RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487290.5

HCLS1-208, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, human

TSL 2

Gene HCLS1, Length 1,078 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HCLS1-208	ENST00000487290	STUM	Q69YW2	141 aa		13.85	□□□□□ -0.19
HCLS1-208	ENST00000487290	HAGHL	Q6PII5	290 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
HCLS1-208	ENST00000487290	KCTD8	Q6ZWB6	473 aa		13.85	□□□□□ -0.19
HCLS1-208	ENST00000487290	ZNF367	Q7RTV3	350 aa		13.85	□□□□□ -0.19
HCLS1-208	ENST00000487290	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		13.85	□□□□□ -0.19
HCLS1-208	ENST00000487290	CALHM1	Q8IU99	346 aa		13.85	□□□□□ -0.19
HCLS1-208	ENST00000487290	MS4A15	Q8N5U1	240 aa		13.85	□□□□□ -0.19
HCLS1-208	ENST00000487290	ZFP41	Q8N8Y5	198 aa		13.85	□□□□□ -0.19
HCLS1-208	ENST00000487290	LINC01356	Q8N9X3	169 aa		13.85	□□□□□ -0.19
HCLS1-208	ENST00000487290	OR5D14	Q8NGL3	314 aa		13.85	□□□□□ -0.19
HCLS1-208	ENST00000487290	TSEN15	Q8WW01	171 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
HCLS1-208	ENST00000487290	BORCS8	Q96FH0	119 aa		13.85	□□□□□ -0.19
HCLS1-208	ENST00000487290	SMR3A	Q99954	134 aa		13.85	□□□□□ -0.19
HCLS1-208	ENST00000487290	NRIP2	Q9BQI9	281 aa		13.85	□□□□□ -0.19
HCLS1-208	ENST00000487290	DNTTIP1	Q9H147	329 aa		13.85	□□□□□ -0.19
HCLS1-208	ENST00000487290	METTL17	Q9H7H0	456 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
HCLS1-208	ENST00000487290	ACOT13	Q9NPJ3	140 aa		13.85	□□□□□ -0.19
HCLS1-208	ENST00000487290	RASL12	Q9NYN1	266 aa		13.85	□□□□□ -0.19
HCLS1-208	ENST00000487290	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		13.85	□□□□□ -0.19
HCLS1-208	ENST00000487290	PPIAL4C	A0A0B4J2A2	164 aa		13.84	□□□□□ -0.19
HCLS1-208	ENST00000487290	hCG_1807616	A0A1W2PRN6	198 aa		13.84	□□□□□ -0.19
HCLS1-208	ENST00000487290	ISPD	A4D126	451 aa		13.84	□□□□□ -0.19
HCLS1-208	ENST00000487290	ALDOB	P05062	364 aa		13.84	□□□□□ -0.19
HCLS1-208	ENST00000487290	WNT2	P09544	360 aa		13.84	□□□□□ -0.19
HCLS1-208	ENST00000487290	CPE	P16870	476 aa		13.84	□□□□□ -0.19
HCLS1-208	ENST00000487290	MED22	Q15528	200 aa		13.84	□□□□□ -0.19
HCLS1-208	ENST00000487290	C11orf91	Q3C1V1	193 aa		13.84	□□□□□ -0.19
HCLS1-208	ENST00000487290	DMRTC1	Q5HYR2	192 aa		13.84	□□□□□ -0.19
HCLS1-208	ENST00000487290	UBE2U	Q5VVX9	321 aa		13.84	□□□□□ -0.19
HCLS1-208	ENST00000487290	CYB5R2	Q6BCY4	276 aa		13.84	□□□□□ -0.19
HCLS1-208	ENST00000487290	ZNF773	Q6PK81	442 aa		13.84	□□□□□ -0.19
HCLS1-208	ENST00000487290	CLEC9A	Q6UXN8	241 aa		13.84	□□□□□ -0.19
HCLS1-208	ENST00000487290	UNQ9370/PRO34162	Q6UXP9	181 aa		13.84	□□□□□ -0.19
HCLS1-208	ENST00000487290	OR13C9	Q8NGT0	318 aa		13.84	□□□□□ -0.19
HCLS1-208	ENST00000487290	ZNF671	Q8TAW3	534 aa		13.84	□□□□□ -0.19
HCLS1-208	ENST00000487290	DERL3	Q96Q80	235 aa		13.84	□□□□□ -0.19
HCLS1-208	ENST00000487290	NEK6	Q9HC98	313 aa		13.84	□□□□□ -0.19
HCLS1-208	ENST00000487290	MIOX	Q9UGB7	285 aa		13.84	□□□□□ -0.19
HCLS1-208	ENST00000487290	KIAA1324L	A8MWY0	1029 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
HCLS1-208	ENST00000487290	ZNF879	B4DU55	563 aa		13.83	□□□□□ -0.2
HCLS1-208	ENST00000487290	SYNGR1	O43759	233 aa		13.83	□□□□□ -0.2
HCLS1-208	ENST00000487290	ZNF16	P17020	682 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
HCLS1-208	ENST00000487290	CD80	P33681	288 aa		13.83	□□□□□ -0.2
HCLS1-208	ENST00000487290	ATP1B3	P54709	279 aa		13.83	□□□□□ -0.2
HCLS1-208	ENST00000487290	DVL1P1	P54792	670 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
HCLS1-208	ENST00000487290	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
HCLS1-208	ENST00000487290	EMX1	Q04741	257 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
HCLS1-208	ENST00000487290	ZNF841	Q6ZN19	808 aa		13.83	□□□□□ -0.2
HCLS1-208	ENST00000487290	SPART	Q8N0X7	666 aa		13.83	□□□□□ -0.2
HCLS1-208	ENST00000487290	SVOP	Q8N4V2	548 aa		13.83	□□□□□ -0.2
HCLS1-208	ENST00000487290	OR13C5	Q8NGS8	318 aa		13.83	□□□□□ -0.2
HCLS1-208	ENST00000487290	UFD1	Q92890	307 aa		13.83	□□□□□ -0.2
HCLS1-208	ENST00000487290	DACT3	Q96B18	629 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
HCLS1-208	ENST00000487290	MGLL	Q99685	303 aa		13.83	□□□□□ -0.2
HCLS1-208	ENST00000487290	GSX1	Q9H4S2	264 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
HCLS1-208	ENST00000487290	NARFL	Q9H6Q4	476 aa		13.83	□□□□□ -0.2
HCLS1-208	ENST00000487290	SEBOX	Q9HB31	216 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
HCLS1-208	ENST00000487290	ZNF222	Q9UK12	451 aa		13.83	□□□□□ -0.2
HCLS1-208	ENST00000487290	SF3B6	Q9Y3B4	125 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
HCLS1-208	ENST00000487290	MSMB	P08118	114 aa		13.82	□□□□□ -0.2
HCLS1-208	ENST00000487290	RAB3A	P20336	220 aa		13.82	□□□□□ -0.2
HCLS1-208	ENST00000487290	EEF1B2	P24534	225 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
HCLS1-208	ENST00000487290	PSMA1	P25786	263 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
HCLS1-208	ENST00000487290	MAPK3	P27361	379 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
HCLS1-208	ENST00000487290	MAP2K4	P45985	399 aa		13.82	□□□□□ -0.2
HCLS1-208	ENST00000487290	NPY4R	P50391	375 aa		13.82	□□□□□ -0.2
HCLS1-208	ENST00000487290	ZP1	P60852	638 aa		13.82	□□□□□ -0.2
HCLS1-208	ENST00000487290	TRAM1	Q15629	374 aa		13.82	□□□□□ -0.2
HCLS1-208	ENST00000487290	MICB	Q29980	383 aa		13.82	□□□□□ -0.2
HCLS1-208	ENST00000487290	SAXO1	Q8IYX7	474 aa		13.82	□□□□□ -0.2
HCLS1-208	ENST00000487290	ZSCAN4	Q8NAM6	433 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
HCLS1-208	ENST00000487290	OR51F2	Q8NH61	342 aa		13.82	□□□□□ -0.2
HCLS1-208	ENST00000487290	ANGPTL6	Q8NI99	470 aa		13.82	□□□□□ -0.2
HCLS1-208	ENST00000487290	TRMT10A	Q8TBZ6	339 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
HCLS1-208	ENST00000487290	FCGR1B	Q92637	280 aa		13.82	□□□□□ -0.2
HCLS1-208	ENST00000487290	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
HCLS1-208	ENST00000487290	OR14A2	Q96R54	314 aa		13.82	□□□□□ -0.2
HCLS1-208	ENST00000487290	CCDC90B	Q9GZT6	254 aa		13.82	□□□□□ -0.2
HCLS1-208	ENST00000487290	WDR13	Q9H1Z4	485 aa		13.82	□□□□□ -0.2
HCLS1-208	ENST00000487290	RHOF	Q9HBH0	211 aa		13.82	□□□□□ -0.2
HCLS1-208	ENST00000487290	FOXJ3	Q9UPW0	622 aa		13.82	□□□□□ -0.2
HCLS1-208	ENST00000487290	ARHGAP32	A7KAX9	2087 aa		13.81	□□□□□ -0.2
HCLS1-208	ENST00000487290	FAM230A	A0A1W2PPH8	454 aa		13.81	□□□□□ -0.2
HCLS1-208	ENST00000487290	C3orf80	F5H4A9	247 aa		13.81	□□□□□ -0.2
HCLS1-208	ENST00000487290	PIN1P1	O15428	100 aa		13.81	□□□□□ -0.2
HCLS1-208	ENST00000487290	AKR7A2	O43488	359 aa		13.81	□□□□□ -0.2
HCLS1-208	ENST00000487290	ZNF205	O95201	554 aa		13.81	□□□□□ -0.2
HCLS1-208	ENST00000487290	RPS2	P15880	293 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
HCLS1-208	ENST00000487290	AMY2B	P19961	511 aa		13.81	□□□□□ -0.2
HCLS1-208	ENST00000487290	SOX2	P48431	317 aa		13.81	□□□□□ -0.2
HCLS1-208	ENST00000487290	PAX2	Q02962	417 aa		13.81	□□□□□ -0.2
HCLS1-208	ENST00000487290	SMIM21	Q3B7S5	101 aa		13.81	□□□□□ -0.2
HCLS1-208	ENST00000487290	ACP7	Q6ZNF0	438 aa		13.81	□□□□□ -0.2
HCLS1-208	ENST00000487290	ANGPTL5	Q86XS5	388 aa		13.81	□□□□□ -0.2
HCLS1-208	ENST00000487290	LYPD6	Q86Y78	171 aa		13.81	□□□□□ -0.2
HCLS1-208	ENST00000487290	PHC2	Q8IXK0	858 aa		13.81	□□□□□ -0.2
HCLS1-208	ENST00000487290		Q8IYB0	196 aa		13.81	□□□□□ -0.2
HCLS1-208	ENST00000487290	OR51A2	Q8NGJ7	313 aa		13.81	□□□□□ -0.2
HCLS1-208	ENST00000487290	NPRL2	Q8WTW4	380 aa		13.81	□□□□□ -0.2
HCLS1-208	ENST00000487290	CPNE2	Q96FN4	548 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2

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