RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470271.5

CTPS1-206, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 801 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-206ENST00000470271 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 PP6455Q8WZ26 134 aa16.5■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 UPRTQ96BW1 309 aa16.5■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 JAM3Q9BX67 310 aa16.5■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 RASL12Q9NYN1 266 aa16.5■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 NUP50Q9UKX7 468 aa16.5■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 HHLA2Q9UM44 414 aa16.5■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa16.5■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa16.49■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 LIMS3P0CW19 117 aa16.49■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 LIMS4P0CW20 117 aa16.49■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 DCKP27707 260 aa16.49■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 SLC34A1Q06495 639 aa16.49■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 IKZF1Q13422 519 aa16.49■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa16.49■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 LRRC10Q5BKY1 277 aa16.49■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF788Q6ZQV5 615 aa16.49■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 BPIFB2Q8N4F0 458 aa16.49■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF676Q8N7Q3 588 aa16.49■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 NPRL2Q8WTW4 380 aa16.49■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 MED30Q96HR3 178 aa16.49■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 GPR37O15354 613 aa16.48■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 GNAO1P09471 354 aa16.48■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 PGA5P0DJD9 388 aa16.48■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 PSG2P11465 335 aa16.48■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF20P17024 532 aa16.48■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 MPZP25189 248 aa16.48■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 GABRA2P47869 451 aa16.48■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 FUT6P51993 359 aa16.48■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 FGF12P61328 243 aa16.48■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 IL13RA1P78552 427 aa16.48■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 SMIM21Q3B7S5 101 aa16.48■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 ACP7Q6ZNF0 438 aa16.48■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 USP43Q70EL4 1123 aa16.48■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 ANGPTL5Q86XS5 388 aa16.48■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 CALHM1Q8IU99 346 aa16.48■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 FGFRL1Q8N441 504 aa16.48■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa16.48■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 C22orf15Q8WYQ4 148 aa16.48■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 FGGYQ96C11 551 aa16.48■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF488Q96MN9 340 aa16.48■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 GAFA1Q96PS6 74 aa16.48■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 SLC6A7Q99884 636 aa16.48■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 SUCNR1Q9BXA5 334 aa16.48■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 PKIBQ9C010 78 aa16.48■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa16.47■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF879B4DU55 563 aa16.47■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 E9PI62 339 aa16.47■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 SIGLEC5O15389 551 aa16.47■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 TFF1P04155 84 aa16.47■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 RPSAP08865 295 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 CCDC159P0C7I6 412 aa16.47■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa16.47■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 SELLP14151 372 aa16.47■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 IL24Q13007 206 aa16.47■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 OR51A4Q8NGJ6 313 aa16.47■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 OR13C3Q8NGS6 347 aa16.47■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 OR10AC1Q8NH08 325 aa16.47■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 BORCS8Q96FH0 119 aa16.47■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 NRIP2Q9BQI9 281 aa16.47■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF69Q9UC07 566 aa16.47■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 TRAV40A0A0B4J280 105 aa16.46■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 TMEM212A6NML5 194 aa16.46■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 NXPH2O95156 264 aa16.46■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 ZFPL1O95159 310 aa16.46■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 VENTXO95231 258 aa16.46■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 MYL12AP19105 171 aa16.46■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 ETV1P50549 477 aa16.46■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 DGUOKQ16854 277 aa16.46■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa16.46■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 UTS2BQ765I0 119 aa16.46■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 PHC2Q8IXK0 858 aa16.46■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 DNAAF1Q8NEP3 725 aa16.46■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 OR5AK2Q8NH90 309 aa16.46■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 PCGF1Q9BSM1 259 aa16.46■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 COMMD4Q9H0A8 199 aa16.46■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF222Q9UK12 451 aa16.46■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
CTPS1-206ENST00000470271 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa16.45■□□□□ 0.22
CTPS1-206ENST00000470271 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa16.45■□□□□ 0.22
CTPS1-206ENST00000470271 RFPL4AA6NLU0 287 aa16.45■□□□□ 0.22
CTPS1-206ENST00000470271 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa16.45■□□□□ 0.22
CTPS1-206ENST00000470271 TOX4O94842 621 aa16.45■□□□□ 0.22
CTPS1-206ENST00000470271 ATF1P18846 271 aa16.45■□□□□ 0.22
CTPS1-206ENST00000470271 RBP2P50120 134 aa16.45■□□□□ 0.22
CTPS1-206ENST00000470271 HILS1P60008 231 aa16.45■□□□□ 0.22
CTPS1-206ENST00000470271 METTL11BQ5VVY1 283 aa16.45■□□□□ 0.22
CTPS1-206ENST00000470271 SDSLQ96GA7 329 aa16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.3 ms