RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470095.5

HPS1-209, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene HPS1, Length 801 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-209ENST00000470095 AKIP1Q9NQ31 210 aa12.06□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 C14orf119Q9NWQ9 140 aa12.06□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa12.06□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 IL36GQ9NZH8 169 aa12.06□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 GHRLQ9UBU3 117 aa12.06□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 ING4Q9UNL4 249 aa12.06□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 CACNA1DQ01668 2161 aa12.05□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 C17orf100A8MU93 164 aa12.05□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 RHBDL1O75783 438 aa12.05□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 APOA1P02647 267 aa12.05□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 CD55P08174 381 aa12.05□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 RAB6AP20340 208 aa12.05□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 ETV6P41212 452 aa12.05□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 RANBP1P43487 201 aa12.05□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 MZT1Q08AG7 82 aa12.05□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 IL24Q13007 206 aa12.05□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 SLC22A6Q4U2R8 563 aa12.05□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 C11orf71Q6IPW1 123 aa12.05□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 TMEM200AQ86VY9 491 aa12.05□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 CMTM4Q8IZR5 234 aa12.05□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 FBXL14Q8N1E6 418 aa12.05□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 ITLN1Q8WWA0 313 aa12.05□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 SLAMF9Q96A28 289 aa12.05□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 PTX4Q96A99 478 aa12.05□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 OR2V2Q96R30 315 aa12.05□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 METTL9Q9H1A3 318 aa12.05□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 ABCG5Q9H222 651 aa12.05□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 RHBDL2Q9NX52 303 aa12.05□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa12.05□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa12.05□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 CDC14BO60729 498 aa12.04□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 KDM4BO94953 1096 aa12.04□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 GRPP07492 148 aa12.04□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 SFTPBP07988 381 aa12.04□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 DANCRP0C864 163 aa12.04□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 SERPINA2P20848 420 aa12.04□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 GATA4P43694 442 aa12.04□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 ART1P52961 327 aa12.04□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 MPPED2Q15777 294 aa12.04□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 CNIH2Q6PI25 160 aa12.04□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 ZNF826PQ6ZT77 177 aa12.04□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 DTX2Q86UW9 622 aa12.04□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa12.04□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 Q8NFD4 153 aa12.04□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 OR4M1Q8NGD0 313 aa12.04□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 OR51F2Q8NH61 342 aa12.04□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 KCNG3Q8TAE7 436 aa12.04□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 FAM46BQ96A09 425 aa12.04□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 CEP19Q96LK0 163 aa12.04□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 DIRC2Q96SL1 478 aa12.04□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 BANF2Q9H503 90 aa12.04□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 DYNLRB1Q9NP97 96 aa12.04□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 MTCH1Q9NZJ7 389 aa12.04□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 ADAM30Q9UKF2 790 aa12.04□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 RAB22AQ9UL26 194 aa12.04□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 V9GYH0 126 aa12.04□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 FLNCQ14315 2725 aa12.04□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 FAM25AB3EWG3 89 aa12.03□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 FAM25CB3EWG5 89 aa12.03□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 FAM25GB3EWG6 89 aa12.03□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 F8VVB4 439 aa12.03□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 F8VWA3 439 aa12.03□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 CDIPTO14735 213 aa12.03□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 CTAG2O75638 210 aa12.03□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 MPIG6BO95866 241 aa12.03□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 CD8AP01732 235 aa12.03□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 SOD3P08294 240 aa12.03□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 MGMTP16455 207 aa12.03□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 BCL3P20749 454 aa12.03□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 NPBWR2P48146 333 aa12.03□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 SRP9P49458 86 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 ERVK11-1P61568 191 aa12.03□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 RSU1Q15404 277 aa12.03□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 WDR82Q6UXN9 313 aa12.03□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 CDH24Q86UP0 819 aa12.03□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 MKXQ8IYA7 352 aa12.03□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 RAB40AQ8WXH6 277 aa12.03□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 DIRAS2Q96HU8 199 aa12.03□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 ZNF488Q96MN9 340 aa12.03□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 S100A13Q99584 98 aa12.03□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 SOSTQ9BQB4 213 aa12.03□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 TMEM59Q9BXS4 323 aa12.03□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 CST11Q9H112 138 aa12.03□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 LPAR5Q9H1C0 372 aa12.03□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 CBLN4Q9NTU7 201 aa12.03□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 UFSP2Q9NUQ7 469 aa12.03□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 IL19Q9UHD0 177 aa12.03□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
HPS1-209ENST00000470095 TANC2Q9HCD6 1990 aa12.02□□□□□ -0.49
HPS1-209ENST00000470095 A0A0A6YYD4 124 aa12.02□□□□□ -0.49
HPS1-209ENST00000470095 A6NLC8 198 aa12.02□□□□□ -0.49
HPS1-209ENST00000470095 C3orf80F5H4A9 247 aa12.02□□□□□ -0.49
HPS1-209ENST00000470095 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP12.02□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms