RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560243.5

RABGGTA-216, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTA, Length 704 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-216ENST00000560243 MAB21L2Q9Y586 359 aa9.61□□□□□ -0.87
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RABGGTA-216ENST00000560243 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTA-216ENST00000560243 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTA-216ENST00000560243 NKX6-3A6NJ46 265 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTA-216ENST00000560243 F8VVB4 439 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTA-216ENST00000560243 F8VWA3 439 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTA-216ENST00000560243 J3QLW9 94 aa9.6□□□□□ -0.87
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RABGGTA-216ENST00000560243 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
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RABGGTA-216ENST00000560243 IGHV1-69P01742 117 aa9.58□□□□□ -0.88
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RABGGTA-216ENST00000560243 TMEM185AQ8NFB2 350 aa9.58□□□□□ -0.88
RABGGTA-216ENST00000560243 C8orf46Q8TAG6 207 aa9.58□□□□□ -0.88
RABGGTA-216ENST00000560243 CNIH3Q8TBE1 160 aa9.58□□□□□ -0.88
RABGGTA-216ENST00000560243 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
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RABGGTA-216ENST00000560243 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
RABGGTA-216ENST00000560243 RASL12Q9NYN1 266 aa9.58□□□□□ -0.88
RABGGTA-216ENST00000560243 MTCH1Q9NZJ7 389 aa9.58□□□□□ -0.88
RABGGTA-216ENST00000560243 SLC7A11Q9UPY5 501 aa9.58□□□□□ -0.88
RABGGTA-216ENST00000560243 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa9.58□□□□□ -0.88
RABGGTA-216ENST00000560243 KPTNQ9Y664 436 aa9.58□□□□□ -0.88
RABGGTA-216ENST00000560243 TMEM89A2RUT3 159 aa9.57□□□□□ -0.88
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