RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512193.5

NEK1-208, Transcript of NIMA related kinase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 4,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEK1-208	ENST00000512193	LIPT2	A6NK58	231 aa		7.14	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	SCGB1D1	O95968	90 aa		7.14	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		7.14	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	VSIG8	P0DPA2	414 aa		7.14	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	RAB1A	P62820	205 aa		7.14	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	PPIA	P62937	165 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	INPP5J	Q15735	1006 aa	Predicted RBP	7.14	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	TUSC1	Q2TAM9	212 aa		7.14	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM41B	Q5BJD5	291 aa		7.14	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	7.14	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	MRGPRE	Q86SM8	312 aa		7.14	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	NECAP1	Q8NC96	275 aa		7.14	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	KCNE4	Q8WWG9	221 aa		7.14	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	ADAT3	Q96EY9	351 aa	Predicted RBP	7.14	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	PLPPR2	Q96GM1	343 aa		7.14	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	C19orf12	Q9NSK7	152 aa		7.14	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	PLA2G3	Q9NZ20	509 aa		7.14	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	FBXL17	Q9UF56	701 aa		7.14	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	NDRG3	Q9UGV2	375 aa		7.14	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	POLDIP2	Q9Y2S7	368 aa		7.14	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	MMP24	Q9Y5R2	645 aa		7.14	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	ARHGEF17	Q96PE2	2063 aa	Predicted RBP	7.14	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	GPR179	Q6PRD1	2367 aa		7.14	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	GREB1	Q4ZG55	1949 aa		7.14	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	POU2F2	P09086	479 aa		7.14	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	ACKR3	P25106	362 aa		7.14	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	PMP22	Q01453	160 aa		7.14	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	PRAMEF5	Q5TYX0	476 aa		7.14	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	PRAMEF6	Q5VXH4	476 aa		7.14	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	PRSS54	Q6PEW0	395 aa		7.14	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	CLEC18B	Q6UXF7	455 aa		7.14	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	HSD17B13	Q7Z5P4	300 aa	Predicted RBP	7.14	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	BVES	Q8NE79	360 aa		7.14	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	SLC26A10	Q8NG04	563 aa		7.14	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	SLC25A38	Q96DW6	304 aa		7.14	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	HIPK2	Q9H2X6	1198 aa		7.14	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	MRPS18B	Q9Y676	258 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	MTCH2	Q9Y6C9	303 aa		7.14	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	CCL2	P13500	99 aa		7.14	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	PNLIP	P16233	465 aa		7.14	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	CXCL2	P19875	107 aa		7.14	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	GALNS	P34059	522 aa		7.14	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	OR1J1	Q8NGS3	322 aa		7.14	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	NANP	Q8TBE9	248 aa		7.14	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	RAB39B	Q96DA2	213 aa		7.14	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	MSI2	Q96DH6	328 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	TGIF2	Q9GZN2	237 aa		7.14	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	LTBP1	Q14766	1721 aa		7.14	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	MDFIC2	A0A1B0GVS7	189 aa		7.13	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193		A0A1W2PQD3	144 aa		7.13	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	PRSS44	E7EML9	344 aa		7.13	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	SH2D1B	O14796	132 aa		7.13	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	KCNAB3	O43448	404 aa		7.13	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	THY1	P04216	161 aa		7.13	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	OR5AC1	P0C628	307 aa		7.13	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	ARR3	P36575	388 aa		7.13	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	RAB35	Q15286	201 aa		7.13	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193		Q5BKY6	102 aa		7.13	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	PABPC1L2A	Q5JQF8	200 aa		7.13	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	GPR137	Q96N19	417 aa		7.13	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	WDR13	Q9H1Z4	485 aa		7.13	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	ESRP2	Q9H6T0	727 aa	Known RBP	7.13	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	DYNLRB1	Q9NP97	96 aa		7.13	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	RPH3AL	Q9UNE2	315 aa		7.13	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		7.13	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	FAM24A	A6NFZ4	105 aa		7.13	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	PPP5D1	E7EU14	171 aa		7.13	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	PNP	P00491	289 aa		7.13	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	NQO2	P16083	231 aa		7.13	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	MMP16	P51512	607 aa		7.13	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM33	P57088	247 aa		7.13	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	FAM209A	Q5JX71	171 aa		7.13	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF787	Q6DD87	383 aa		7.13	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	UQCC3	Q6UW78	93 aa		7.13	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	IL34	Q6ZMJ4	242 aa		7.13	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	C1orf87	Q8N0U7	546 aa		7.13	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	SLC22A18AS	Q8N1D0	253 aa		7.13	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF485	Q8NCK3	441 aa		7.13	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	7.13	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	OR6X1	Q8NH79	312 aa		7.13	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	NUBPL	Q8TB37	319 aa		7.13	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	UHRF2	Q96PU4	802 aa		7.13	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	OPA3	Q9H6K4	179 aa		7.13	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	MRPL22	Q9NWU5	206 aa	Known RBP	7.13	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	P4HTM	Q9NXG6	502 aa		7.13	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	MBTPS2	O43462	519 aa		7.13	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	KRAS	P01116	189 aa		7.13	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	ASAH2B	P0C7U1	165 aa		7.13	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	OR8B8	Q15620	311 aa		7.13	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	MICB	Q29980	383 aa		7.13	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	RNF133	Q8WVZ7	376 aa		7.13	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	UCN2	Q96RP3	112 aa		7.13	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		7.13	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	MMP26	Q9NRE1	261 aa		7.13	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	PSENEN	Q9NZ42	101 aa		7.13	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	KLF13	Q9Y2Y9	288 aa	Predicted RBP	7.13	□□□□□ -1.27
NEK1-208	ENST00000512193	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	7.13	□□□□□ -1.27

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