RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556778.5

PRKCH-222, Transcript of protein kinase C eta, human

TSL 4

Gene PRKCH, Length 545 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKCH-222	ENST00000556778	PLEKHA1	Q9HB21	404 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	PATZ1	Q9HBE1	687 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	SCN3B	Q9NY72	215 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	CTSZ	Q9UBR2	303 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	HHLA2	Q9UM44	414 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	PCDHB10	Q9UN67	800 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	LSM2	Q9Y333	95 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	OOEP	A6NGQ2	149 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	TMEM210	A6NLX4	147 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	TMEM212	A6NML5	194 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	DHRS7C	A6NNS2	312 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778		A8MV72	311 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	KIAA1324L	A8MWY0	1029 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778		B4DSR2	109 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778		F5H0A9	414 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	LGALS8	O00214	317 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	ALX3	O95076	343 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	MSMB	P08118	114 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	CCDC159	P0C7I6	412 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	SELL	P14151	372 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	ZNF20	P17024	532 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	ATF1	P18846	271 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	CEL	P19835	753 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	HSPA13	P48723	471 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	CEBPD	P49716	269 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	WNT4	P56705	351 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	CCDC58	Q4VC31	144 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	TMEM155	Q4W5P6	130 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	TEX36	Q5VZQ5	186 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	FAHD2B	Q6P2I3	314 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	EGFL6	Q8IUX8	553 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	OR51A2	Q8NGJ7	313 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	MYDGF	Q969H8	173 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	SLAMF9	Q96A28	289 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	MRPL48	Q96GC5	212 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	FAHD2A	Q96GK7	314 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	SMURF1	Q9HCE7	757 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	HIF1AN	Q9NWT6	349 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	TAS2R4	Q9NYW5	299 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	MTCH1	Q9NZJ7	389 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	DHDH	Q9UQ10	334 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	ERGIC3	Q9Y282	383 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	NOP16	Q9Y3C1	178 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	TPRKB	Q9Y3C4	175 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PRKCH-222	ENST00000556778	ARID1A	O14497	2285 aa		7.34	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	IGKV1-12	A0A0C4DH73	117 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	MAGEA13P	A6NCF6	341 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	OR5B21	A6NL26	309 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	SRRM5	B3KS81	715 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	IFNL4	K9M1U5	179 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	MYL12B	O14950	172 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	PIN1P1	O15428	100 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	ADAM20	O43506	726 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	SPRY1	O43609	319 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	RGS10	O43665	173 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	ANGPTL7	O43827	346 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	SERPINA3	P01011	423 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	IGKV1D-12	P01611	117 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	RPSA	P08865	295 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	HSMCR30	P0CW71	290 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	RPS2	P15880	293 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	EEF1B2	P24534	225 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	AZGP1	P25311	298 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	CFHR2	P36980	270 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	NPBWR2	P48146	333 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	FUT6	P51993	359 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	MTCP1	P56278	107 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	MZT1	Q08AG7	82 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	MRPL28	Q13084	256 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	SPHAR	Q15513	63 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	MED22	Q15528	200 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	FAM120AOS	Q5T036	256 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	RNLS	Q5VYX0	342 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	METAP1D	Q6UB28	335 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	C1QL2	Q7Z5L3	287 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	C1orf87	Q8N0U7	546 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	SPIC	Q8N5J4	248 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	FAM216B	Q8N7L0	139 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	OR5D18	Q8NGL1	313 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	TSEN15	Q8WW01	171 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	TMEM203	Q969S6	136 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	TMEM186	Q96B77	213 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	SMIM19	Q96E16	107 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	CITED4	Q96RK1	184 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	COMMD4	Q9H0A8	199 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	PPIL3	Q9H2H8	161 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	ZCCHC4	Q9H5U6	513 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	TRIM36	Q9NQ86	728 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	SLC7A11	Q9UPY5	501 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	ZNF281	Q9Y2X9	895 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	ZFHX3	Q15911	3703 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	MTOR	P42345	2549 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	IGKV1D-17	A0A075B6S4	117 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	TRAV8-7	A0A075B6U6	113 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	TRBV5-5	A0A0J9YX44	114 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	DVL1	O14640	695 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	TMPRSS2	O15393	492 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PRKCH-222	ENST00000556778	H2AFB2	P0C5Z0	115 aa		7.32	□□□□□ -1.24

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