RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560934.1

LINS1-210, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 4

Gene LINS1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-210	ENST00000560934	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	TSC22D1	Q15714	1073 aa		3.76	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	SGCA	Q16586	387 aa		3.76	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	CEACAM16	Q2WEN9	425 aa		3.76	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	SLC35D3	Q5M8T2	416 aa		3.76	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	RBM48	Q5RL73	367 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	C10orf128	Q5T292	105 aa		3.76	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	FAM27B	Q5VT28	67 aa		3.76	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		3.76	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	C9orf135	Q5VTT2	229 aa		3.76	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	FBXW9	Q5XUX1	488 aa		3.76	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	OR2A2	Q6IF42	318 aa		3.76	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	TRAT1	Q6PIZ9	186 aa		3.76	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	TFAP2E	Q6VUC0	442 aa		3.76	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	LHFPL3	Q86UP9	236 aa		3.76	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	GID4	Q8IVV7	300 aa		3.76	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	SKA3	Q8IX90	412 aa		3.76	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	TIGD4	Q8IY51	512 aa		3.76	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	UBE2J2	Q8N2K1	259 aa		3.76	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	GPR137C	Q8N3F9	429 aa		3.76	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF540	Q8NDQ6	660 aa		3.76	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	NOXO1	Q8NFA2	376 aa		3.76	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	SLC26A10	Q8NG04	563 aa		3.76	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	OR51G2	Q8NGK0	314 aa		3.76	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	OR6K6	Q8NGW6	343 aa		3.76	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		3.76	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM80	Q96HE8	168 aa		3.76	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	DUX3	Q96PT4	197 aa		3.76	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	ALKBH3	Q96Q83	286 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	AMELY	Q99218	206 aa		3.76	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	LITAF	Q99732	161 aa		3.76	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	COPS4	Q9BT78	406 aa		3.76	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	YTHDF1	Q9BYJ9	559 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		3.76	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	ULBP2	Q9BZM5	246 aa		3.76	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	LINC00470	Q9BZP3	86 aa		3.76	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	RACGAP1	Q9H0H5	632 aa		3.76	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	OPN3	Q9H1Y3	402 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	MARCH7	Q9H992	704 aa		3.76	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	CRLF2	Q9HC73	371 aa		3.76	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	FGF20	Q9NP95	211 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM38B	Q9NVV0	291 aa		3.76	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	SCN3B	Q9NY72	215 aa		3.76	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	TAS2R16	Q9NYV7	291 aa		3.76	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	WARS2	Q9UGM6	360 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	AKAP8L	Q9ULX6	646 aa	Known RBP eCLIP	3.76	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	COPS3	Q9UNS2	423 aa		3.76	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	MOK	Q9UQ07	419 aa		3.76	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	KLHDC2	Q9Y2U9	406 aa		3.76	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	MEMO1	Q9Y316	297 aa		3.76	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	TPRKB	Q9Y3C4	175 aa		3.76	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	PIEZO2	Q9H5I5	2752 aa		3.76	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	PKD1L2	Q7Z442	2459 aa		3.76	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	ZFHX4	Q86UP3	3567 aa		3.76	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	RTTN	Q86VV8	2226 aa		3.75	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934		A0A1W2PQL4	384 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	EFCAB10	A6NFE3	127 aa		3.75	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	SNTN	A6NMZ2	147 aa		3.75	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	RPL36A-HNRNPH2	H7BZ11	118 aa		3.75	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	RER1	O15258	196 aa		3.75	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	LRRTM2	O43300	516 aa		3.75	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	KRT33A	O76009	404 aa		3.75	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	DFFB	O76075	338 aa		3.75	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	FADS2	O95864	444 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	MT-ND2	P03891	347 aa		3.75	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	LIMS3	P0CW19	117 aa		3.75	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	LIMS4	P0CW20	117 aa		3.75	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	PIP	P12273	146 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF823	P16415	610 aa		3.75	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	ALOX5AP	P20292	161 aa		3.75	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	DCK	P27707	260 aa		3.75	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	OPRM1	P35372	400 aa		3.75	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	CD79B	P40259	229 aa		3.75	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	ETV1	P50549	477 aa		3.75	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	BLVRA	P53004	296 aa		3.75	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	OR12D2	P58182	307 aa		3.75	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF85	Q03923	595 aa		3.75	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	EMX1	Q04741	257 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	GLO1	Q04760	184 aa		3.75	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	RAB40B	Q12829	278 aa		3.75	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	ENDOG	Q14249	297 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	GGTLC2	Q14390	218 aa		3.75	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	GABRA6	Q16445	453 aa		3.75	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	PCK2	Q16822	640 aa		3.75	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	KCTD21	Q4G0X4	260 aa		3.75	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	TEX30	Q5JUR7	227 aa		3.75	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	RIPPLY2	Q5TAB7	128 aa		3.75	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	OR2G6	Q5TZ20	316 aa		3.75	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	DNM1P34	Q6PK57	102 aa		3.75	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	SSX6	Q7RTT6	188 aa		3.75	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	DPY19L4	Q7Z388	723 aa		3.75	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	HDDC2	Q7Z4H3	204 aa		3.75	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	CDC20B	Q86Y33	519 aa		3.75	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	ERI1	Q8IV48	349 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	SLC35F2	Q8IXU6	374 aa		3.75	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	GABRG1	Q8N1C3	465 aa		3.75	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	LRRC18	Q8N456	261 aa		3.75	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	STX19	Q8N4C7	294 aa		3.75	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	ACBD7	Q8N6N7	88 aa		3.75	□□□□□ -1.81
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF433	Q8N7K0	673 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81

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