RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508148.1

MIB2-223, Transcript of mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2, human

TSL 4

Gene MIB2, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF732	B4DXR9	585 aa		13.78	□□□□□ -0.2
MIB2-223	ENST00000508148		H3BSH0	61 aa		13.78	□□□□□ -0.2
MIB2-223	ENST00000508148	CLDN34	H7C241	214 aa		13.78	□□□□□ -0.2
MIB2-223	ENST00000508148	LGALS8	O00214	317 aa		13.78	□□□□□ -0.2
MIB2-223	ENST00000508148	CDIPT	O14735	213 aa		13.78	□□□□□ -0.2
MIB2-223	ENST00000508148	GATB	O75879	557 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
MIB2-223	ENST00000508148	LHB	P01229	141 aa		13.78	□□□□□ -0.2
MIB2-223	ENST00000508148	CFHR2	P36980	270 aa		13.78	□□□□□ -0.2
MIB2-223	ENST00000508148	TGM4	P49221	684 aa		13.78	□□□□□ -0.2
MIB2-223	ENST00000508148	ETV1	P50549	477 aa		13.78	□□□□□ -0.2
MIB2-223	ENST00000508148	LYPD2	Q6UXB3	125 aa		13.78	□□□□□ -0.2
MIB2-223	ENST00000508148	IZUMO2	Q6UXV1	221 aa		13.78	□□□□□ -0.2
MIB2-223	ENST00000508148	C11orf53	Q8IXP5	236 aa		13.78	□□□□□ -0.2
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF676	Q8N7Q3	588 aa		13.78	□□□□□ -0.2
MIB2-223	ENST00000508148	SCCPDH	Q8NBX0	429 aa		13.78	□□□□□ -0.2
MIB2-223	ENST00000508148	OR8B3	Q8NGG8	313 aa		13.78	□□□□□ -0.2
MIB2-223	ENST00000508148	OR10Z1	Q8NGY1	313 aa		13.78	□□□□□ -0.2
MIB2-223	ENST00000508148	PP6455	Q8WZ26	134 aa		13.78	□□□□□ -0.2
MIB2-223	ENST00000508148	RPL3L	Q92901	407 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
MIB2-223	ENST00000508148	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
MIB2-223	ENST00000508148	OR8B2	Q96RD0	313 aa		13.78	□□□□□ -0.2
MIB2-223	ENST00000508148	CHST5	Q9GZS9	411 aa		13.78	□□□□□ -0.2
MIB2-223	ENST00000508148	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
MIB2-223	ENST00000508148	COMMD4	Q9H0A8	199 aa		13.78	□□□□□ -0.2
MIB2-223	ENST00000508148	GPR173	Q9NS66	373 aa		13.78	□□□□□ -0.2
MIB2-223	ENST00000508148	PLCXD1	Q9NUJ7	323 aa		13.78	□□□□□ -0.2
MIB2-223	ENST00000508148	HHLA2	Q9UM44	414 aa		13.78	□□□□□ -0.2
MIB2-223	ENST00000508148	TMEM212	A6NML5	194 aa		13.77	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	OR4C45	A6NMZ5	311 aa		13.77	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	SRRM5	B3KS81	715 aa		13.77	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	C3orf80	F5H4A9	247 aa		13.77	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	NDUFA2	O43678	99 aa		13.77	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	PPIAL4G	P0DN37	164 aa		13.77	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	MDK	P21741	143 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	TEX36	Q5VZQ5	186 aa		13.77	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	AHSA2	Q719I0	299 aa		13.77	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	C19orf18	Q8NEA5	215 aa		13.77	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	RAB40A	Q8WXH6	277 aa		13.77	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	GGH	Q92820	318 aa		13.77	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	OR51I2	Q9H344	312 aa		13.77	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	PSORS1C1	Q9UIG5	152 aa		13.77	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148		A6NIN4	97 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	C22orf46	C9J442	243 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	XPNPEP2	O43895	674 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	SERPINA3	P01011	423 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	MUC1	P15941	1255 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF20	P17024	532 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	GNB2	P62879	340 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	ST3GAL4	Q11206	333 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	MICB	Q29980	383 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	CCDC58	Q4VC31	144 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	OR2G6	Q5TZ20	316 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	LAIR2	Q6ISS4	152 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF841	Q6ZN19	808 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF573	Q86YE8	665 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	RDH10	Q8IZV5	341 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	STX19	Q8N4C7	294 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	BPIFB6	Q8NFQ5	453 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	OR13C3	Q8NGS6	347 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	OR52N1	Q8NH53	320 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	OR5AK2	Q8NH90	309 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	C12orf43	Q96C57	262 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	ANKRD60	Q9BZ19	345 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	SLC7A11	Q9UPY5	501 aa		13.76	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	TRBV2	A0A0J9YWF9	115 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	PQLC2L	A1A4F0	135 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148		J3QT63	122 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	MYF6	P23409	242 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	OMG	P23515	440 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	PITPNB	P48739	271 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	IL13RA1	P78552	427 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	DEFB112	Q30KQ8	113 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	DMRTC1	Q5HYR2	192 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	RPL22L1	Q6P5R6	122 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	HAGHL	Q6PII5	290 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	BRD3OS	Q6XYD6	125 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF671	Q8TAW3	534 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	SLC25A28	Q96A46	364 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	ERVK-18	Q9QC07	812 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	CTSZ	Q9UBR2	303 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	POLDIP2	Q9Y2S7	368 aa		13.75	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	KIR2DS1	A0A191URI9	304 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148		E9PI62	339 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	ANKHD1-EIF4EBP3	H7C0V5	636 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	SLC1A7	O00341	560 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	MYL12B	O14950	172 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	FCN3	O75636	299 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	ZFPL1	O95159	310 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	VHL	P40337	213 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	HAAO	P46952	286 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	NPY4R	P50391	375 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	FGF12	P61328	243 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	SRSF4	Q08170	494 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	CDK5R1	Q15078	307 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	C6orf141	Q5SZD1	244 aa		13.74	□□□□□ -0.21
MIB2-223	ENST00000508148	WDR25	Q64LD2	544 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21

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