RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506464.5

ABCC3-208, Transcript of ATP binding cassette subfamily C member 3, human

TSL 4

Gene ABCC3, Length 540 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCC3-208	ENST00000506464	RAB40B	Q12829	278 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	IL18R1	Q13478	541 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	BRD3OS	Q6XYD6	125 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464		Q6ZSR3	168 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	FAM220A	Q7Z4H9	259 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	SCCPDH	Q8NBX0	429 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	LY6G5B	Q8NDX9	201 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	SETD9	Q8NE22	299 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	OR52I1	Q8NGK6	324 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	C8orf46	Q8TAG6	207 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	DUX5	Q96PT3	197 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	CCL13	Q99616	98 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	VCX	Q9H320	206 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	ZNF696	Q9H7X3	374 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	RASL12	Q9NYN1	266 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	ENPP5	Q9UJA9	477 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	IGHV3OR15-7	A0A075B7D8	119 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	DHRS7C	A6NNS2	312 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464		H0YAE9	185 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	FADS2	O95864	444 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	SFTPB	P07988	381 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	FAH	P16930	419 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	KIR3DL2	P43630	455 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	CAV3	P56539	151 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	OR12D2	P58182	307 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	ARF6	P62330	175 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	ACTA2	P62736	377 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	ACTG2	P63267	376 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	GALE	Q14376	348 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	C1orf122	Q6ZSJ8	110 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	LDLRAD3	Q86YD5	345 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	PRSS35	Q8N3Z0	413 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	OR14K1	Q8NGZ2	314 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	OR4F5	Q8NH21	305 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	FBLIM1	Q8WUP2	373 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	RPL3L	Q92901	407 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	TMIGD2	Q96BF3	282 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	PELI1	Q96FA3	418 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	C4orf36	Q96KX1	117 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	DCTN5	Q9BTE1	182 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	ALG8	Q9BVK2	526 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	UNKL	Q9H9P5	680 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	INPP5E	Q9NRR6	644 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	NLK	Q9UBE8	527 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464		V9GYS6	101 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	NBEAL1	Q6ZS30	2694 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464		M0R1W7	72 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	SIGLEC5	O15389	551 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	MELTF	P08582	738 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	GLRA1	P23415	457 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	EEF1B2	P24534	225 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	GPM6A	P51674	278 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	AQP4	P55087	323 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	NANOS3	P60323	173 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	BLMH	Q13867	455 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	PRR31	Q5SQ13	230 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	NCR3LG1	Q68D85	454 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	TMEM42	Q69YG0	159 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	LAIR2	Q6ISS4	152 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	FDX2	Q6P4F2	183 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	KCTD20	Q7Z5Y7	419 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	LHFPL3	Q86UP9	236 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	C8orf59	Q8N0T1	100 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	FAM216B	Q8N7L0	139 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	CCDC54	Q8NEL0	328 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	OR2G2	Q8NGZ5	317 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	ANGPTL6	Q8NI99	470 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	DYRK2	Q92630	601 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	TFAP2C	Q92754	450 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	LHX4	Q969G2	390 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	JAM3	Q9BX67	310 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	OR51I2	Q9H344	312 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	DPAGT1	Q9H3H5	408 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	BEX1	Q9HBH7	125 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	FGF20	Q9NP95	211 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	ERVK13-1	Q9NX77	482 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	SLC25A10	Q9UBX3	287 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	PIGL	Q9Y2B2	252 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	POLDIP2	Q9Y2S7	368 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	HSPE1-MOB4	S4R3N1	261 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ABCC3-208	ENST00000506464	TRBV23-1	A0A0A0MS06	115 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ABCC3-208	ENST00000506464	MDFIC2	A0A1B0GVS7	189 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ABCC3-208	ENST00000506464	LOC107986453	A0A1B0GWG9	222 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ABCC3-208	ENST00000506464		A0A1W2PPH5	198 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ABCC3-208	ENST00000506464	OR2AT4	A6NND4	320 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ABCC3-208	ENST00000506464	ZNF732	B4DXR9	585 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ABCC3-208	ENST00000506464		H0YHG0	523 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ABCC3-208	ENST00000506464	AKR7A2	O43488	359 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ABCC3-208	ENST00000506464	NDUFA7	O95182	113 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ABCC3-208	ENST00000506464	NRAS	P01111	189 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ABCC3-208	ENST00000506464	ACAA1	P09110	424 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
ABCC3-208	ENST00000506464	FBP1	P09467	338 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ABCC3-208	ENST00000506464	LIMS3	P0CW19	117 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ABCC3-208	ENST00000506464	LIMS4	P0CW20	117 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ABCC3-208	ENST00000506464	IKZF1	Q13422	519 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ABCC3-208	ENST00000506464	ODF4	Q2M2E3	257 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ABCC3-208	ENST00000506464	SMIM21	Q3B7S5	101 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ABCC3-208	ENST00000506464	KLHL22	Q53GT1	634 aa		10.08	□□□□□ -0.8

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