RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533873.1

ACER3-213, Transcript of alkaline ceramidase 3, human

TSL 2 BASIC

Gene ACER3, Length 929 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACER3-213	ENST00000533873	KRT77	Q7Z794	578 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	TMEM179B	Q7Z7N9	219 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	LRRC28	Q86X40	367 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	COMMD2	Q86X83	199 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	GID4	Q8IVV7	300 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	TIGD4	Q8IY51	512 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	ZNF555	Q8NEP9	628 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	CSNK2A3	Q8NEV1	391 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	OR8B3	Q8NGG8	313 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	OR2AE1	Q8NHA4	323 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	NDNF	Q8TB73	568 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	NANP	Q8TBE9	248 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	SETD6	Q8TBK2	473 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873		Q8TCH9	128 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	DYNC2LI1	Q8TCX1	351 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	ZNF418	Q8TF45	676 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	THEM6	Q8WUY1	208 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	ASB17	Q8WXJ9	295 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	RORB	Q92753	470 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	SPSB4	Q96A44	273 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	REEP6	Q96HR9	211 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	ST6GAL2	Q96JF0	529 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	RHOV	Q96L33	236 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873		Q96M66	194 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	OPALIN	Q96PE5	141 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	OR8B2	Q96RD0	313 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	JMJD8	Q96S16	334 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	CNN2	Q99439	309 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	MNT	Q99583	582 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	PAPOLG	Q9BWT3	736 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	PATZ1	Q9HBE1	687 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	PLSCR3	Q9NRY6	295 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	DNAJC27	Q9NZQ0	273 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	MIOX	Q9UGB7	285 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	DIMT1	Q9UNQ2	313 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	FBN3	Q75N90	2809 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	COL6A5	A8TX70	2615 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	TRAV38-1	A0A0B4J264	116 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	IGHV3-64D	A0A0J9YX35	117 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	LINC00862	A6NCI5	91 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	CEACAM18	A8MTB9	384 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	EI24	O14681	340 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	MLNR	O43193	412 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	SELENOF	O60613	162 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	FAM20B	O75063	409 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	PITPNB	P48739	271 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	POLR2G	P62487	172 aa	Known RBP eCLIP	5.78	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	GNB2	P62879	340 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	ADARB1	P78563	741 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	PTGES3	Q15185	160 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	CTF1	Q16619	201 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	RSPO1	Q2MKA7	263 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	ZNF404	Q494X3	552 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	ARMCX4	Q5H9R4	360 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	TTC23	Q5W5X9	447 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	DEGS2	Q6QHC5	323 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	RBMS3	Q6XE24	437 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	C1QL2	Q7Z5L3	287 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	BPIFB2	Q8N4F0	458 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	ZNRF4	Q8WWF5	429 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	DEDD2	Q8WXF8	326 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	RNF170	Q96K19	258 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	SIGLEC11	Q96RL6	698 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	MICU1	Q9BPX6	476 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	RBM4B	Q9BQ04	359 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	RTL8A	Q9BWD3	113 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	SUCNR1	Q9BXA5	334 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	CCDC90B	Q9GZT6	254 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	GABARAPL1	Q9H0R8	117 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	MOB1A	Q9H8S9	216 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	G6PC2	Q9NQR9	355 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	UFSP2	Q9NUQ7	469 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	C19orf73	Q9NVV2	129 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	IMPAD1	Q9NX62	359 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	RNF7	Q9UBF6	113 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	IKZF2	Q9UKS7	526 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	PPIAL4A	Q9Y536	164 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ACER3-213	ENST00000533873	LOC105371242	A0A075B767	164 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ACER3-213	ENST00000533873	hCG_38984	A0A1B0GV85	526 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ACER3-213	ENST00000533873	ACOD1	A6NK06	481 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ACER3-213	ENST00000533873	ZAR1L	A6NP61	321 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ACER3-213	ENST00000533873		A8MXK9	166 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ACER3-213	ENST00000533873	ZNF670-ZNF695	F2Z2N8	137 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ACER3-213	ENST00000533873		H0YL77	283 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ACER3-213	ENST00000533873	LGALS8	O00214	317 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ACER3-213	ENST00000533873	RGS5	O15539	181 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ACER3-213	ENST00000533873	SCO1	O75880	301 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ACER3-213	ENST00000533873	CLIC3	O95833	236 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ACER3-213	ENST00000533873	CYB5R3	P00387	301 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
ACER3-213	ENST00000533873	MRPL3	P09001	348 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
ACER3-213	ENST00000533873	ALOX5AP	P20292	161 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ACER3-213	ENST00000533873	SLC2A5	P22732	501 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ACER3-213	ENST00000533873	CRHBP	P24387	322 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ACER3-213	ENST00000533873	FPR2	P25090	351 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ACER3-213	ENST00000533873	ATP6V1E1	P36543	226 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ACER3-213	ENST00000533873	DAP	P51397	102 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ACER3-213	ENST00000533873	RIDA	P52758	137 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.9 ms