RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619245.1

ACACA-244, Transcript of acetyl-CoA carboxylase alpha, human

TSL 3

Gene ACACA, Length 635 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACACA-244	ENST00000619245	C11orf42	Q8N5U0	333 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	DPP10	Q8N608	796 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	OR13C2	Q8NGS9	318 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	OR13D1	Q8NGV5	346 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	OR4Q3	Q8NH05	313 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	OR5K1	Q8NHB7	308 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	SLC26A7	Q8TE54	656 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	RPL3L	Q92901	407 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	BPIFA2	Q96DR5	249 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	RNFT2	Q96EX2	444 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	ZNF799	Q96GE5	643 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	EBF4	Q9BQW3	602 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	PPP1R3E	Q9H7J1	279 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	LIN7B	Q9HAP6	207 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	PLGRKT	Q9HBL7	147 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	THAP1	Q9NVV9	213 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	RHBDL2	Q9NX52	303 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	VNN3	Q9NY84	501 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	ZIM2	Q9NZV7	527 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	NLK	Q9UBE8	527 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	LYVE1	Q9Y5Y7	322 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	IGKV1D-17	A0A075B6S4	117 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	IGLV1-36	A0A0B4J1U3	117 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	OR2AT4	A6NND4	320 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	EFCAB9	A8MZ26	197 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	SOCS2	O14508	198 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	MAGEB3	O15480	346 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	TIPRL	O75663	272 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	OR5F1	O95221	314 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	PGA5	P0DJD9	388 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	KIT	P10721	976 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	SLC2A1	P11166	492 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	PPIB	P23284	216 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	GLRA1	P23415	457 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	HSPA13	P48723	471 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	SPIB	Q01892	262 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	STX3	Q13277	289 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	GK3P	Q14409	553 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	SEC23B	Q15437	767 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	CYP51A1	Q16850	503 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	RFX4	Q33E94	735 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	FAM27D1	Q5T7N8	215 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	ZNF626	Q68DY1	528 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	ZFP1	Q6P2D0	407 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	KCTD8	Q6ZWB6	473 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	C16orf82	Q7Z2V1	217 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	TSEN54	Q7Z6J9	526 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	PATL1	Q86TB9	770 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	OAF	Q86UD1	273 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	NRM	Q8IXM6	262 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	C11orf65	Q8NCR3	313 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	OR2AJ1	Q8NGZ0	328 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	OR8U1	Q8NH10	309 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	TAMM41	Q96BW9	452 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	TSSK2	Q96PF2	358 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	NEURL2	Q9BR09	285 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	SPATA25	Q9BR10	227 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	NUAK2	Q9H093	628 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	ZFP57	Q9NU63	452 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	VAPA	Q9P0L0	249 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	DYNC1H1	Q14204	4646 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	KMT2A	Q03164	3969 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	SORL1	Q92673	2214 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	HTR3E	A5X5Y0	456 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	SERPINE3	A8MV23	424 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	FAM90A22P	A8MWA6	464 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	EVPLL	A8MZ36	301 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	SLC22A2	O15244	555 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	TBX1	O43435	398 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	OR2F2	O95006	317 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	AMY1A	P04745	511 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	AMY2A	P04746	511 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	CD14	P08571	375 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	PSG2	P11465	335 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	COX4I1	P13073	169 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	GP9	P14770	177 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	SPN	P16150	400 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	GPR4	P46093	362 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	SLC7A2	P52569	658 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	KLF10	Q13118	480 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	TMED1	Q13445	227 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	FHL1	Q13642	323 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	SNAPC1	Q16533	368 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	PAGE3	Q5JUK9	113 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	LRIF1	Q5T3J3	769 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	METTL21C	Q5VZV1	264 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	ZNF770	Q6IQ21	691 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	EPGN	Q6UW88	154 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	CCDC80	Q76M96	950 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	THAP5	Q7Z6K1	395 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	LINC00471	Q8N535	108 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	RPP25L	Q8N5L8	163 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ACACA-244	ENST00000619245	OR10Z1	Q8NGY1	313 aa		4.54	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms