RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543658.5

DDB1-223, Transcript of damage specific DNA binding protein 1, human

TSL 4

Gene DDB1, Length 571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDB1-223	ENST00000543658	HPX	P02790	462 aa		10.06	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	PTGFR	P43088	359 aa		10.06	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	EFNA4	P52798	201 aa		10.06	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	CAV3	P56539	151 aa		10.06	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	PDZK1IP1	Q13113	114 aa		10.06	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	MPPED2	Q15777	294 aa		10.06	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	CARTPT	Q16568	116 aa		10.06	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	DGUOK	Q16854	277 aa		10.06	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	FAM76B	Q5HYJ3	339 aa		10.06	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	C1orf100	Q5SVJ3	147 aa		10.06	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	GLIPR1L1	Q6UWM5	242 aa		10.06	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	PEG10	Q86TG7	708 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	WDR86	Q86TI4	376 aa		10.06	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	CALHM1	Q8IU99	346 aa		10.06	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	SAXO1	Q8IYX7	474 aa		10.06	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	BOLL	Q8N9W6	283 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	ZSCAN4	Q8NAM6	433 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	OR10Z1	Q8NGY1	313 aa		10.06	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	OR51F2	Q8NH61	342 aa		10.06	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	LRRC29	Q8WV35	223 aa		10.06	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	CCL17	Q92583	94 aa		10.06	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	NRGN	Q92686	78 aa		10.06	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	RDH5	Q92781	318 aa		10.06	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	SLC25A46	Q96AG3	418 aa		10.06	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	CEP19	Q96LK0	163 aa		10.06	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	NKX3-1	Q99801	234 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	MRI1	Q9BV20	369 aa		10.06	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	FGF23	Q9GZV9	251 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	CST11	Q9H112	138 aa		10.06	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	TLNRD1	Q9H1K6	362 aa		10.06	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	GCM1	Q9NP62	436 aa		10.06	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	MYOZ1	Q9NP98	299 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	DLL4	Q9NR61	685 aa		10.06	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	TREM2	Q9NZC2	230 aa		10.06	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	RNF7	Q9UBF6	113 aa		10.06	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	DNAJB11	Q9UBS4	358 aa		10.06	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	GHRL	Q9UBU3	117 aa		10.06	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	UTP20	O75691	2785 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658		A6NHS1	94 aa		10.05	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	CLDN25	C9JDP6	229 aa		10.05	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	OVOL3	O00110	214 aa		10.05	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	SYNGR1	O43759	233 aa		10.05	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	ANGPTL7	O43827	346 aa		10.05	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	KDM4B	O94953	1096 aa		10.05	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	NXPH2	O95156	264 aa		10.05	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	HTR3B	O95264	441 aa		10.05	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	PTBP3	O95758	552 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	BPNT1	O95861	308 aa		10.05	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	DAO	P14920	347 aa		10.05	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	ARSB	P15848	533 aa		10.05	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	SERPINA2	P20848	420 aa		10.05	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	GLRA1	P23415	457 aa		10.05	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	MPZ	P25189	248 aa		10.05	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	BMX	P51813	675 aa		10.05	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	ATP5J2	P56134	94 aa		10.05	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	ZP1	P60852	638 aa		10.05	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	GMFB	P60983	142 aa		10.05	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	P2RY14	Q15391	338 aa		10.05	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	MZT2A	Q6P582	158 aa		10.05	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	WDR82	Q6UXN9	313 aa		10.05	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF826P	Q6ZT77	177 aa		10.05	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	PXT1	Q8NFP0	134 aa		10.05	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	OR4D6	Q8NGJ1	314 aa		10.05	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658		Q8TCH9	128 aa		10.05	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	EMG1	Q92979	244 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	TIMD4	Q96H15	378 aa		10.05	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	GFI1	Q99684	422 aa		10.05	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	DCUN1D5	Q9BTE7	237 aa		10.05	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	LIME1	Q9H400	295 aa		10.05	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	LIN7B	Q9HAP6	207 aa		10.05	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	RHOF	Q9HBH0	211 aa		10.05	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	TMEM106B	Q9NUM4	274 aa		10.05	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	BEX4	Q9NWD9	120 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	CCDC59	Q9P031	241 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	NPTN	Q9Y639	398 aa		10.05	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	PTPN13	Q12923	2485 aa		10.04	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658		A0A0G2JK05	382 aa		10.04	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	AKR7A2	O43488	359 aa		10.04	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	CRTAP	O75718	401 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	RHBDL1	O75783	438 aa		10.04	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	F12	P00748	615 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	CSF3	P09919	207 aa		10.04	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	SLC2A2	P11168	524 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF182	P17025	639 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	PTH2R	P49190	550 aa		10.04	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	CLDN12	P56749	244 aa		10.04	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	KRTAP10-9	P60411	292 aa		10.04	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	MRPS11	P82912	194 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF181	Q2M3W8	571 aa		10.04	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	SMIM21	Q3B7S5	101 aa		10.04	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		10.04	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	SPRN	Q5BIV9	151 aa		10.04	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	BATF2	Q8N1L9	274 aa		10.04	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	POC1A	Q8NBT0	407 aa		10.04	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	OR51D1	Q8NGF3	324 aa		10.04	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	TBC1D15	Q8TC07	691 aa		10.04	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	ACOT12	Q8WYK0	555 aa		10.04	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	NINJ1	Q92982	152 aa		10.04	□□□□□ -0.8
DDB1-223	ENST00000543658	FAM3D	Q96BQ1	224 aa		10.04	□□□□□ -0.8

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