RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544910.5

VPS50-220, Transcript of VPS50, EARP/GARPII complex subunit, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS50, Length 5,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS50-220ENST00000544910 CABLES2Q9BTV7 478 aa5.13□□□□□ -1.59
VPS50-220ENST00000544910 PECRQ9BY49 303 aa5.13□□□□□ -1.59
VPS50-220ENST00000544910 GCM1Q9NP62 436 aa5.13□□□□□ -1.59
VPS50-220ENST00000544910 OCIAD1Q9NX40 245 aa5.13□□□□□ -1.59
VPS50-220ENST00000544910 OPN4Q9UHM6 478 aa5.13□□□□□ -1.59
VPS50-220ENST00000544910 PRR19A6NJB7 356 aa5.13□□□□□ -1.59
VPS50-220ENST00000544910 M0R143 59 aa5.13□□□□□ -1.59
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VPS50-220ENST00000544910 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
VPS50-220ENST00000544910 SFTA3P0C7M3 94 aa5.13□□□□□ -1.59
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VPS50-220ENST00000544910 RAB11AP62491 216 aa5.13□□□□□ -1.59
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VPS50-220ENST00000544910 MOB1BQ7L9L4 216 aa5.13□□□□□ -1.59
VPS50-220ENST00000544910 OSR2Q8N2R0 312 aa5.13□□□□□ -1.59
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VPS50-220ENST00000544910 HIPK2Q9H2X6 1198 aa5.13□□□□□ -1.59
VPS50-220ENST00000544910 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
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VPS50-220ENST00000544910 FUT6P51993 359 aa5.12□□□□□ -1.59
VPS50-220ENST00000544910 PJVKQ0ZLH3 352 aa5.12□□□□□ -1.59
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VPS50-220ENST00000544910 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
VPS50-220ENST00000544910 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
VPS50-220ENST00000544910 FDX2Q6P4F2 183 aa5.12□□□□□ -1.59
VPS50-220ENST00000544910 BTNL8Q6UX41 500 aa5.12□□□□□ -1.59
VPS50-220ENST00000544910 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
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VPS50-220ENST00000544910 ABHD16AO95870 558 aa5.12□□□□□ -1.59
VPS50-220ENST00000544910 IGKV3-11P04433 115 aa5.12□□□□□ -1.59
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VPS50-220ENST00000544910 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP5.12□□□□□ -1.59
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VPS50-220ENST00000544910 MS4A18Q3C1V0 323 aa5.12□□□□□ -1.59
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VPS50-220ENST00000544910 DRAM2Q6UX65 266 aa5.12□□□□□ -1.59
VPS50-220ENST00000544910 C19orf35Q6ZS72 473 aa5.12□□□□□ -1.59
VPS50-220ENST00000544910 OR10D4PQ8NGN7 298 aa5.12□□□□□ -1.59
VPS50-220ENST00000544910 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
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VPS50-220ENST00000544910 LINC00052Q96N35 136 aa5.12□□□□□ -1.59
VPS50-220ENST00000544910 FOXB1Q99853 325 aa5.12□□□□□ -1.59
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VPS50-220ENST00000544910 CRLF2Q9HC73 371 aa5.12□□□□□ -1.59
VPS50-220ENST00000544910 FSCN3Q9NQT6 498 aa5.12□□□□□ -1.59
VPS50-220ENST00000544910 AK3Q9UIJ7 227 aa5.12□□□□□ -1.59
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VPS50-220ENST00000544910 EP400Q96L91 3159 aa5.12□□□□□ -1.59
VPS50-220ENST00000544910 FAM166BA8MTA8 275 aa5.12□□□□□ -1.59
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