RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	OR2G2	Q8NGZ5	317 aa		12.26	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	GCDH	Q92947	438 aa	Predicted RBP	12.26	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	WDFY2	Q96P53	400 aa		12.26	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	GAFA1	Q96PS6	74 aa		12.26	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	KAAG1	Q9UBP8	84 aa		12.26	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	RPUSD1	Q9UJJ7	312 aa	Known RBP	12.26	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	TENM1	Q9UKZ4	2725 aa		12.26	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	MDFIC2	A0A1B0GVS7	189 aa		12.25	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	DHRS7C	A6NNS2	312 aa		12.25	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	CLIC3	O95833	236 aa		12.25	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	PSG2	P11465	335 aa		12.25	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	CCL1	P22362	96 aa		12.25	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	PEX2	P28328	305 aa		12.25	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	CEBPD	P49716	269 aa	Predicted RBP	12.25	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	12.25	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	C12orf54	Q6X4T0	127 aa		12.25	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	CMTM4	Q8IZR5	234 aa		12.25	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	POC1A	Q8NBT0	407 aa		12.25	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	ZNRF1	Q8ND25	227 aa		12.25	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	OR13C3	Q8NGS6	347 aa		12.25	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	RHOXF1	Q8NHV9	184 aa		12.25	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	ANGPTL6	Q8NI99	470 aa		12.25	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	FGGY	Q96C11	551 aa		12.25	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	BORCS8	Q96FH0	119 aa		12.25	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	CNTD2	Q9H8S5	307 aa		12.25	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	ELL3	Q9HB65	397 aa	Predicted RBP	12.25	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	ESM1	Q9NQ30	184 aa		12.25	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	FRRS1L	Q9P0K9	344 aa		12.25	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	EXOG	Q9Y2C4	368 aa	Known RBP	12.25	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	MYRF	Q9Y2G1	1151 aa		12.25	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	RPL36	Q9Y3U8	105 aa	Known RBP	12.25	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	PQLC2L	A1A4F0	135 aa		12.24	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	DNAJC9-AS1	A6NH13	148 aa		12.24	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	RFPL4A	A6NLU0	287 aa		12.24	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	RFPL4AL1	F8VTS6	287 aa		12.24	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	SLC1A7	O00341	560 aa		12.24	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	FCN3	O75636	299 aa		12.24	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	GABRB1	P18505	474 aa		12.24	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	AMY2B	P19961	511 aa		12.24	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	POU3F4	P49335	361 aa		12.24	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	FUT6	P51993	359 aa		12.24	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	NANOS3	P60323	173 aa	Known RBP	12.24	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	PRB3	Q04118	309 aa	Predicted RBP	12.24	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	GALE	Q14376	348 aa		12.24	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	UBE2V2	Q15819	145 aa		12.24	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	SMN1	Q16637	294 aa	Known RBP	12.24	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	DGUOK	Q16854	277 aa		12.24	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	KLHL22	Q53GT1	634 aa		12.24	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM42	Q69YG0	159 aa		12.24	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	ACP7	Q6ZNF0	438 aa		12.24	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		12.24	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	CALHM1	Q8IU99	346 aa		12.24	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	FAM185A	Q8N0U4	392 aa		12.24	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	ZDHHC22	Q8N966	263 aa		12.24	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	CCDC54	Q8NEL0	328 aa		12.24	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	OR52I1	Q8NGK6	324 aa		12.24	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	CNIH3	Q8TBE1	160 aa		12.24	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	DACT3	Q96B18	629 aa	Predicted RBP	12.24	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	PELI1	Q96FA3	418 aa		12.24	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	DNTTIP1	Q9H147	329 aa		12.24	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	ISG20L2	Q9H9L3	353 aa	Known RBP	12.24	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	SIRT7	Q9NRC8	400 aa		12.24	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	FBN3	Q75N90	2809 aa		12.23	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	IGKV1D-17	A0A075B6S4	117 aa		12.23	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880		A0A1W2PRD5	423 aa		12.23	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880		A0A1W2PRF3	423 aa		12.23	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880		A0A1W2PRM7	423 aa		12.23	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880		J3QRE1	110 aa		12.23	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	GPR37	O15354	613 aa		12.23	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	SIGLEC5	O15389	551 aa		12.23	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	CYB5A	P00167	134 aa		12.23	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	ACAA1	P09110	424 aa	Predicted RBP	12.23	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	PGA5	P0DJD9	388 aa		12.23	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	TGM4	P49221	684 aa		12.23	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	GBX2	P52951	348 aa	Predicted RBP	12.23	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	UBA52	P62987	128 aa	Known RBP	12.23	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	RAB40B	Q12829	278 aa		12.23	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	ALKBH1	Q13686	389 aa	Known RBP	12.23	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	PDCD1	Q15116	288 aa		12.23	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	VMO1	Q7Z5L0	202 aa		12.23	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	TSEN15	Q8WW01	171 aa	Known RBP	12.23	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	GATAD2B	Q8WXI9	593 aa		12.23	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	PP6455	Q8WZ26	134 aa		12.23	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	SLAMF9	Q96A28	289 aa		12.23	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	12.23	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	RDH12	Q96NR8	316 aa		12.23	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	TBX15	Q96SF7	602 aa		12.23	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	DCTN5	Q9BTE1	182 aa		12.23	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	CHST5	Q9GZS9	411 aa		12.23	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	COMMD4	Q9H0A8	199 aa		12.23	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	ERVK13-1	Q9NX77	482 aa		12.23	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	RASL12	Q9NYN1	266 aa		12.23	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	HHLA2	Q9UM44	414 aa		12.23	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880		E9PQ18	207 aa		12.22	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	PRDX2	P32119	198 aa		12.22	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	ATP1B3	P54709	279 aa		12.22	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	SNU13	P55769	128 aa	Known RBP	12.22	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	ISL1	P61371	349 aa		12.22	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	BLMH	Q13867	455 aa		12.22	□□□□□ -0.45
SSR4-208	ENST00000471880	DEFB112	Q30KQ8	113 aa		12.22	□□□□□ -0.45

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