RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545308.5

SNHG1-222, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 2

Gene SNHG1, Length 646 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-222	ENST00000545308	PKDREJ	Q9NTG1	2253 aa		2.82	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	DOCK4	Q8N1I0	1966 aa		2.81	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	ANKRD12	Q6UB98	2062 aa		2.81	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	GTF3C1	Q12789	2109 aa		2.81	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	SPG11	Q96JI7	2443 aa		2.81	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	IGLV3-10	A0A075B6K4	115 aa		2.81	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	IGLV1-36	A0A0B4J1U3	117 aa		2.81	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	TSPAN11	A1L157	253 aa		2.81	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	GOLGA8IP	A6NC78	632 aa		2.81	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	GOLGA8J	A6NMD2	632 aa		2.81	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308		F5H5T6	163 aa		2.81	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308		H3BNH8	94 aa		2.81	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	PES1	O00541	588 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	POLR1C	O15160	346 aa	Predicted RBP	2.81	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	KDELR3	O43731	214 aa		2.81	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	FARS2	O95363	451 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	LY6G6D	O95868	133 aa		2.81	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	APOE	P02649	317 aa		2.81	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	ARG1	P05089	322 aa		2.81	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	GNAO1	P09471	354 aa		2.81	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	CRISP2	P16562	243 aa		2.81	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF30	P17039	623 aa		2.81	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	CSNK2A2	P19784	350 aa	Predicted RBP	2.81	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	PTN	P21246	168 aa		2.81	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	CD70	P32970	193 aa		2.81	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	MAS1L	P35410	378 aa		2.81	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	GPR1	P46091	355 aa		2.81	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	PSMD4	P55036	377 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	MYL6	P60660	151 aa		2.81	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	PFN3	P60673	137 aa		2.81	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	ATP6V0D1	P61421	351 aa		2.81	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	LYZ	P61626	148 aa		2.81	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	NDP	Q00604	133 aa		2.81	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	CDH17	Q12864	832 aa		2.81	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	IFT88	Q13099	833 aa		2.81	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	UNC119	Q13432	240 aa		2.81	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	PSG5	Q15238	335 aa		2.81	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	TSC22D1	Q15714	1073 aa		2.81	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF829	Q3KNS6	432 aa	Predicted RBP	2.81	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	RNF212	Q495C1	297 aa		2.81	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	CCNJ	Q5T5M9	372 aa		2.81	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	MLIP	Q5VWP3	458 aa		2.81	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	ANKRD22	Q5VYY1	191 aa		2.81	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	XKRX	Q6PP77	449 aa		2.81	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	C12orf54	Q6X4T0	127 aa		2.81	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	TEX43	Q6ZNM6	134 aa		2.81	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	STPG2	Q8N412	459 aa		2.81	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	TRAM1L1	Q8N609	369 aa		2.81	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM86B1	Q8N7N1	296 aa		2.81	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	DCAF4L2	Q8NA75	395 aa		2.81	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	FBXO36	Q8NEA4	188 aa		2.81	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		2.81	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	OR51L1	Q8NGJ5	315 aa		2.81	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		2.81	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	OR51F2	Q8NH61	342 aa		2.81	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	RDH5	Q92781	318 aa		2.81	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	KLK6	Q92876	244 aa		2.81	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	ISOC2	Q96AB3	205 aa		2.81	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	DNAJC19	Q96DA6	116 aa		2.81	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	BTN2A3P	Q96KV6	586 aa		2.81	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	SERPINB11	Q96P15	392 aa		2.81	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	IP6K3	Q96PC2	410 aa		2.81	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	HAUS4	Q9H6D7	363 aa		2.81	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	ZC4H2	Q9NQZ6	224 aa		2.81	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	MMP26	Q9NRE1	261 aa		2.81	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	ZMAT5	Q9UDW3	170 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	KPTN	Q9Y664	436 aa		2.81	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	SEC16A	O15027	2179 aa		2.81	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	ANKHD1	Q8IWZ3	2542 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	SPEN	Q96T58	3664 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	POLE	Q07864	2286 aa		2.8	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	CIB4	A0PJX0	185 aa		2.8	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	C21orf140	B9A014	251 aa		2.8	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	NDUFS8	O00217	210 aa		2.8	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	PLPP1	O14494	284 aa		2.8	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	KMO	O15229	486 aa		2.8	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	TOX3	O15405	576 aa	Predicted RBP	2.8	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	RAD51C	O43502	376 aa		2.8	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	HCRT	O43612	131 aa		2.8	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	STX10	O60499	249 aa		2.8	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	CTDNEP1	O95476	244 aa		2.8	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	INS	P01308	110 aa		2.8	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	IGLV2-23	P01705	113 aa		2.8	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	IVL	P07476	585 aa		2.8	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	HOXC4	P09017	264 aa	Predicted RBP	2.8	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	SMIM10L1	P0DMW3	83 aa		2.8	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	OR5H8	P0DN80	308 aa		2.8	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	ADRB3	P13945	408 aa		2.8	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	GGT1	P19440	569 aa		2.8	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	PMCH	P20382	165 aa		2.8	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	CASQ1	P31415	396 aa		2.8	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	HADHB	P55084	474 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	CYP24A1	Q07973	514 aa		2.8	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	SRSF6	Q13247	344 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF235	Q14590	738 aa		2.8	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	HSP90AA4P	Q58FG1	418 aa		2.8	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	UBE2U	Q5VVX9	321 aa		2.8	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC25A25	Q6KCM7	469 aa		2.8	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	ULK3	Q6PHR2	472 aa		2.8	□□□□□ -1.96

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