RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516564.1

RNU6-358P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 358, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-358P, Length 75 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-358P-201ENST00000516564 TMEM165Q9HC07 324 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 TMEM100Q9NV29 134 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 OR5V1Q9UGF6 321 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 PXDNLA1KZ92 1463 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 JCADQ9P266 1359 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 TRGV2A0A075B6R0 118 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 C9JQL5 133 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 RGS5O15539 181 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 CD160O95971 181 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 RAB5AP20339 215 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 PSMB9P28065 219 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 SLC18A1P54219 525 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 ZNF33AQ06730 810 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 ITIH4Q14624 930 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 CASP8Q14790 479 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 ELOCQ15369 112 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 BCL2A1Q16548 175 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 LINC00303Q3SY05 128 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 OR2T5Q6IEZ7 315 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 UNC93AQ86WB7 457 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 OR9K2Q8NGE7 335 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 OR2T29Q8NH02 315 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 MFSD8Q8NHS3 518 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 RAB1CQ92928 201 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 PEX13Q92968 403 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 APH1AQ96BI3 265 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 OR52B2Q96RD2 323 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 CALN1Q9BXU9 219 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 ZYG11BQ9C0D3 744 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 TRPM6Q9BX84 2022 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 CACNA1SQ13698 1873 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 A0A0J9YYE9 177 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 A6NED7 52 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 TP53I11O14683 189 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 OXTP01178 125 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 PTHP01270 115 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 TRBC1P01850 177 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 OR4Q2P0C623 313 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 SLC2A3P11169 496 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 HLA-GP17693 338 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 BCKDHBP21953 392 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 AP1S2P56377 157 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 ZNF555Q8NEP9 628 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 OR56B2PQ8NGI1 322 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 OR4C16Q8NGL9 310 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 ASZ1Q8WWH4 475 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 SMARCD1Q96GM5 515 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 GPR21Q99679 349 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 LRRC40Q9H9A6 602 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 UBN2Q6ZU65 1347 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 FN1P02751 2386 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 TSPAN11A1L157 253 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 F5H5P2 479 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 LINC01619G3V211 115 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 MYL2P10916 166 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 MLNP12872 115 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 RFC3P40938 356 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 OR2B8PP59922 312 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 SPIN4Q56A73 249 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 SPESP1Q6UW49 350 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 OR8A1Q8NGG7 326 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 NT5C3BQ969T7 300 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 ZBTB18Q99592 522 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 SLC19A3Q9BZV2 496 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 PORCNQ9H237 461 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 PTTG3PQ9NZH4 202 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 AK9Q5TCS8 1911 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 USP24Q9UPU5 2620 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 K7EPK0 472 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 ERI3O43414 337 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 CLTAP09496 248 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 RAB11AP62491 216 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 MLIPQ5VWP3 458 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 WDR82Q6UXN9 313 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 OTUD6AQ7L8S5 288 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 SLC30A8Q8IWU4 369 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 SLC25A45Q8N413 288 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 NECAB1Q8N987 351 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 OR2K2Q8NGT1 345 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 TAC3Q9UHF0 121 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-358P-201ENST00000516564 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.41
RNU6-358P-201ENST00000516564 MUC5ACP98088 5654 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-358P-201ENST00000516564 A0A0G2JQZ4 141 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-358P-201ENST00000516564 SMCO3A2RU48 225 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-358P-201ENST00000516564 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-358P-201ENST00000516564 HUS1O60921 280 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-358P-201ENST00000516564 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP0.02□□□□□ -2.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.8 ms