RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489390.1

SHOC2-205, Transcript of SHOC2, leucine rich repeat scaffold protein, human

TSL 5

Gene SHOC2, Length 815 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SHOC2-205	ENST00000489390	ACTA2	P62736	377 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SHOC2-205	ENST00000489390	ACTG2	P63267	376 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SHOC2-205	ENST00000489390	ACTC1	P68032	377 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SHOC2-205	ENST00000489390	ACTA1	P68133	377 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SHOC2-205	ENST00000489390	C9orf152	Q5JTZ5	239 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SHOC2-205	ENST00000489390	ZNF695	Q8IW36	515 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SHOC2-205	ENST00000489390	BCAS4	Q8TDM0	211 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SHOC2-205	ENST00000489390	CHPT1	Q8WUD6	406 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SHOC2-205	ENST00000489390	ZNRF4	Q8WWF5	429 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SHOC2-205	ENST00000489390	STMN2	Q93045	179 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SHOC2-205	ENST00000489390	RAX2	Q96IS3	184 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SHOC2-205	ENST00000489390	HSH2D	Q96JZ2	352 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SHOC2-205	ENST00000489390	DUX3	Q96PT4	197 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SHOC2-205	ENST00000489390	SCOC	Q9UIL1	159 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SHOC2-205	ENST00000489390	IGHV2-26	A0A0B4J1V2	119 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SHOC2-205	ENST00000489390	ZNF732	B4DXR9	585 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SHOC2-205	ENST00000489390	HTR1D	P28221	377 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SHOC2-205	ENST00000489390	FMO3	P31513	532 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SHOC2-205	ENST00000489390	SLC35F1	Q5T1Q4	408 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SHOC2-205	ENST00000489390	FAM86B1	Q8N7N1	296 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SHOC2-205	ENST00000489390	POC1A	Q8NBT0	407 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SHOC2-205	ENST00000489390	OR51L1	Q8NGJ5	315 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SHOC2-205	ENST00000489390	PGAM5	Q96HS1	289 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SHOC2-205	ENST00000489390	OR8B4	Q96RC9	309 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SHOC2-205	ENST00000489390	DNAJC27	Q9NZQ0	273 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SHOC2-205	ENST00000489390	LYVE1	Q9Y5Y7	322 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SHOC2-205	ENST00000489390	SEC14L6	B5MCN3	397 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SHOC2-205	ENST00000489390	MRAS	O14807	208 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SHOC2-205	ENST00000489390	DNAJC8	O75937	253 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
SHOC2-205	ENST00000489390	JTB	O76095	146 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SHOC2-205	ENST00000489390	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
SHOC2-205	ENST00000489390	ARHGDIB	P52566	201 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SHOC2-205	ENST00000489390	CEACAM21	Q3KPI0	293 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SHOC2-205	ENST00000489390	ZBTB49	Q6ZSB9	765 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SHOC2-205	ENST00000489390	KRT74	Q7RTS7	529 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SHOC2-205	ENST00000489390	COMMD1	Q8N668	190 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SHOC2-205	ENST00000489390	ZNF511	Q8NB15	262 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SHOC2-205	ENST00000489390	RNF133	Q8WVZ7	376 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SHOC2-205	ENST00000489390	ISOC1	Q96CN7	298 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SHOC2-205	ENST00000489390	TLCD1	Q96CP7	247 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SHOC2-205	ENST00000489390	ZNF714	Q96N38	554 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SHOC2-205	ENST00000489390	FUZ	Q9BT04	418 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SHOC2-205	ENST00000489390	CLEC7A	Q9BXN2	247 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SHOC2-205	ENST00000489390	VIPAS39	Q9H9C1	493 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SHOC2-205	ENST00000489390	BRD7	Q9NPI1	651 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SHOC2-205	ENST00000489390	FAM32A	Q9Y421	112 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
SHOC2-205	ENST00000489390	SESN1	Q9Y6P5	492 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SHOC2-205	ENST00000489390	OR5B21	A6NL26	309 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390		K7N7A8	449 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	RHCE	P18577	417 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	HAGHL	Q6PII5	290 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	EGFL6	Q8IUX8	553 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	ZNF676	Q8N7Q3	588 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	OR4P4	Q8NGL7	312 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	OR8U1	Q8NH10	309 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	DHRS1	Q96LJ7	313 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	TMEM133	Q9H2Q1	129 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	EDA2R	Q9HAV5	297 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	DPM3	Q9P2X0	92 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	HHLA2	Q9UM44	414 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	MEX3A	A1L020	520 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	BBIP1	A8MTZ0	92 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	CXCR6	O00574	342 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	SERPINA1	P01009	418 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	SLC35B1	P78383	322 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	MEF2C	Q06413	473 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	METTL21C	Q5VZV1	264 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	KRT77	Q7Z794	578 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	OR5A2	Q8NGI9	324 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	OR4Q3	Q8NH05	313 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	OR52J3	Q8NH60	311 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	ZNF488	Q96MN9	340 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	NRIP2	Q9BQI9	281 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	GID8	Q9NWU2	228 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	NDUFAF4	Q9P032	175 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	AP3M1	Q9Y2T2	418 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	HERC2	O95714	4834 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	NOS1AP	O75052	506 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	LY86	O95711	162 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	FRMD6-AS1	P0C7T7	363 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	OPRL1	P41146	370 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	EDDM3B	P56851	147 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	SNAPC1	Q16533	368 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	CEP78	Q5JTW2	689 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	GDPD3	Q7L5L3	318 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	TCF23	Q7RTU1	214 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	OVCH2	Q7RTZ1	564 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	LINC00471	Q8N535	108 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	CDRT15	Q96T59	188 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	ABHD6	Q9BV23	337 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	OR14J1	Q9UGF5	321 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	MOB4	Q9Y3A3	225 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	HSPE1-MOB4	S4R3N1	261 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	NXPH2	O95156	264 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	MAP2K3	P46734	347 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	GSS	P48637	474 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	VEGFC	P49767	419 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SHOC2-205	ENST00000489390	INSL3	P51460	131 aa		11.17	□□□□□ -0.62

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