RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488989.1

CLDN11-208, Transcript of claudin 11, human

TSL 4

Gene CLDN11, Length 600 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLDN11-208	ENST00000488989	OR2V2	Q96R30	315 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	SMURF1	Q9HCE7	757 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	DYNLRB1	Q9NP97	96 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	IGKV1-12	A0A0C4DH73	117 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	TMEM14DP	A8MWL7	114 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	IGKV1D-12	P01611	117 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	TMEM225B	P0DP42	221 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	ARSB	P15848	533 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	CFHR2	P36980	270 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	POU3F4	P49335	361 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	TNFAIP6	P98066	277 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	P2RY14	Q15391	338 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	TESK1	Q15569	626 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	HAGHL	Q6PII5	290 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	OR2W3	Q7Z3T1	314 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	MKX	Q8IYA7	352 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	OR5H6	Q8NGV6	325 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	ZNF671	Q8TAW3	534 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	ITLN1	Q8WWA0	313 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	ERGIC1	Q969X5	290 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	PTX4	Q96A99	478 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	CLEC4M	Q9H2X3	399 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	UBTD1	Q9HAC8	227 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	TMEM272	A0A1B0GTI8	110 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	CTDSP2	O14595	271 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	SPRY1	O43609	319 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	SYNGR1	O43759	233 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	NOS1AP	O75052	506 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	KDM4B	O94953	1096 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	GRP	P07492	148 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	VSIG8	P0DPA2	414 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	RAB6A	P20340	208 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	BMX	P51813	675 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	GPR176	Q14439	515 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	MPPED2	Q15777	294 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	SPRN	Q5BIV9	151 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	PRAMEF6	Q5VXH4	476 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	C20orf204	Q6ZNR8	217 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	SLC25A26	Q70HW3	274 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	CDH24	Q86UP0	819 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	OR6Q1	Q8NGQ2	317 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	OR10Z1	Q8NGY1	313 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	OR51F2	Q8NH61	342 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989		Q8TCH9	128 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	WDFY2	Q96P53	400 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	METTL9	Q9H1A3	318 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	MIXL1	Q9H2W2	232 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	RHOF	Q9HBH0	211 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	COMMD3	Q9UBI1	195 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	ING4	Q9UNL4	249 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	POLDIP2	Q9Y2S7	368 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	PEX16	Q9Y5Y5	336 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	DCHS2	Q6V1P9	2916 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	UTP20	O75691	2785 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	CDIPT	O14735	213 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	ANGPTL7	O43827	346 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	PGA5	P0DJD9	388 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	BMP4	P12644	408 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	TNFRSF1A	P19438	455 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	ERVK11-1	P61568	191 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	UNC119	Q13432	240 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	ELP2	Q6IA86	826 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	WDR82	Q6UXN9	313 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	ZCCHC24	Q8N2G6	241 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	KCNG3	Q8TAE7	436 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	S100A13	Q99584	98 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	EGLN1	Q9GZT9	426 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	C6orf62	Q9GZU0	229 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	ABCG5	Q9H222	651 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	MTCH1	Q9NZJ7	389 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	LRBA	P50851	2863 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989		H7C417	338 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	RHBDL1	O75783	438 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	CYB5A	P00167	134 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	PLAT	P00750	562 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	APOA1	P02647	267 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	COL8A1	P27658	744 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	PMEL	P40967	661 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	ZNF181	Q2M3W8	571 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	POC1A	Q8NBT0	407 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	SLC25A38	Q96DW6	304 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	MRPS24	Q96EL2	167 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	POM121	Q96HA1	1249 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	CST11	Q9H112	138 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	KCNK15	Q9H427	330 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	FN3KRP	Q9HA64	309 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	GCM1	Q9NP62	436 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	PCDHB16	Q9NRJ7	776 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989	RAB22A	Q9UL26	194 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CLDN11-208	ENST00000488989		A0A1W2PP11	408 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CLDN11-208	ENST00000488989		A6NLC8	198 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CLDN11-208	ENST00000488989	TRAPPC2L	H3BP13	241 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CLDN11-208	ENST00000488989	OVOL3	O00110	214 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CLDN11-208	ENST00000488989	CDC14B	O60729	498 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CLDN11-208	ENST00000488989	HPGDS	O60760	199 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CLDN11-208	ENST00000488989	SFTPB	P07988	381 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CLDN11-208	ENST00000488989	CCL8	P80075	99 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CLDN11-208	ENST00000488989	PLA2G7	Q13093	441 aa		13.52	□□□□□ -0.25

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