RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522928.1

CLVS1-209, Transcript of clavesin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CLVS1, Length 464 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-209ENST00000522928 OR11A1Q9GZK7 315 aa2.57□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 OR51B6Q9H340 312 aa2.57□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 CTPS2Q9NRF8 586 aa2.57□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 PCTPQ9UKL6 214 aa2.57□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 NUP50Q9UKX7 468 aa2.57□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa2.57□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 TIMM22Q9Y584 194 aa2.57□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa2.57□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 CMYA5Q8N3K9 4069 aa2.57□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 CADP27708 2225 aa2.57□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 RYR2Q92736 4967 aa2.57□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa2.56□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa2.56□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa2.56□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 A0A1W2PQD3 144 aa2.56□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 CLPSL1A2RUU4 121 aa2.56□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 FAM159BA6NKW6 160 aa2.56□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 PDLIM1O00151 329 aa2.56□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 CFLARO15519 480 aa2.56□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 TYROBPO43914 113 aa2.56□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 AKR7A3O95154 331 aa2.56□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 KLHL2O95198 593 aa2.56□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 CSTAP01040 98 aa2.56□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 RBP1P09455 135 aa2.56□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 CD79AP11912 226 aa2.56□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 SLC35A1P78382 337 aa2.56□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 CCL8P80075 99 aa2.56□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 GALK2Q01415 458 aa2.56□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 GLO1Q04760 184 aa2.56□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF763Q0D2J5 394 aa2.56□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 GAMTQ14353 236 aa2.56□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 PDK3Q15120 406 aa2.56□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 OR7A5Q15622 319 aa2.56□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 TAF9Q16594 264 aa2.56□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 MICAQ29983 383 aa2.56□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa2.56□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 SPIN4Q56A73 249 aa2.56□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 DEFB121Q5J5C9 76 aa2.56□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 DCST2Q5T1A1 773 aa2.56□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 PDZK1Q5T2W1 519 aa2.56□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 SAXO2Q658L1 398 aa2.56□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 TMEM225Q6GV28 225 aa2.56□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 ASPHD2Q6ICH7 369 aa2.56□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 FAM71E1Q6IPT2 247 aa2.56□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 C16orf87Q6PH81 154 aa2.56□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 SYT10Q6XYQ8 523 aa2.56□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 MDP1Q86V88 176 aa2.56□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 OR2L13Q8N349 312 aa2.56□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 SLC35F6Q8N357 371 aa2.56□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 OR9K2Q8NGE7 335 aa2.56□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 OR52E2Q8NGJ4 325 aa2.56□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 OR5W2Q8NH69 310 aa2.56□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 CLHC1Q8NHS4 586 aa2.56□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 RHEBL1Q8TAI7 183 aa2.56□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 VN1R17PQ8TDU5 208 aa2.56□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 TMEM234Q8WY98 164 aa2.56□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 PPCDCQ96CD2 204 aa2.56□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 LRRC58Q96CX6 371 aa2.56□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 C5orf30Q96GV9 206 aa2.56□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 TIMD4Q96H15 378 aa2.56□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 CYYR1Q96J86 154 aa2.56□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 MS4A4EQ96PG1 132 aa2.56□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 KCNA7Q96RP8 456 aa2.56□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 SLC30A2Q9BRI3 323 aa2.56□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 NMUR2Q9GZQ4 415 aa2.56□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF442Q9H7R0 627 aa2.56□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 ACER3Q9NUN7 267 aa2.56□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 TAAR3PQ9P1P4 343 aa2.56□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 OPN4Q9UHM6 478 aa2.56□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 KLHL21Q9UJP4 597 aa2.56□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 TMCO1Q9UM00 188 aa2.56□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 FIS1Q9Y3D6 152 aa2.56□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 KCNE3Q9Y6H6 103 aa2.56□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa2.55□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 LOC100653049A0A140TA62 436 aa2.55□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 A0A1B0GUS0 222 aa2.55□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa2.55□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 TMEM72A0PK05 275 aa2.55□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 A8MT66 165 aa2.55□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 FAM220BPB1ANY3 271 aa2.55□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 CLDN25C9JDP6 229 aa2.55□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 ANGPT2O15123 496 aa2.55□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 ERLIN1O75477 346 aa2.55□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 GMNNO75496 209 aa2.55□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 FOXH1O75593 365 aa2.55□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 UPK3AO75631 287 aa2.55□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 KRT34O76011 436 aa2.55□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 PSMG1O95456 288 aa2.55□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 SLC2A10O95528 541 aa2.55□□□□□ -2
CLVS1-209ENST00000522928 IGHV2-5P01817 119 aa2.55□□□□□ -2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.1 ms