RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607519.1

GMDS-AS1-216, humanhuman

TSL 4

Gene GMDS-AS1, Length 579 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SONP18583 2426 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa8.8□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa8.8□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 OR5B21A6NL26 309 aa8.8□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TMEM210A6NLX4 147 aa8.8□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SULT1B1O43704 296 aa8.8□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 LHBP01229 141 aa8.8□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CD2P06729 351 aa8.8□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CLEC2LP0C7M8 214 aa8.8□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SRMP19623 302 aa8.8□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PRKACBP22694 351 aa8.8□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 GIFP27352 417 aa8.8□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 BDKRB2P30411 391 aa8.8□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 IL2RGP31785 369 aa8.8□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 NR4A2P43354 598 aa8.8□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 NPBWR2P48146 333 aa8.8□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ALDH3B2P48448 385 aa8.8□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ATP1B3P54709 279 aa8.8□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 LSM3P62310 102 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 LYPD2Q6UXB3 125 aa8.8□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SLC25A26Q70HW3 274 aa8.8□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 OR11L1Q8NGX0 322 aa8.8□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 Q8TCH9 128 aa8.8□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ITFG2Q969R8 447 aa8.8□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 BORCS8Q96FH0 119 aa8.8□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa8.8□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CENPOQ9BU64 300 aa8.8□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TMEM165Q9HC07 324 aa8.8□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ABCB9Q9NP78 766 aa8.8□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 DLL4Q9NR61 685 aa8.8□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MTCH1Q9NZJ7 389 aa8.8□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 IL36RNQ9UBH0 155 aa8.8□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 WIPI2Q9Y4P8 454 aa8.8□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 NPTNQ9Y639 398 aa8.8□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MTORP42345 2549 aa8.79□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 A0A096LNT2 108 aa8.79□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa8.79□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 A0A1B0GW55 424 aa8.79□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 H7C1Q1 480 aa8.79□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 J3QT63 122 aa8.79□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ALX3O95076 343 aa8.79□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CDRT1O95170 752 aa8.79□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 IGHV2-70P01814 119 aa8.79□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 GYPAP02724 150 aa8.79□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 DUX4L2P0CJ85 424 aa8.79□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 DUX4L3P0CJ86 424 aa8.79□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 DUX4L4P0CJ87 422 aa8.79□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 DUX4L5P0CJ88 424 aa8.79□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 DUX4L6P0CJ89 424 aa8.79□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 DUX4L7P0CJ90 424 aa8.79□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 AMY2BP19961 511 aa8.79□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 BCL3P20749 454 aa8.79□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CALRP27797 417 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 OR3A4PP47883 348 aa8.79□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 RBP2P50120 134 aa8.79□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CAV3P56539 151 aa8.79□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TMEM33P57088 247 aa8.79□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 OR10A3P58181 314 aa8.79□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ZP1P60852 638 aa8.79□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PPP3R1P63098 170 aa8.79□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MZT1Q08AG7 82 aa8.79□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PDZK1IP1Q13113 114 aa8.79□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KISS1Q15726 138 aa8.79□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 HSD17B12Q53GQ0 312 aa8.79□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 DDI2Q5TDH0 399 aa8.79□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SHEQ5VZ18 495 aa8.79□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa8.79□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PRSS57Q6UWY2 283 aa8.79□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 LYPD6Q86Y78 171 aa8.79□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ZNF573Q86YE8 665 aa8.79□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 FGFRL1Q8N441 504 aa8.79□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 OR13F1Q8NGS4 319 aa8.79□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 OR10K1Q8NGX5 313 aa8.79□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 REG4Q9BYZ8 158 aa8.79□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 DUX4Q9UBX2 424 aa8.79□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 STUB1Q9UNE7 303 aa8.79□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ING4Q9UNL4 249 aa8.79□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 FOXJ3Q9UPW0 622 aa8.79□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa8.79□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PPIAL4EA0A075B759 164 aa8.78□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ISPDA4D126 451 aa8.78□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CLDN25C9JDP6 229 aa8.78□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PPIAL4DF5H284 164 aa8.78□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 FCN3O75636 299 aa8.78□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ALDOBP05062 364 aa8.78□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PGA5P0DJD9 388 aa8.78□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PPIAL4FP0DN26 164 aa8.78□□□□□ -1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TMEM225BP0DP42 221 aa8.78□□□□□ -1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.9 ms