425 aa14.83□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 ST6GAL2Q96JF0 529 aa14.83□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 CBLN4Q9NTU7 201 aa14.83□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 ATP23Q9Y6H3 246 aa14.83□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 C7orf66A4D0T2 115 aa14.83□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 LPLP06858 475 aa14.83□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 CSF1P09603 554 aa14.83□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 OR3A4PP47883 348 aa14.83□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 GSK3AP49840 483 aa14.83□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 GUCA2AQ02747 115 aa14.83□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa14.83□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 SPSB4Q96A44 273 aa14.83□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 SEH1LQ96EE3 360 aa14.83□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 OBP2BQ9NPH6 170 aa14.83□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa14.82□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 DHFRP00374 187 aa14.82□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 CELA3BP08861 270 aa14.82□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 ARR3P36575 388 aa14.82□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa14.82□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 KISS1Q15726 138 aa14.82□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 MST1LQ2TV78 715 aa14.82□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa14.82□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 DPPA2Q7Z7J5 298 aa14.82□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 KCNG3Q8TAE7 436 aa14.82□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 AQP3Q92482 292 aa14.82□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 ITFG2Q969R8 447 aa14.82□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 GHRLQ9UBU3 117 aa14.82□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 CUBNO60494 3623 aa14.82□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 TRAV6A0A075B6T7 132 aa14.81□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 LOC100509620A0A075B734 347 aa14.81□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 XRCC2O43543 280 aa14.81□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 IGLV1-44P01699 117 aa14.81□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 HLA-HP01893 362 aa14.81□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 MELTFP08582 738 aa14.81□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 CECR9P0C854 216 aa14.81□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 NAT2P11245 290 aa14.81□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 CALCRP30988 508 aa14.81□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 ACTBP60709 375 aa14.81□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 ACTG1P63261 375 aa14.81□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 PCGF3Q3KNV8 242 aa14.81□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF260Q3ZCT1 412 aa14.81□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 TMEM42Q69YG0 159 aa14.81□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF101Q8IZC7 436 aa14.81□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 FBXL14Q8N1E6 418 aa14.81□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 OR56B4Q8NH76 319 aa14.81□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 GPER1Q99527 375 aa14.81□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 GAL3ST1Q99999 423 aa14.81□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 REG4Q9BYZ8 158 aa14.81□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 NOX3Q9HBY0 568 aa14.81□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF221Q9UK13 617 aa14.81□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 IGKV3-15P01624 115 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 H2AFB2P0C5Z0 115 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 FAUP35544 74 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 PTGFRP43088 359 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 RAB25P57735 213 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 FAM3AP98173 230 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 OR8B8Q15620 311 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXC6-201ENST00000243108 ATAD3CQ5T2N8 411 aa14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56 ms