RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475959.1

GTPBP1-208, Transcript of GTP binding protein 1, human

TSL 2

Gene GTPBP1, Length 475 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP1-208	ENST00000475959	TCF21	O43680	179 aa		9.19	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	ENSA	O43768	121 aa	Known RBP	9.19	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	XPNPEP2	O43895	674 aa		9.19	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	INMT	O95050	263 aa		9.19	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	FADS2	O95864	444 aa	Known RBP	9.19	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	LALBA	P00709	142 aa		9.19	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	PSG2	P11465	335 aa		9.19	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	MMP9	P14780	707 aa		9.19	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	CPT2	P23786	658 aa		9.19	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	MPZ	P25189	248 aa		9.19	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	CAPG	P40121	348 aa		9.19	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	NPY4R	P50391	375 aa		9.19	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	AQP4	P55087	323 aa		9.19	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	DLX1	P56177	255 aa		9.19	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	PRB3	Q04118	309 aa	Predicted RBP	9.19	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	KCNJ8	Q15842	424 aa		9.19	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	RUSC1-AS1	Q66K80	236 aa		9.19	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	ASPHD2	Q6ICH7	369 aa		9.19	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	BTNL3	Q6UXE8	466 aa		9.19	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	ACP7	Q6ZNF0	438 aa		9.19	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	UPRT	Q96BW1	309 aa		9.19	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	C12orf43	Q96C57	262 aa	Known RBP	9.19	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959		Q96MT0	163 aa		9.19	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	TBX15	Q96SF7	602 aa		9.19	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	PDCD1LG2	Q9BQ51	273 aa		9.19	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	JAM3	Q9BX67	310 aa		9.19	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	SIRPD	Q9H106	197 aa		9.19	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	FGF20	Q9NP95	211 aa	Predicted RBP	9.19	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	TRIM36	Q9NQ86	728 aa		9.19	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		9.19	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	CLEC2D	Q9UHP7	191 aa		9.19	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	RPL36	Q9Y3U8	105 aa	Known RBP	9.19	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	PCDHGB1	Q9Y5G3	927 aa		9.19	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	NKX6-3	A6NJ46	265 aa		9.18	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	COL6A5	A8TX70	2615 aa		9.18	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	SIGLEC5	O15389	551 aa		9.18	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	NDUFA2	O43678	99 aa		9.18	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZFPL1	O95159	310 aa		9.18	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	ISG15	P05161	165 aa		9.18	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	TGM4	P49221	684 aa		9.18	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	CCR9	P51686	369 aa		9.18	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	HILS1	P60008	231 aa		9.18	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	ATPAF1	Q5TC12	328 aa	Predicted RBP	9.18	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	TTC23	Q5W5X9	447 aa		9.18	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	BRD3OS	Q6XYD6	125 aa		9.18	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	CD177	Q8N6Q3	437 aa		9.18	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	KIRREL3-AS3	Q8N7Y1	241 aa	Predicted RBP	9.18	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNRF1	Q8ND25	227 aa		9.18	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	OR13C9	Q8NGT0	318 aa		9.18	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	RPS4Y2	Q8TD47	263 aa		9.18	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	FBLIM1	Q8WUP2	373 aa		9.18	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	ITFG2	Q969R8	447 aa		9.18	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	SLAMF9	Q96A28	289 aa		9.18	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	RFT1	Q96AA3	541 aa		9.18	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	TMIGD2	Q96BF3	282 aa		9.18	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	C1orf147	Q96MC9	270 aa	Predicted RBP	9.18	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	SPACA5	Q96QH8	159 aa		9.18	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	NKX3-1	Q99801	234 aa	Predicted RBP	9.18	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	NRIP2	Q9BQI9	281 aa		9.18	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	PCGF1	Q9BSM1	259 aa		9.18	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	C19orf24	Q9BVV8	132 aa		9.18	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	HES4	Q9HCC6	221 aa		9.18	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	C8orf4	Q9NR00	106 aa		9.18	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	INPP5E	Q9NRR6	644 aa		9.18	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	RPUSD1	Q9UJJ7	312 aa	Known RBP	9.18	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	NUP50	Q9UKX7	468 aa		9.18	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	MAB21L2	Q9Y586	359 aa		9.18	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	9.18	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF879	B4DU55	563 aa		9.17	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	GATB	O75879	557 aa	Known RBP	9.17	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF20	P17024	532 aa		9.17	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	AZGP1	P25311	298 aa	Known RBP	9.17	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	GABRA2	P47869	451 aa		9.17	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	POU3F4	P49335	361 aa		9.17	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	ERVK11-1	P61568	191 aa		9.17	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	IL13RA1	P78552	427 aa		9.17	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	SLC34A1	Q06495	639 aa		9.17	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	IL18R1	Q13478	541 aa		9.17	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	TMEM244	Q5VVB8	128 aa		9.17	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	SLC36A1	Q7Z2H8	476 aa		9.17	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	KCTD20	Q7Z5Y7	419 aa		9.17	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF573	Q86YE8	665 aa		9.17	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	C8orf59	Q8N0T1	100 aa	Predicted RBP	9.17	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	BPIFB2	Q8N4F0	458 aa		9.17	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF676	Q8N7Q3	588 aa		9.17	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	SIGLECL1	Q8N7X8	197 aa		9.17	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZDHHC22	Q8N966	263 aa		9.17	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	SETD9	Q8NE22	299 aa		9.17	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	TMEM185A	Q8NFB2	350 aa		9.17	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	OR13C3	Q8NGS6	347 aa		9.17	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	OR13C5	Q8NGS8	318 aa		9.17	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	SGCD	Q92629	289 aa		9.17	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	GGH	Q92820	318 aa		9.17	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	FGGY	Q96C11	551 aa		9.17	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	DUX5	Q96PT3	197 aa		9.17	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	DCTN5	Q9BTE1	182 aa		9.17	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	PKIB	Q9C010	78 aa		9.17	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	DCLRE1B	Q9H816	532 aa		9.17	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	MTCH1	Q9NZJ7	389 aa		9.17	□□□□□ -0.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	SLC25A10	Q9UBX3	287 aa	Predicted RBP	9.17	□□□□□ -0.94

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