RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490677.1

HOXB3-211, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-211ENST00000490677 PQLC2LA1A4F0 135 aa22.74■■□□□ 1.23
HOXB3-211ENST00000490677 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
HOXB3-211ENST00000490677 BCL2L15Q5TBC7 163 aa22.74■■□□□ 1.23
HOXB3-211ENST00000490677 TREML4Q6UXN2 200 aa22.74■■□□□ 1.23
HOXB3-211ENST00000490677 OR51G2Q8NGK0 314 aa22.74■■□□□ 1.23
HOXB3-211ENST00000490677 AJUBAQ96IF1 538 aa22.74■■□□□ 1.23
HOXB3-211ENST00000490677 GABARAPL3Q9BY60 117 aa22.74■■□□□ 1.23
HOXB3-211ENST00000490677 GPR173Q9NS66 373 aa22.74■■□□□ 1.23
HOXB3-211ENST00000490677 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
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HOXB3-211ENST00000490677 A0A1W2PRF3 423 aa22.73■■□□□ 1.23
HOXB3-211ENST00000490677 A0A1W2PRM7 423 aa22.73■■□□□ 1.23
HOXB3-211ENST00000490677 DHRS7CA6NNS2 312 aa22.73■■□□□ 1.23
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa22.73■■□□□ 1.23
HOXB3-211ENST00000490677 J3QT63 122 aa22.73■■□□□ 1.23
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HOXB3-211ENST00000490677 MPZP25189 248 aa22.73■■□□□ 1.23
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HOXB3-211ENST00000490677 UBE2E1P51965 193 aa22.73■■□□□ 1.23
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HOXB3-211ENST00000490677 LINC01006Q8NI28 216 aa22.73■■□□□ 1.23
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HOXB3-211ENST00000490677 C19orf12Q9NSK7 152 aa22.73■■□□□ 1.23
HOXB3-211ENST00000490677 A6NIN4 97 aa22.72■■□□□ 1.23
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HOXB3-211ENST00000490677 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa22.72■■□□□ 1.23
HOXB3-211ENST00000490677 HAAOP46952 286 aa22.72■■□□□ 1.23
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HOXB3-211ENST00000490677 C11orf42Q8N5U0 333 aa22.72■■□□□ 1.23
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HOXB3-211ENST00000490677 FAM96BQ9Y3D0 163 aa22.72■■□□□ 1.23
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HOXB3-211ENST00000490677 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
HOXB3-211ENST00000490677 HTR1FP30939 366 aa22.71■■□□□ 1.23
HOXB3-211ENST00000490677 RASSF2P50749 326 aa22.71■■□□□ 1.23
HOXB3-211ENST00000490677 PROK1P58294 105 aa22.71■■□□□ 1.23
HOXB3-211ENST00000490677 CATSPERDQ86XM0 798 aa22.71■■□□□ 1.23
HOXB3-211ENST00000490677 CALHM1Q8IU99 346 aa22.71■■□□□ 1.23
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HOXB3-211ENST00000490677 TBX5Q99593 518 aa22.71■■□□□ 1.23
HOXB3-211ENST00000490677 KCNAB3O43448 404 aa22.7■■□□□ 1.22
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HOXB3-211ENST00000490677 APOL3O95236 402 aa22.7■■□□□ 1.22
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HOXB3-211ENST00000490677 Q6ZSV7 163 aa22.7■■□□□ 1.22
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HOXB3-211ENST00000490677 RORBQ92753 470 aa22.7■■□□□ 1.22
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HOXB3-211ENST00000490677 ENOPH1Q9UHY7 261 aa22.7■■□□□ 1.22
HOXB3-211ENST00000490677 VPREB3Q9UKI3 123 aa22.7■■□□□ 1.22
HOXB3-211ENST00000490677 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
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HOXB3-211ENST00000490677 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
HOXB3-211ENST00000490677 ISL1P61371 349 aa22.69■■□□□ 1.22
HOXB3-211ENST00000490677 ACSM1Q08AH1 577 aa22.69■■□□□ 1.22
HOXB3-211ENST00000490677 EME1Q96AY2 570 aa22.69■■□□□ 1.22
HOXB3-211ENST00000490677 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
HOXB3-211ENST00000490677 RNF114Q9Y508 228 aa22.69■■□□□ 1.22
HOXB3-211ENST00000490677 MEIOCA2RUB1 952 aa22.68■■□□□ 1.22
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HOXB3-211ENST00000490677 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa22.68■■□□□ 1.22
HOXB3-211ENST00000490677 C17orf107Q6ZR85 190 aa22.68■■□□□ 1.22
HOXB3-211ENST00000490677 ASRGL1Q7L266 308 aa22.68■■□□□ 1.22
HOXB3-211ENST00000490677 BATF2Q8N1L9 274 aa22.68■■□□□ 1.22
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HOXB3-211ENST00000490677 OCLNQ16625 522 aa22.67■■□□□ 1.22
HOXB3-211ENST00000490677 ANGPTL5Q86XS5 388 aa22.67■■□□□ 1.22
HOXB3-211ENST00000490677 FAM185AQ8N0U4 392 aa22.67■■□□□ 1.22
HOXB3-211ENST00000490677 PRSS35Q8N3Z0 413 aa22.67■■□□□ 1.22
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HOXB3-211ENST00000490677 YIPF7Q8N8F6 280 aa22.67■■□□□ 1.22
HOXB3-211ENST00000490677 OR8J1Q8NGP2 316 aa22.67■■□□□ 1.22
HOXB3-211ENST00000490677 C16orf95Q9H693 158 aa22.67■■□□□ 1.22
HOXB3-211ENST00000490677 NOTCH1P46531 2555 aa22.66■■□□□ 1.22
HOXB3-211ENST00000490677 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa22.66■■□□□ 1.22
HOXB3-211ENST00000490677 METTL15A6NJ78 407 aa22.66■■□□□ 1.22
HOXB3-211ENST00000490677 UBE2V2Q15819 145 aa22.66■■□□□ 1.22
HOXB3-211ENST00000490677 ODF4Q2M2E3 257 aa22.66■■□□□ 1.22
HOXB3-211ENST00000490677 TMEM200BQ69YZ2 307 aa22.66■■□□□ 1.22
HOXB3-211ENST00000490677 MKXQ8IYA7 352 aa22.66■■□□□ 1.22
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